MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7107 chromosome

Total Repeats: 411

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019676	ATTAAA	2	12	1510	1521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019676	TATTTA	2	12	27140	27151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019676	TCTGTA	2	12	71097	71108	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_019676	AATTAG	2	12	119254	119265	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019676	AACTAA	2	12	119320	119331	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_019676	AAAATT	2	12	133284	133295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019676	TAACAA	2	12	142016	142027	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019676	AACCCC	2	12	157067	157078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_019676	TTTATA	2	12	162457	162468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019676	TAGCAA	2	12	165102	165113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019676	AAAGTA	2	12	203448	203459	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019676	GTACCC	2	12	205371	205382	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_019676	TTTTAC	2	12	214684	214695	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_019676	ATTTAT	2	12	216255	216266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019676	CAATTG	2	12	285058	285069	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_019676	GCTTTA	2	12	326554	326565	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019676	CCGCTA	2	12	343933	343944	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019676	AAACAC	2	12	350774	350785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019676	CATCGT	2	12	358504	358515	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019676	TTTATT	2	12	364934	364945	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019676	ATGTAA	2	12	370305	370316	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019676	TGTCAT	2	12	377514	377525	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_019676	TTTTAC	2	12	378786	378797	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_019676	TTCAAC	2	12	391587	391598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019676	ATTCCT	2	12	392206	392217	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019676	CTCTAC	2	12	426316	426327	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_019676	TAAATA	2	12	426872	426883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019676	TTTTAC	2	12	434729	434740	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_019676	ATTGAA	2	12	438341	438352	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019676	TCATTA	2	12	470508	470519	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_019676	GCGTAG	2	12	471206	471217	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_019676	GCTAAG	2	12	473849	473860	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_019676	GTTTTA	2	12	479201	479212	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019676	CTACGC	2	12	479675	479686	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019676	TAATGA	2	12	480374	480385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019676	TTGAGT	2	12	483611	483622	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019676	AAGATA	2	12	500362	500373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019676	TAGCGG	2	12	506958	506969	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_019676	CGGGTA	2	12	544475	544486	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_019676	ACTTTC	2	12	545681	545692	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019676	TCGATG	2	12	575877	575888	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019676	CATACA	2	12	592786	592797	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019676	TATAAA	2	12	603060	603071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019676	CTATAT	2	12	610497	610508	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_019676	CCTTAA	2	12	651937	651948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019676	GGAGTG	2	12	656316	656327	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019676	TAGAAT	2	12	715399	715410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019676	AGAGAA	2	12	747557	747568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019676	AAATAA	2	12	764602	764613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019676	TCAAAC	2	12	769296	769307	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019676	AAGATA	2	12	775755	775766	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019676	ATTTCA	2	12	812291	812302	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_019676	TTTATA	2	12	814525	814536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019676	AGAAAC	2	12	816275	816286	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019676	TTATAA	2	12	824820	824831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019676	GTGATG	2	12	855209	855220	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019676	AAATTT	2	12	857584	857595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019676	GTAAGT	2	12	873374	873385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019676	GGTTAT	2	12	875800	875811	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019676	TCTCAA	2	12	875859	875870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019676	AGATTT	2	12	919100	919111	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019676	CAAGTA	2	12	920354	920365	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_019676	CAGTAA	2	12	920445	920456	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_019676	AAATTA	2	12	944364	944375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019676	TTTAAC	2	12	957308	957319	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_019676	TAGCAG	2	12	986031	986042	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_019676	CGAAAG	2	12	996498	996509	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_019676	GTTTAG	2	12	997534	997545	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019676	GAAATA	2	12	1025960	1025971	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019676	TATTTT	2	12	1035905	1035916	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019676	GCTATA	2	12	1039926	