MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nocardia brasiliensis ATCC 700358 chromosome

Total Repeats: 25146

< Previous12...39404142434445464748495051Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_018681	CG	3	6	9411323	9411328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25002	NC_018681	CGC	2	6	9411338	9411343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25003	NC_018681	GCC	2	6	9411365	9411370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25004	NC_018681	GCG	2	6	9411374	9411379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25005	NC_018681	TCC	2	6	9414546	9414551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25006	NC_018681	CCCG	2	8	9414564	9414571	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25007	NC_018681	GGA	2	6	9414642	9414647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25008	NC_018681	GCA	2	6	9414664	9414669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25009	NC_018681	GTG	2	6	9414678	9414683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25010	NC_018681	AGG	2	6	9414702	9414707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25011	NC_018681	ACCG	2	8	9414739	9414746	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25012	NC_018681	CCG	2	6	9414764	9414769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25013	NC_018681	GCA	2	6	9414798	9414803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25014	NC_018681	TCG	2	6	9414808	9414813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25015	NC_018681	AGG	2	6	9414847	9414852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25016	NC_018681	ATG	2	6	9414854	9414859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25017	NC_018681	CGA	2	6	9414862	9414867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25018	NC_018681	CGATC	2	10	9414890	9414899	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25019	NC_018681	AGGCGG	2	12	9414960	9414971	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
25020	NC_018681	ACG	2	6	9414999	9415004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25021	NC_018681	CGC	3	9	9415008	9415016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25022	NC_018681	GTC	2	6	9415032	9415037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25023	NC_018681	CCG	2	6	9415046	9415051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25024	NC_018681	CCG	2	6	9415061	9415066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25025	NC_018681	GCC	2	6	9415078	9415083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25026	NC_018681	CCG	2	6	9415100	9415105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25027	NC_018681	GCCCGC	2	12	9415120	9415131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25028	NC_018681	GCA	2	6	9415162	9415167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25029	NC_018681	CCGC	2	8	9415172	9415179	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25030	NC_018681	GCA	2	6	9415186	9415191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25031	NC_018681	CCG	2	6	9415223	9415228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25032	NC_018681	CAC	2	6	9415278	9415283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25033	NC_018681	GCCG	2	8	9415306	9415313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25034	NC_018681	CGC	2	6	9415314	9415319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25035	NC_018681	GCC	2	6	9415376	9415381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25036	NC_018681	CG	3	6	9415384	9415389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25037	NC_018681	GC	3	6	9415401	9415406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25038	NC_018681	GGT	2	6	9415436	9415441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25039	NC_018681	GCC	3	9	9415462	9415470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25040	NC_018681	CGC	3	9	9415509	9415517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25041	NC_018681	GCC	3	9	9415518	9415526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25042	NC_018681	CGC	2	6	9419348	9419353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25043	NC_018681	GCGCC	2	10	9419373	9419382	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25044	NC_018681	CG	3	6	9419395	9419400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25045	NC_018681	TGC	2	6	9419429	9419434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25046	NC_018681	TGC	2	6	9419512	9419517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25047	NC_018681	CCA	2	6	9421240	9421245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25048	NC_018681	TGT	2	6	9421270	9421275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25049	NC_018681	CGTC	2	8	9421285	9421292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25050	NC_018681	GTC	2	6	9422759	9422764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25051	NC_018681	CGAC	2	8	9422770	9422777	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25052	NC_018681	GGAA	2	8	9422896	9422903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25053	NC_018681	ACA	2	6	9424123	9424128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25054	NC_018681	CGCCT	2	10	9424951	9424960	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25055	NC_018681	GC	3	6	9424985	9424990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25056	NC_018681	GCTGT	2	10	9425078	9425087	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25057	NC_018681	ATC	2	6	9425120	9425125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25058	NC_018681	CGT	2	6	9425126	9425131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25059	NC_018681	CTT	2	6	9426199	9426204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25060	NC_018681	CCA	2	6	9426244	9426249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25061	NC_018681	CG	3	6	9427243	9427248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25062	NC_018681	TCA	2	6	9427349	9427354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25063	NC_018681	ATG	2	6	9427377	9427382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25064	NC_018681	CGC	2	6	9427425	9427430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25065	NC_018681	TCC	2	6	9427444	9427449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25066	NC_018681	TGC	2	6	9427716	9427721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25067	NC_018681	CGT	2	6	9427723	9427728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25068	NC_018681	CCA	2	6	9427729	9427734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25069	NC_018681	CAG	2	6	9427776	9427781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25070	NC_018681	GACA	2	8	9427837	9427844	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25071	NC_018681	TCCC	2	8	9427848	9427855	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25072	NC_018681	GGT	2	6	9427858	9427863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25073	NC_018681	GTCGC	2	10	