MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 6758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018224	TTC	2	6	37	42	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018224	TCA	2	6	88	93	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018224	CCA	2	6	112	117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_018224	GTG	2	6	288	293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018224	TCC	2	6	358	363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018224	TCC	2	6	399	404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_018224	AGG	2	6	411	416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018224	TAC	2	6	754	759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018224	TCC	2	6	946	951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018224	ACC	2	6	963	968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_018224	CGG	2	6	1048	1053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018224	CCT	2	6	1061	1066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_018224	TCA	2	6	1086	1091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018224	CTC	2	6	1160	1165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018224	GGT	2	6	1392	1397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018224	AAT	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018224	TCA	2	6	1559	1564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018224	TGC	2	6	1569	1574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018224	CGG	2	6	1586	1591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018224	ACC	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018224	CTG	2	6	1715	1720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018224	CCG	2	6	2382	2387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_018224	ACG	2	6	2424	2429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018224	CGT	2	6	2449	2454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018224	GCG	2	6	2471	2476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018224	ATG	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018224	GGC	2	6	2591	2596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018224	CGT	2	6	2605	2610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018224	TCG	2	6	2702	2707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018224	TAA	2	6	2720	2725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018224	GCT	2	6	2734	2739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018224	TCG	2	6	3645	3650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018224	ACG	2	6	9497	9502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018224	TCG	2	6	22017	22022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018224	GCT	2	6	22027	22032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018224	CAC	2	6	22067	22072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_018224	TAT	2	6	22101	22106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018224	CGC	2	6	22131	22136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_018224	CAG	2	6	22156	22161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018224	CCT	2	6	22245	22250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018224	CCG	2	6	22254	22259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_018224	CGG	2	6	22314	22319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018224	CAA	2	6	23333	23338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018224	ACC	2	6	28727	28732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_018224	GCC	2	6	28769	28774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018224	CGA	2	6	28785	28790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018224	GTT	2	6	30558	30563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018224	CCT	2	6	31654	31659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_018224	CGA	3	9	32276	32284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018224	TCG	3	9	32329	32337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018224	TCG	2	6	32350	32355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018224	CTC	2	6	34666	34671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_018224	ATT	2	6	34761	34766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018224	ACA	2	6	34970	34975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018224	GAA	2	6	35043	35048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018224	TTC	2	6	35053	35058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018224	CGA	2	6	39940	39945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018224	GTC	2	6	39998	40003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018224	ACG	2	6	40158	40163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018224	GGA	2	6	40237	40242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018224	ATA	2	6	43472	43477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018224	ATT	2	6	43489	43494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018224	AAT	2	6	43503	43508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018224	TTA	2	6	45056	45061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018224	TTA	2	6	45083	45088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018224	CCG	2	6	45441	45446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018224	CAG	2	6	48743	48748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018224	GGA	2	6	48804	48809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018224	GCC	2	6	48827	48832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018224	CGC	2	6	49449	49454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_018224	CCG	2	6	49455	49460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018224	AGC	2	6	52559	52564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018224	CAC	2	6	52575	52580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_018224	CGA	2	6	52598	52603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018224	CGA	2	6	53397	53402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018224	CTC	2	6	53477	53482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_018224	CAG	2	6	53579	53584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018224	GAC	2	6	53640	53645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018224	TGT	2	6	54171	54176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018224	TAA	2	6	54182	54187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018224	GAA	2	6	54275	54280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018224	GAC	2	6	54291	54296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018224	CGA	2	6	54303	54308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018224	CGT	2	6	54385	54390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018224	CGT	2	6	55056	55061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018224	CAC	2	6	55767	55772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_018224	CGA	2	6	56151	56156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018224	GCC	2	6	56203	56208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_018224	GGT	2	6	56265	56270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018224	TCG	2	6	56758	56763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018224	GTG	2	6	56764	56769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018224	AGT	2	6	56780	56785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018224	GTG	2	6	56812	56817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018224	GCA	2	6	57990	57995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018224	CGG	2	6	58005	58010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018224	CGG	2	6	58022	58027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018224	CCG	2	6	58863	58868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_018224	TCG	2	6	58919	58924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018224	GTC	2	6	58950	58955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018224	GGC	2	6	58956	58961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018224	GCA	2	6	59013	59018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018224	CGG	2	6	59085	59090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018224	GTC	2	6	59359	59364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018224	GGC	2	6	59449	59454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018224	GCG	2	6	59474	59479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018224	ACC	3	9	59644	59652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_018224	CGA	2	6	59968	59973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018224	TAT	2	6	59979	59984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018224	GCG	2	6	60880	60885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018224	GCC	2	6	62061	62066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_018224	GAC	2	6	62067	62072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018224	ACG	2	6	62114	62119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018224	CCG	2	6	63313	63318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_018224	CGC	2	6	63380	63385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_018224	TCG	2	6	63389	63394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018224	GGC	2	6	65087	65092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018224	CGT	2	6	66845	66850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018224	CGG	2	6	73174	73179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018224	CCG	2	6	73180	73185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_018224	GAC	2	6	73206	73211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018224	TCG	2	6	73584	73589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018224	CCG	2	6	73666	73671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_018224	GTC	2	6	74049	74054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018224	GTC	2	6	74081	74086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018224	AAT	2	6	74156	74161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018224	TGG	2	6	74173	74178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018224	AGG	2	6	74190	74195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018224	CGG	2	6	74229	74234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018224	GAT	2	6	74255	74260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018224	CGC	2	6	74404	74409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_018224	CGA	2	6	74419	74424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018224	CGG	2	6	74505	74510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018224	CGA	2	6	75345	75350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018224	GCG	2	6	76593	76598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018224	ATT	2	6	76658	76663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018224	GAT	2	6	76671	76676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018224	ACC	2	6	78302	78307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_018224	TTC	2	6	78357	78362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018224	CCA	2	6	78385	78390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_018224	TCC	3	9	78426	78434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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