MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 10981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018224	AGT	2	6	899936	899941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_018224	CCG	3	9	900147	900155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_018224	TG	3	6	901215	901220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_018224	TCCG	2	8	901269	901276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_018224	GTA	2	6	901302	901307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_018224	AGCCGA	2	12	901367	901378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_018224	GA	3	6	901382	901387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_018224	GCC	2	6	901438	901443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2509	NC_018224	CGG	2	6	901630	901635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_018224	GA	3	6	901639	901644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_018224	GGC	2	6	901648	901653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_018224	TTTC	2	8	901680	901687	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2513	NC_018224	CCGT	2	8	902251	902258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_018224	TCGT	2	8	902280	902287	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2515	NC_018224	GGT	2	6	902298	902303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_018224	GTG	2	6	902308	902313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_018224	CTG	2	6	902367	902372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_018224	GCG	2	6	904066	904071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_018224	CCGA	2	8	904134	904141	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2520	NC_018224	CGAG	2	8	904210	904217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2521	NC_018224	AG	8	16	904216	904231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_018224	CCGT	2	8	904237	904244	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2523	NC_018224	TCTA	2	8	904286	904293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2524	NC_018224	AGAC	2	8	904301	904308	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2525	NC_018224	CGA	2	6	904409	904414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_018224	GTC	2	6	904535	904540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_018224	TATC	2	8	904593	904600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2528	NC_018224	TGT	2	6	904603	904608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_018224	TGT	2	6	904613	904618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_018224	CGAT	2	8	904643	904650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2531	NC_018224	CAC	2	6	904697	904702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2532	NC_018224	ACTG	2	8	904740	904747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2533	NC_018224	CGC	2	6	906723	906728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2534	NC_018224	CGT	2	6	907419	907424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_018224	TGT	2	6	907430	907435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_018224	ACCGA	2	10	907488	907497	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2537	NC_018224	ATGG	2	8	907514	907521	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_018224	GCTG	2	8	907528	907535	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2539	NC_018224	AT	3	6	907547	907552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_018224	TCCG	2	8	907602	907609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2541	NC_018224	AGG	2	6	907699	907704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_018224	CGT	2	6	907799	907804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_018224	CGG	2	6	907807	907812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_018224	GGA	2	6	907869	907874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_018224	CGT	2	6	907887	907892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_018224	ATC	2	6	908142	908147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_018224	GACC	2	8	908149	908156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2548	NC_018224	CGA	3	9	908178	908186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_018224	CGA	2	6	908190	908195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_018224	CGC	2	6	908236	908241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2551	NC_018224	GACGCG	2	12	908258	908269	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_018224	ACG	2	6	908288	908293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_018224	TCG	2	6	908304	908309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_018224	CGG	2	6	908328	908333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_018224	GAC	2	6	908447	908452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2556	NC_018224	TCG	2	6	908463	908468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_018224	GTCG	2	8	908470	908477	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2558	NC_018224	CGG	2	6	908497	908502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_018224	ACG	2	6	908586	908591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_018224	CAT	2	6	908608	908613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_018224	GCC	2	6	908621	908626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_018224	CGTC	2	8	908737	908744	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2563	NC_018224	TG	3	6	908760	908765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_018224	GCT	2	6	908776	908781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_018224	GAC	2	6	908782	908787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_018224	TCG	2	6	908889	908894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_018224	CGGC	2	8	908901	908908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2568	NC_018224	GTCA	2	8	908915	908922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2569	NC_018224	CGA	2	6	908944	908949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_018224	ATC	2	6	908954	908959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_018224	GGC	2	6	908998	909003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_018224	GCC	2	6	909008	909013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2573	NC_018224	CGA	2	6	909016	909021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2574	NC_018224	TCA	2	6	909027	909032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_018224	AAC	2	6	909068	909073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_018224	GC	3	6	909102	909107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2577	NC_018224	GAG	2	6	909134	909139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_018224	CGC	2	6	909148	909153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2579	NC_018224	GGT	2	6	909199	909204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_018224	ACC	2	6	909219	909224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2581	