MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 10981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018224	GAA	2	6	1038069	1038074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_018224	TTC	2	6	1038123	1038128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_018224	GAC	2	6	1038161	1038166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_018224	TAT	2	6	1038221	1038226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_018224	AT	3	6	1038265	1038270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_018224	ATTG	2	8	1038276	1038283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_018224	GA	3	6	1038298	1038303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_018224	TGT	2	6	1038351	1038356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_018224	CCA	2	6	1038384	1038389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_018224	ATC	2	6	1038393	1038398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_018224	CTT	2	6	1038401	1038406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_018224	AGA	2	6	1038468	1038473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_018224	TCA	2	6	1038607	1038612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_018224	C	6	6	1038632	1038637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3015	NC_018224	CTC	2	6	1038691	1038696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_018224	AGT	2	6	1038700	1038705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_018224	CTC	2	6	1038855	1038860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_018224	TAA	2	6	1038964	1038969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_018224	AAT	2	6	1039017	1039022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_018224	TAC	2	6	1039042	1039047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_018224	TA	3	6	1039085	1039090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_018224	TTC	2	6	1039184	1039189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_018224	CGG	2	6	1039267	1039272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_018224	TTGT	2	8	1039289	1039296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_018224	AT	3	6	1039310	1039315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_018224	TCC	2	6	1039327	1039332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_018224	AAT	2	6	1039337	1039342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_018224	CT	4	8	1039388	1039395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_018224	ATACG	2	10	1039413	1039422	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3030	NC_018224	GTGA	2	8	1039464	1039471	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_018224	GTC	2	6	1039580	1039585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_018224	GTC	2	6	1040888	1040893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_018224	CGAC	2	8	1040959	1040966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_018224	GCCCG	2	10	1040967	1040976	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3035	NC_018224	T	6	6	1040980	1040985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_018224	ACG	2	6	1041003	1041008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_018224	GGCC	2	8	1043983	1043990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_018224	GTC	2	6	1044007	1044012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_018224	CGT	2	6	1044032	1044037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_018224	CT	3	6	1045249	1045254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_018224	CCG	2	6	1045275	1045280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_018224	ATCC	2	8	1045351	1045358	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_018224	GTC	2	6	1045398	1045403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_018224	ACGA	2	8	1046803	1046810	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_018224	C	6	6	1046818	1046823	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3046	NC_018224	GGTG	2	8	1046834	1046841	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_018224	GT	3	6	1046848	1046853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_018224	CGC	2	6	1047595	1047600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_018224	CGA	2	6	1047614	1047619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_018224	CGAT	2	8	1047676	1047683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3051	NC_018224	CGA	2	6	1047703	1047708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_018224	GTT	2	6	1047739	1047744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_018224	AGC	2	6	1049341	1049346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_018224	CCGTA	2	10	1049384	1049393	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3055	NC_018224	CGA	2	6	1050048	1050053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_018224	GA	3	6	1051026	1051031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_018224	GAACG	2	10	1051049	1051058	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3058	NC_018224	AACC	2	8	1051059	1051066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_018224	CGA	2	6	1051091	1051096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_018224	GA	3	6	1051101	1051106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_018224	TGC	2	6	1052918	1052923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_018224	CA	3	6	1052973	1052978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_018224	TGAT	2	8	1052995	1053002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_018224	CTA	2	6	1053007	1053012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_018224	TCT	2	6	1053036	1053041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_018224	CA	4	8	1053066	1053073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_018224	AT	3	6	1053078	1053083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_018224	ATA	2	6	1053100	1053105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_018224	A	6	6	1053234	1053239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_018224	TA	3	6	1053240	1053245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_018224	ACT	2	6	1053287	1053292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_018224	TAG	2	6	1053297	1053302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_018224	ACT	2	6	1053359	1053364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_018224	AGA	2	6	1053393	1053398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_018224	GTC	2	6	1053445	