MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc sp. PCC 7107 chromosome

Total Repeats: 1077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019676	TTAAG	2	10	1489	1498	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019676	AATTT	2	10	8208	8217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019676	TTACT	2	10	18112	18121	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_019676	GATAT	2	10	29154	29163	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019676	TTTAG	2	10	33563	33572	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019676	TCTTA	2	10	41976	41985	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_019676	CTGTT	2	10	54019	54028	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_019676	TTTGG	2	10	66830	66839	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019676	AAAGT	2	10	71224	71233	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019676	TTTGC	2	10	75563	75572	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019676	CTTCC	2	10	76446	76455	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_019676	CGCTG	2	10	83842	83851	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_019676	CTGAA	2	10	90749	90758	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019676	GAATT	2	10	97600	97609	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019676	AGTTA	2	10	101130	101139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019676	GTGAA	2	10	104455	104464	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019676	TTTAA	2	10	120078	120087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019676	TTGAA	2	10	141814	141823	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019676	AATTC	2	10	141825	141834	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019676	TTTCA	2	10	141915	141924	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_019676	TTAAG	2	10	147661	147670	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019676	GTGTT	2	10	164935	164944	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019676	TTACT	2	10	173587	173596	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_019676	AATTA	2	10	198533	198542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019676	ATTTT	2	10	200196	200205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019676	TAGAT	2	10	201570	201579	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019676	GCGAA	2	10	201600	201609	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_019676	GAACC	2	10	201619	201628	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_019676	TCGTG	2	10	202758	202767	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019676	TGGTT	2	10	203338	203347	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019676	GCGGA	2	10	206484	206493	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_019676	AGCCG	2	10	206619	206628	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_019676	TTATT	2	10	207093	207102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019676	GGAGA	2	10	207569	207578	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019676	AATCT	2	10	223281	223290	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_019676	TTGCT	2	10	223296	223305	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_019676	TATTT	2	10	229952	229961	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019676	ATTTG	2	10	239155	239164	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019676	TCACA	2	10	240392	240401	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_019676	TCGCT	2	10	261168	261177	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_019676	TTGAT	2	10	273217	273226	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019676	TGTTA	2	10	273298	273307	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019676	TTTGC	2	10	278465	278474	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_019676	TTTAT	2	10	279290	279299	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019676	ATAAA	2	10	285192	285201	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019676	TAGGT	2	10	296731	296740	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019676	TTTAG	2	10	296876	296885	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019676	TAATT	2	10	300765	300774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019676	TTCTC	2	10	317713	317722	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_019676	TAATT	2	10	321682	321691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019676	TAATT	2	10	327614	327623	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019676	AAACT	2	10	333265	333274	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_019676	AAGGG	2	10	336319	336328	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019676	AGTTA	2	10	341764	341773	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019676	ACCAA	2	10	342028	342037	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_019676	GTTAA	2	10	342597	342606	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019676	TAATC	2	10	344588	344597	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_019676	TCTTT	2	10	345508	345517	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_019676	AAATT	2	10	347320	347329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019676	ATTCT	2	10	347389	347398	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019676	AATCC	2	10	350400	350409	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_019676	TGCCT	2	10	362114	362123	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_019676	CTATG	2	10	362434	362443	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_019676	GTTAT	2	10	388394	388403	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019676	ATTTA	2	10	391906	391915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019676	TTTAC	2	10	399941	399950	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019676	TAAAA	2	10	402697	402706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019676	ATCAA	2	10	403211	403220	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_019676	ATTTC	2	10	420879	420888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_019676	CAATT	2	10	429616	429625	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_019676	AATTG	2	10	429638	429647	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019676	AATTG	2	10	429680	429689	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019676	AATTG	2	10	429722	429731	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019676	TTTAC	2	10	436454	436463	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019676	GAAAA	2	10	438417	438426	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019676	GATTT	2	10	445507	445516	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019676	TTTAA	2	10	452732	452741	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019676	TTAAT	2	10	456167	456176	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019676	CAATT	2	10	469441	469450	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_019676	CTCAT	2	10	469515	469524	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_019676	TTTGG	2	10	470050	470059	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019676	GTTAG	2	10	470470	470479	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019676	TCAAA	2	10	475484	475493	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_019676	TTAAT	2	10	475696	475705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019676	GATGG	2	10	479140	479149	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019676	CTAAC	2	10	480414	480423	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_019676	CCAAA	2	10	480835	480844	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_019676	TTAAT	2	10	489411	489420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019676	CGCAG	2	10	496648	496657	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_019676	CGCCA	2	10	505894	505903	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_019676	ATAAA	2	10	516705	516714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019676	TCCCA	2	10	516850	516859	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_019676	AACCC	2	10	517277	517286	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_019676	ACTTT	2	10	517931	517940	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_019676	AGTTG	2	10	521137	521146	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019676	TAACC	2	10	527856	527865	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_019676	CGGCT	2	10	543232	543241	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_019676	TCCGC	2	10	543367	543376	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_019676	AACCA	2	10	546513	546522	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_019676	CACGA	2	10	547093	547102	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_019676	GGTTC	2	10	548230	548239	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_019676	GCTTC	2	10	548247	548256	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_019676	ATCTA	2	10	548279	548288	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_019676	CTCTC	2	10	548294	548303	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
105	NC_019676	AATCC	2	10	551384	551393	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_019676	AGTTG	2	10	557027	557036	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019676	CGCAG	2	10	557235	557244	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_019676	TTAAT	2	10	565952	565961	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019676	CAATC	2	10	579116	579125	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_019676	ATAAA	2	10	583397	583406	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019676	ATTTA	2	10	584530	584539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019676	TAATT	2	10	584544	584553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019676	AGTGC	2	10	591565	591574	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019676	AGTTT	2	10	592198	592207	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019676	CAACC	2	10	592696	592705	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_019676	AGGCA	2	10	597074	597083	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_019676	AATTT	2	10	607780	607789	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019676	AAATT	2	10	618752	618761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019676	CACAT	2	10	628650	628659	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_019676	CAAAG	2	10	630347	630356	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_019676	GTGGC	2	10	643064	643073	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_019676	TAATT	2	10	664853	664862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019676	TGCGT	2	10	680862	680871	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_019676	ATTAA	2	10	681588	681597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019676	ACATA	2	10	694886	694895	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_019676	AAAAT	2	10	695196	695205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019676	GTTCC	2	10	716775	716784	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_019676	TTAAA	2	10	720074	720083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019676	TTCAT	2	10	747933	747942	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_019676	TAAAA	2	10	750648	750657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019676	AGATT	2	10	751128	751137	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019676	ATTAA	2	10	791315	791324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019676	TGTGT	2	10	794104	794113	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019676	TCTTT	2	10	795019	795028	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_019676	TCTAT	2	10	802042	802051	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_019676	TGCCT	2	10	805008	805017	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_019676	TAACC	2	10	807902	807911	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_019676	TGAGT	2	10	808810	808819	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019676	TAAGT	2	10	824739	824748	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019676	AAAAT	2	10	836067	836076	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019676	TTCCG	2	10	855272	855281	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_019676	CAAAA	2	10	859078	859087	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_019676	TCTAA	2	10	868273	868282	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_019676	CCAGA	2	10	876131	876140	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_019676	ATTTA	2	10	882184	882193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019676	TTGTT	3	15	890370	890384	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019676	TCGGC	2	10	890999	891008	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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