1039937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019676	TCATTC	2	12	1056957	1056968	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019676	ATAAAT	2	12	1085921	1085932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019676	GCCTAC	2	12	1104180	1104191	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_019676	AGACTT	2	12	1129469	1129480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_019676	TACTAA	2	12	1154006	1154017	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019676	TAGATT	2	12	1164072	1164083	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019676	TGTATT	2	12	1166812	1166823	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019676	TAAATA	2	12	1175088	1175099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019676	TTGTAG	2	12	1191609	1191620	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019676	TTTTAC	2	12	1208597	1208608	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_019676	AAAGCA	2	12	1215480	1215491	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019676	TGTTCT	2	12	1218607	1218618	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_019676	TGTTCT	2	12	1218649	1218660	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_019676	GCGTAG	2	12	1220444	1220455	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_019676	AGTCAA	2	12	1229396	1229407	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_019676	GAAACA	2	12	1237527	1237538	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019676	ACTTAA	2	12	1250065	1250076	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019676	CAATAT	2	12	1262197	1262208	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_019676	TGTTAA	2	12	1272208	1272219	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019676	GTTTAA	2	12	1284706	1284717	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019676	CAGTAT	2	12	1293916	1293927	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_019676	ATTTTT	2	12	1325759	1325770	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019676	TGCTGT	2	12	1340801	1340812	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_019676	ATTTGA	2	12	1361212	1361223	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019676	ATTTTT	2	12	1364436	1364447	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019676	ATTTTC	2	12	1376312	1376323	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019676	TAGAAT	2	12	1394742	1394753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019676	TACCCC	2	12	1429011	1429022	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019676	GCTATA	2	12	1453617	1453628	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_019676	ATTTAA	2	12	1488195	1488206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019676	AAGTAA	2	12	1501513	1501524	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019676	AAAATT	2	12	1512692	1512703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019676	AAAATT	2	12	1531460	1531471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019676	TTTATG	2	12	1558665	1558676	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019676	TTAATT	2	12	1566090	1566101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019676	ATTTAA	2	12	1566102	1566113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019676	AAAACA	2	12	1567625	1567636	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_019676	TGAAAT	2	12	1583470	1583481	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019676	AACTAT	2	12	1583989	1584000	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_019676	CAGAAG	2	12	1584308	1584319	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019676	TATAAA	2	12	1599137	1599148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019676	TAGCGA	2	12	1600304	1600315	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_019676	ACCTAT	2	12	1604435	1604446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019676	ACACCC	2	12	1629372	1629383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_019676	CTATAC	2	12	1641863	1641874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019676	GCTTTT	2	12	1650004	1650015	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_019676	TTTGAT	2	12	1659559	1659570	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019676	ATCGGC	2	12	1662661	1662672	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019676	TAGTAT	2	12	1680670	1680681	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019676	GTAAAA	2	12	1705956	1705967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019676	TTATAA	2	12	1706862	1706873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019676	TACTAA	2	12	1731807	1731818	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_019676	TCACTC	2	12	1732543	1732554	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019676	GACAAA	2	12	1770822	1770833	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_019676	TCAAAA	2	12	1804443	1804454	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_019676	GAAGTA	2	12	1825215	1825226	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019676	AGAGGA	2	12	1833336	1833347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019676	CTTAAG	2	12	1876145	1876156	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_019676	AACCTT	2	12	1876386	1876397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019676	TTTTTA	2	12	1902063	1902074	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019676	TGCGTC	2	12	1911537	1911548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019676	CTTTTA	2	12	1914780	1914791	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_019676	TTAAAA	2	12	1918706	1918717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_019676	AAAATA	2	12	2016914	2016925	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_019676	TATAGA	2	12	2069638	2069649	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_019676	TAAAAT	2	12	2131513	2131524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_019676	CCGATG	2	12	3786714	3786725	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_019676	ATAAAG	2	12	3802214	3802225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
251	NC_019676	AACCCA	2	12	3825389	3825400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
252	NC_019676	GGGGTA	2	12	3830503	3830514	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.