MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 10981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018224	CGA	3	9	1201494	1201502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_018224	GTT	2	6	1209979	1209984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_018224	ATT	2	6	1210062	1210067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_018224	AT	3	6	1210072	1210077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_018224	GCC	2	6	1210124	1210129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_018224	CGA	2	6	1211482	1211487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_018224	GCG	2	6	1211491	1211496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_018224	GTC	2	6	1211541	1211546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_018224	CTG	2	6	1212672	1212677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_018224	GT	3	6	1212701	1212706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_018224	TCG	2	6	1214767	1214772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_018224	GTC	2	6	1214791	1214796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_018224	CG	3	6	1215121	1215126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_018224	GAC	2	6	1215129	1215134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_018224	TG	3	6	1215177	1215182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_018224	CCG	3	9	1216638	1216646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_018224	CGGA	2	8	1217130	1217137	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_018224	CGAG	2	8	1217190	1217197	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_018224	GCG	2	6	1217208	1217213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_018224	TGG	3	9	1217244	1217252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_018224	GCC	2	6	1218495	1218500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_018224	TAT	2	6	1218664	1218669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_018224	A	6	6	1218670	1218675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_018224	ACG	2	6	1218693	1218698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_018224	GAG	2	6	1221206	1221211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_018224	GCT	2	6	1221302	1221307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_018224	CTC	2	6	1221315	1221320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_018224	CGGTAC	2	12	1221341	1221352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_018224	CGG	2	6	1221378	1221383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_018224	CCA	2	6	1221958	1221963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_018224	TCAC	2	8	1221986	1221993	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_018224	TAACTT	2	12	1221997	1222008	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3533	NC_018224	GTCG	2	8	1222023	1222030	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_018224	CGC	2	6	1222036	1222041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_018224	TCG	2	6	1222222	1222227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_018224	CGG	2	6	1222255	1222260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_018224	TG	3	6	1222452	1222457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_018224	GT	3	6	1222477	1222482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_018224	GCC	2	6	1222530	1222535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_018224	CGG	2	6	1222544	1222549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_018224	GCC	2	6	1222558	1222563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_018224	CCCG	2	8	1222578	1222585	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3543	NC_018224	CAT	2	6	1222588	1222593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_018224	GC	4	8	1222644	1222651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3545	NC_018224	CG	3	6	1222709	1222714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_018224	ATCG	2	8	1222723	1222730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3547	NC_018224	CGT	2	6	1222848	1222853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_018224	GGC	2	6	1222864	1222869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_018224	TGG	2	6	1222934	1222939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_018224	GTG	2	6	1222951	1222956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_018224	CCG	2	6	1222963	1222968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_018224	CAC	2	6	1223426	1223431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_018224	CGA	2	6	1223449	1223454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_018224	GACG	2	8	1223458	1223465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_018224	GTC	2	6	1223480	1223485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_018224	CTC	2	6	1225819	1225824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_018224	ATCGG	2	10	1225827	1225836	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3558	NC_018224	CCCG	2	8	1225919	1225926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3559	NC_018224	TGAC	2	8	1225954	1225961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_018224	CGA	2	6	1225985	1225990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_018224	CGC	2	6	1226008	1226013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_018224	CGT	2	6	1226038	1226043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_018224	CGA	2	6	1226054	1226059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_018224	CGAC	2	8	1226171	1226178	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_018224	GCG	2	6	1226239	1226244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_018224	GGC	2	6	1226250	1226255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_018224	CGGA	2	8	1226263	1226270	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3568	NC_018224	TCGA	2	8	1231726	1231733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3569	NC_018224	TG	3	6	1232028	1232033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_018224	TCGT	2	8	1232050	1232057	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_018224	GTC	2	6	1233269	1233274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_018224	GGT	2	6	1234369	1234374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_018224	CGGC	2	8	1234398	1234405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3574	NC_018224	CGG	2	6	1237461	1237466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_018224	