NC_018224	ATT	2	6	909248	909253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_018224	CG	3	6	909305	909310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2583	NC_018224	ACGT	2	8	909353	909360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2584	NC_018224	GAT	2	6	909397	909402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2587	NC_018224	CGA	2	6	909463	909468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2589	NC_018224	TCG	2	6	909495	909500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_018224	CGT	2	6	909589	909594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_018224	GCG	2	6	909606	909611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_018224	CGG	2	6	909644	909649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_018224	CGC	2	6	909668	909673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2594	NC_018224	GGC	2	6	909676	909681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_018224	GAT	2	6	909685	909690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_018224	CGA	2	6	909694	909699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2598	NC_018224	CGACGC	2	12	909736	909747	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2599	NC_018224	GCC	2	6	909790	909795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2600	NC_018224	CGA	2	6	909817	909822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_018224	CGC	2	6	909832	909837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2602	NC_018224	TCG	2	6	909876	909881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_018224	CGACG	2	10	909883	909892	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2604	NC_018224	CCG	2	6	909942	909947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2605	NC_018224	CCG	2	6	909955	909960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2606	NC_018224	CGC	2	6	909979	909984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2607	NC_018224	CCG	2	6	910051	910056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2609	NC_018224	TCG	2	6	910119	910124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_018224	TCC	2	6	910293	910298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2611	NC_018224	GCC	2	6	910379	910384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2612	NC_018224	CGT	2	6	910385	910390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2614	NC_018224	CGC	2	6	910908	910913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2615	NC_018224	CGAG	2	8	911156	911163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2616	NC_018224	GGCT	2	8	912667	912674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2617	NC_018224	GA	3	6	912690	912695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_018224	TAGT	2	8	912712	912719	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_018224	CGT	2	6	912896	912901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_018224	TACTAT	2	12	913132	913143	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2621	NC_018224	CCG	2	6	913180	913185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2622	NC_018224	CAGT	2	8	913231	913238	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2623	NC_018224	CCG	2	6	913310	913315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2624	NC_018224	CAG	2	6	913340	913345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_018224	GC	3	6	913418	913423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2626	NC_018224	TCG	2	6	913494	913499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_018224	TCGAC	2	10	913526	913535	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2628	NC_018224	CAG	2	6	913704	913709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_018224	TGA	2	6	913729	913734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_018224	GTC	2	6	914915	914920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_018224	CGGG	2	8	914948	914955	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2632	NC_018224	GA	3	6	914976	914981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_018224	ACGC	2	8	915034	915041	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2634	NC_018224	GC	3	6	915067	915072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2635	NC_018224	CGG	2	6	915078	915083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2636	NC_018224	TCC	2	6	915090	915095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2637	NC_018224	CGGGT	2	10	915115	915124	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2638	NC_018224	GCG	2	6	915133	915138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2639	NC_018224	CGA	2	6	915166	915171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2642	NC_018224	CG	3	6	915246	915251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2643	NC_018224	CGG	2	6	915264	915269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2644	NC_018224	CGC	2	6	915328	915333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2749	NC_018224	CAAA	2	8	935048	935055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2757	NC_018224	GTCA	2	8	939681	939688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2758	NC_018224	ACGG	2	8	939703	939710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2763	NC_018224	CG	3	6	944146	944151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2764	NC_018224	ACTG	2	8	944218	944225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2769	NC_018224	TCCG	2	8	948605	948612	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2772	NC_018224	CGA	2	6	949387	949392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2775	NC_018224	ACC	2	6	949487	949492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2884	NC_018224	TATC	2	8	1011066	1011073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2885	NC_018224	TCGTG	2	10	1011095	1011104	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2891	NC_018224	CG	3	6	1012923	1012928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2892	NC_018224	CCGC	2	8	1012978	1012985	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2893	NC_018224	CCG	2	6	1014572	1014577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2895	NC_018224	TTC	2	6	1015798	1015803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2896	NC_018224	GCAT	2	8	1015816	1015823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2897	NC_018224	ATTA	2	8	1015840	1015847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2898	NC_018224	AT	3	6	1015863	1015868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2899	NC_018224	GA	3	6	1015877	1015882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2900	NC_018224	GTA	2	6	1015926	1015931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2902	NC_018224	GAGCG	2	10	1015959	1015968	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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2904	NC_018224	GGC	2	6	1017295	1017300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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