MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nocardiopsis alba ATCC BAA-2165 chromosome

Total Repeats: 18516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018524	GAGG	2	8	433171	433178	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_018524	GGT	2	6	433186	433191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_018524	ACCCGG	2	12	434150	434161	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_018524	CCT	2	6	434247	434252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_018524	CCATG	2	10	434253	434262	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1506	NC_018524	GC	3	6	434266	434271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_018524	CG	3	6	434688	434693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_018524	ACG	2	6	435205	435210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_018524	TCG	2	6	435252	435257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_018524	CCT	2	6	435291	435296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_018524	CCATG	2	10	435297	435306	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1512	NC_018524	GC	3	6	435310	435315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_018524	CGT	2	6	435864	435869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_018524	TCT	2	6	436490	436495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_018524	AAT	2	6	436500	436505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_018524	CA	3	6	436510	436515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_018524	CGAC	2	8	436548	436555	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_018524	CGC	2	6	438438	438443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_018524	GCC	2	6	438445	438450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_018524	GAC	2	6	439710	439715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_018524	GTC	2	6	439751	439756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_018524	GGC	2	6	442850	442855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_018524	GGTCAG	2	12	442856	442867	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1524	NC_018524	GGC	2	6	442874	442879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_018524	GCCGC	2	10	442884	442893	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1526	NC_018524	CG	3	6	442895	442900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_018524	CAG	2	6	442901	442906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_018524	GC	3	6	442966	442971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_018524	ACA	2	6	443058	443063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_018524	GGCCC	2	10	443096	443105	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1531	NC_018524	CGCA	2	8	444178	444185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_018524	AC	3	6	444189	444194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_018524	GAG	2	6	444205	444210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_018524	C	6	6	444211	444216	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1535	NC_018524	GGA	2	6	445887	445892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_018524	CCT	2	6	445911	445916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_018524	CG	4	8	447111	447118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_018524	TCC	2	6	447330	447335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_018524	TCCC	2	8	447398	447405	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1540	NC_018524	TCC	2	6	447424	447429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_018524	GCC	2	6	447445	447450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1542	NC_018524	CAC	2	6	447480	447485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_018524	GATC	2	8	447600	447607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_018524	GGCC	2	8	447654	447661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_018524	CCG	2	6	447675	447680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_018524	CGT	2	6	447708	447713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_018524	CG	3	6	447732	447737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_018524	CGT	2	6	447746	447751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_018524	GCC	2	6	447843	447848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_018524	TCC	2	6	447934	447939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_018524	CGG	2	6	447978	447983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_018524	AGG	2	6	447997	448002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_018524	CCG	2	6	448508	448513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_018524	GGACG	2	10	448520	448529	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1555	NC_018524	TCG	2	6	449043	449048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_018524	GAA	2	6	449373	449378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_018524	TA	3	6	449419	449424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_018524	CCT	2	6	449454	449459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_018524	CCATG	2	10	449460	449469	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1560	NC_018524	GC	3	6	449473	449478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_018524	TCG	2	6	449563	449568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_018524	ACG	2	6	449571	449576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_018524	GTG	2	6	450202	450207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_018524	TCC	2	6	450216	450221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_018524	GGC	2	6	450222	450227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_018524	TGCT	2	8	450647	450654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_018524	CGG	2	6	450678	450683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_018524	CGGAG	2	10	451304	451313	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1569	NC_018524	CG	3	6	451323	451328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_018524	C	6	6	451335	451340	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1571	NC_018524	GAG	2	6	451450	451455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_018524	CCG	2	6	451500	451505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_018524	CTTC	2	8	451507	451514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_018524	CA	3	6	451532	451537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_018524	CGA	2	6	451615	451620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_018524	TTCG	2	8	451623	451630	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_018524	TAG	2	6	452598	452603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_018524	TAA	2	6	452707	452712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_018524	A	6	6	452717	452722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_018524	CG	3	6	452743	452748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_018524	GA	3	6	452760	452765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_018524	CCAGC	2	10	452780	452789	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1583	NC_018524	CGC	2	6	452880	452885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_018524	GT	3	6	453007	453012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_018524	GTG	2	6	453200	453205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_018524	AGC	2	6	453405	453410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_018524	GAAG	2	8	453463	453470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_018524	TGG	2	6	453649	453654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_018524	CAA	2	6	453655	453660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_018524	ACA	2	6	453684	453689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_018524	G	6	6	453693	453698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_018524	CCGGGA	2	12	453734	453745	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_018524	CGG	2	6	453765	453770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_018524	GGT	2	6	453797	453802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_018524	CAA	2	6	453808	453813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_018524	CCA	2	6	453828	453833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1597	NC_018524	ACC	2	6	453839	453844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_018524	CGC	2	6	453880	453885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_018524	CGA	2	6	453931	453936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_018524	GTA	2	6	453953	453958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_018524	TTG	2	6	453960	453965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_018524	TTC	2	6	454149	454154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_018524	GT	3	6	454168	454173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_018524	GAT	2	6	454193	454198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_018524	TTC	2	6	454202	454207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_018524	CCTA	2	8	454238	454245	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_018524	TAGG	2	8	454274	454281	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_018524	CCTA	2	8	454298	454305	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_018524	TTG	2	6	454328	454333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_018524	CTAA	2	8	454342	454349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_018524	A	6	6	454348	454353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_018524	GTT	2	6	454366	454371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_018524	GTAG	2	8	454394	454401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_018524	TTGA	2	8	456686	456693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_018524	TTCCT	2	10	456706	456715	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1616	NC_018524	TGC	2	6	456720	456725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_018524	CACG	2	8	456739	456746	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1618	NC_018524	CAG	2	6	456768	456773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_018524	TGT	2	6	456844	456849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_018524	C	6	6	456903	456908	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1621	NC_018524	ACC	2	6	456982	456987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_018524	AGC	2	6	456988	456993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_018524	CGTT	2	8	457037	457044	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_018524	CGA	2	6	457131	457136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_018524	AGC	2	6	457207	457212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_018524	GTG	2	6	457228	457233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_018524	CCA	2	6	457241	457246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_018524	CGACT	2	10	457275	457284	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1629	NC_018524	CCT	2	6	457333	457338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_018524	GCTT	2	8	457368	457375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_018524	CGAC	2	8	457474	457481	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_018524	AAG	2	6	457542	457547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_018524	CA	3	6	457576	457581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_018524	CCA	2	6	457620	457625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_018524	GCG	2	6	457647	457652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_018524	CGA	2	6	457807	457812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_018524	CGATT	2	10	457885	457894	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1638	NC_018524	CACCC	2	10	457907	457916	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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1640	NC_018524	ATC	3	9	457937	457945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1645	NC_018524	TGG	2	6	458401	458406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1652	NC_018524	TG	3	6	458940	458945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1672	NC_018524	GGA	2	6	460445	460450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1682	NC_018524	TGG	2	6	460750	460755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1757	NC_018524	GC	3	6	481447	481452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1764	NC_018524	GGT	2	6	485735	485740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1766	NC_018524	CCG	2	6	485834	485839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1767	NC_018524	CAC	2	6	485892	485897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1768	NC_018524	A	7	7	485917	485923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1769	NC_018524	GGC	2	6	486030	486035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1770	NC_018524	GC	4	8	486062	486069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1771	NC_018524	CGG	2	6	488224	488229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_018524	GC	3	6	546924	546929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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