TCG	2	6	1237483	1237488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_018224	CCCG	2	8	1237494	1237501	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3577	NC_018224	GCC	2	6	1237527	1237532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_018224	ACCA	2	8	1238754	1238761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_018224	TCC	2	6	1238779	1238784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_018224	GAGC	2	8	1238785	1238792	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_018224	GTG	2	6	1241789	1241794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_018224	CGGA	2	8	1241805	1241812	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3583	NC_018224	CCGA	2	8	1241841	1241848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_018224	GCG	2	6	1243309	1243314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_018224	CGAA	2	8	1243339	1243346	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3586	NC_018224	CG	3	6	1243388	1243393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_018224	GCCG	2	8	1243398	1243405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_018224	CGA	2	6	1243474	1243479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_018224	GTG	2	6	1243520	1243525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_018224	GCT	2	6	1245348	1245353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_018224	CTG	2	6	1245358	1245363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_018224	CG	3	6	1245402	1245407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_018224	CTC	2	6	1245507	1245512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_018224	GGT	2	6	1245578	1245583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_018224	AT	3	6	1245816	1245821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_018224	TG	3	6	1245859	1245864	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_018224	CGG	2	6	1245943	1245948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_018224	GCC	2	6	1245954	1245959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_018224	TCGC	3	12	1245970	1245981	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_018224	TG	4	8	1246848	1246855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_018224	CGAT	2	8	1246877	1246884	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_018224	CGC	2	6	1247430	1247435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_018224	TCG	2	6	1249596	1249601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_018224	TGTT	2	8	1249603	1249610	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_018224	CG	3	6	1249777	1249782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_018224	GC	3	6	1249817	1249822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_018224	CGG	2	6	1249828	1249833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_018224	GGCGA	2	10	1249842	1249851	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3609	NC_018224	GAG	2	6	1251324	1251329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_018224	CGAG	2	8	1252978	1252985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_018224	AG	3	6	1253016	1253021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_018224	ACG	2	6	1253664	1253669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_018224	CTC	2	6	1253719	1253724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_018224	CGT	2	6	1253735	1253740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_018224	AC	3	6	1253790	1253795	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_018224	AACC	2	8	1254061	1254068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_018224	GCGA	2	8	1254078	1254085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_018224	ACG	2	6	1254100	1254105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_018224	CAA	2	6	1254145	1254150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_018224	CGC	2	6	1254386	1254391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_018224	GCTC	2	8	1254392	1254399	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_018224	CGG	2	6	1254427	1254432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_018224	TCC	2	6	1254492	1254497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_018224	CCGG	2	8	1255689	1255696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_018224	CCG	2	6	1255728	1255733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_018224	GCGA	2	8	1255737	1255744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3627	NC_018224	GCCG	2	8	1257743	1257750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_018224	CGG	2	6	1257758	1257763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_018224	GAAC	2	8	1257813	1257820	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3630	NC_018224	GGT	2	6	1257834	1257839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_018224	GCGG	2	8	1259613	1259620	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3632	NC_018224	GCG	2	6	1260755	1260760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3764	NC_018224	GCG	2	6	1308183	1308188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3772	NC_018224	GC	3	6	1312115	1312120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3892	NC_018224	TCG	2	6	1357328	1357333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3895	NC_018224	GAC	2	6	1357379	1357384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3896	NC_018224	GGA	2	6	1357410	1357415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3897	NC_018224	CGA	2	6	1357418	1357423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3898	NC_018224	TAT	3	9	1357696	1357704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3931	NC_018224	CG	3	6	1366233	1366238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3932	NC_018224	GA	3	6	1367823	1367828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3933	NC_018224	AG	5	10	1367836	1367845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3992	NC_018224	CGG	2	6	1388521	1388526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3993	NC_018224	ACTC	2	8	1388599	1388606	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3994	NC_018224	GC	4	8	1388629	1388636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3995	NC_018224	GAGC	2	8	1388680	1388687	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3996	NC_018224	GAGC	2	8	1388693	1388700	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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