1053450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_018224	TCG	2	6	1055631	1055636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_018224	TC	3	6	1055665	1055670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3078	NC_018224	CA	3	6	1055678	1055683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3079	NC_018224	GTC	2	6	1055688	1055693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_018224	GAC	2	6	1055694	1055699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_018224	ATA	2	6	1055759	1055764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_018224	TA	3	6	1055763	1055768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_018224	CGC	2	6	1056418	1056423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_018224	ACG	2	6	1057704	1057709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_018224	GCC	2	6	1059032	1059037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_018224	GACGG	2	10	1059044	1059053	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3087	NC_018224	CTT	2	6	1059082	1059087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_018224	GA	3	6	1059092	1059097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_018224	GGA	2	6	1060548	1060553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_018224	CGA	2	6	1060584	1060589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_018224	CGC	2	6	1060605	1060610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_018224	CGT	2	6	1060615	1060620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_018224	ACGA	2	8	1060846	1060853	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_018224	CACC	2	8	1060856	1060863	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3095	NC_018224	GGC	2	6	1060913	1060918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_018224	AGT	2	6	1060939	1060944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_018224	CGGA	2	8	1061475	1061482	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3098	NC_018224	CCG	2	6	1061486	1061491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_018224	CGC	2	6	1061517	1061522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_018224	CGAC	2	8	1061540	1061547	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_018224	CA	3	6	1063033	1063038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_018224	CGA	2	6	1063054	1063059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_018224	AGC	2	6	1063067	1063072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_018224	ATG	2	6	1063508	1063513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_018224	TTA	2	6	1063636	1063641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_018224	TCG	2	6	1064761	1064766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_018224	CGAG	2	8	1064780	1064787	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3108	NC_018224	CGAG	2	8	1064828	1064835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_018224	CG	3	6	1064852	1064857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_018224	C	7	7	1067008	1067014	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3111	NC_018224	ACG	2	6	1067109	1067114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_018224	GTCGG	2	10	1067127	1067136	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3113	NC_018224	GTC	2	6	1067144	1067149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_018224	CGG	2	6	1067172	1067177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_018224	CGC	2	6	1067239	1067244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_018224	GCA	2	6	1067252	1067257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_018224	C	6	6	1067287	1067292	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3118	NC_018224	TC	3	6	1067351	1067356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_018224	GCA	2	6	1067553	1067558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_018224	GTGG	2	8	1067559	1067566	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_018224	CGTT	2	8	1067616	1067623	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3122	NC_018224	CGC	2	6	1068844	1068849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_018224	CCG	2	6	1068851	1068856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_018224	ATC	2	6	1068930	1068935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_018224	CGT	2	6	1069545	1069550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_018224	ACGG	2	8	1069564	1069571	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_018224	GC	3	6	1069589	1069594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3128	NC_018224	CGC	2	6	1070397	1070402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_018224	ACG	2	6	1070621	1070626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_018224	CGG	3	9	1070706	1070714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_018224	AGCGC	2	10	1070728	1070737	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3252	NC_018224	GCA	2	6	1116853	1116858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3254	NC_018224	AC	3	6	1118185	1118190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3260	NC_018224	CGA	2	6	1119048	1119053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3261	NC_018224	CGG	2	6	1120717	1120722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3262	NC_018224	CGGC	2	8	1120802	1120809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3263	NC_018224	CGG	2	6	1120824	1120829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3264	NC_018224	GGA	2	6	1121520	1121525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_018224	CTG	2	6	1121561	1121566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3381	NC_018224	CGAG	2	8	1167606	1167613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3383	NC_018224	CCGC	2	8	1167645	1167652	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3384	NC_018224	GAAA	2	8	1167663	1167670	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3385	NC_018224	TCCG	2	8	1168805	1168812	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3386	NC_018224	CGG	2	6	1168815	1168820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3387	NC_018224	CGA	2	6	1168821	1168826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3390	NC_018224	GCC	2	6	1170262	1170267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3391	NC_018224	CGA	2	6	1170275	1170280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3433	NC_018224	GTCG	2	8	1184891	1184898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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