9427873	9427882	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25074	NC_018681	GTCGC	2	10	9427886	9427895	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25075	NC_018681	CG	3	6	9428057	9428062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25076	NC_018681	GGT	2	6	9428063	9428068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25077	NC_018681	CGGG	2	8	9428120	9428127	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25078	NC_018681	GGGT	2	8	9428155	9428162	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25079	NC_018681	CGG	2	6	9428204	9428209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25080	NC_018681	GAGCA	2	10	9428318	9428327	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25081	NC_018681	GCG	2	6	9428354	9428359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25082	NC_018681	CG	3	6	9428369	9428374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25083	NC_018681	GCG	2	6	9428430	9428435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25084	NC_018681	TG	3	6	9428484	9428489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25085	NC_018681	AGCG	2	8	9428508	9428515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25086	NC_018681	CGA	2	6	9428543	9428548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25087	NC_018681	GCC	2	6	9428561	9428566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25088	NC_018681	CCAG	2	8	9428627	9428634	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25089	NC_018681	CCCAA	2	10	9428662	9428671	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
25090	NC_018681	CGA	2	6	9428716	9428721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25091	NC_018681	GGT	2	6	9428753	9428758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25092	NC_018681	CCGG	2	8	9428782	9428789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25093	NC_018681	CATC	2	8	9428947	9428954	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25094	NC_018681	CG	3	6	9428966	9428971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25095	NC_018681	CGA	2	6	9429021	9429026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25096	NC_018681	CTC	2	6	9429034	9429039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25097	NC_018681	CGGG	2	8	9429143	9429150	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25098	NC_018681	GGAT	3	12	9429151	9429162	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25099	NC_018681	C	6	6	9429238	9429243	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25100	NC_018681	CGC	2	6	9429256	9429261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25101	NC_018681	CGG	2	6	9429298	9429303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25102	NC_018681	AGC	2	6	9429325	9429330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25103	NC_018681	CGC	2	6	9429382	9429387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25104	NC_018681	CTC	2	6	9429407	9429412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25105	NC_018681	TTC	2	6	9429466	9429471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25106	NC_018681	ACG	2	6	9429476	9429481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25107	NC_018681	GTCC	2	8	9429522	9429529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25108	NC_018681	GAC	2	6	9429577	9429582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25109	NC_018681	AGC	2	6	9429620	9429625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25110	NC_018681	GCGA	2	8	9429693	9429700	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25111	NC_018681	GGC	2	6	9429721	9429726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25112	NC_018681	GTC	2	6	9429770	9429775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25113	NC_018681	CCG	2	6	9429863	9429868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25114	NC_018681	CTCGC	2	10	9429986	9429995	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25115	NC_018681	CGC	2	6	9430042	9430047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25116	NC_018681	CGC	2	6	9430049	9430054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25117	NC_018681	CGC	2	6	9430056	9430061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25118	NC_018681	TCG	3	9	9430124	9430132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25119	NC_018681	CGC	2	6	9430147	9430152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25120	NC_018681	CGC	2	6	9430178	9430183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25121	NC_018681	TCG	2	6	9430200	9430205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25122	NC_018681	GCC	2	6	9430216	9430221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25123	NC_018681	GCG	2	6	9430236	9430241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25124	NC_018681	CG	3	6	9430449	9430454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25125	NC_018681	CG	3	6	9430510	9430515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25126	NC_018681	TTC	2	6	9430616	9430621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25127	NC_018681	CTG	2	6	9430675	9430680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25128	NC_018681	GGA	2	6	9430738	9430743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25129	NC_018681	CGA	2	6	9431998	9432003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25130	NC_018681	CCG	2	6	9432011	9432016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25131	NC_018681	ACC	3	9	9432906	9432914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25132	NC_018681	TCA	2	6	9433545	9433550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25133	NC_018681	CGC	2	6	9433566	9433571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25134	NC_018681	GTG	2	6	9433603	9433608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25135	NC_018681	GCC	2	6	9433609	9433614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25136	NC_018681	CCA	2	6	9435392	9435397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25137	NC_018681	GAT	2	6	9435488	9435493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25138	NC_018681	CGAG	2	8	9435530	9435537	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25139	NC_018681	CTC	2	6	9435692	9435697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25140	NC_018681	TCA	2	6	9435771	9435776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25141	NC_018681	GTCG	2	8	9435801	9435808	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25142	NC_018681	CCA	2	6	9436035	9436040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25143	NC_018681	TG	3	6	9436147	9436152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25144	NC_018681	CGC	3	9	9436196	9436204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25145	NC_018681	GTC	2	6	9436278	9436283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25146	NC_018681	GGA	2	6	9436337	9436342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...39404142434445464748495051Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.