MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 10981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018224	TA	3	6	604644	604649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_018224	AT	3	6	604708	604713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_018224	GTAT	2	8	604714	604721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_018224	TAAT	2	8	604735	604742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_018224	CAT	2	6	605899	605904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_018224	CTT	2	6	607747	607752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_018224	GAT	2	6	610829	610834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_018224	GTT	2	6	610836	610841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_018224	TGG	2	6	610859	610864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_018224	TCT	2	6	611216	611221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_018224	TCG	2	6	611249	611254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_018224	TATCA	2	10	611273	611282	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1513	NC_018224	ATA	2	6	611323	611328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_018224	AT	3	6	611381	611386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_018224	GTA	2	6	611395	611400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_018224	TAT	2	6	611496	611501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_018224	CAC	2	6	613359	613364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_018224	GTCG	2	8	613792	613799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_018224	ACG	2	6	613831	613836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_018224	GTCC	2	8	613860	613867	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_018224	CGCC	2	8	613882	613889	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1522	NC_018224	GAT	2	6	614837	614842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_018224	GTGC	2	8	615186	615193	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_018224	ACTC	2	8	615206	615213	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_018224	CTG	2	6	615276	615281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_018224	CAC	2	6	615868	615873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_018224	CGGA	2	8	616079	616086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_018224	GAC	2	6	616131	616136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_018224	CGAG	2	8	616160	616167	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_018224	CCG	2	6	616948	616953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_018224	GCG	2	6	616973	616978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_018224	CTCG	2	8	617025	617032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_018224	AAC	2	6	618190	618195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_018224	CGT	2	6	618873	618878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_018224	ACC	2	6	619382	619387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_018224	TGA	2	6	619429	619434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_018224	CGG	2	6	620989	620994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_018224	TCGA	2	8	621019	621026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_018224	GCCG	2	8	622107	622114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_018224	GGT	2	6	622136	622141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_018224	TTCG	2	8	622356	622363	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_018224	CGA	2	6	622381	622386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_018224	CGC	2	6	623119	623124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_018224	ACC	2	6	623200	623205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_018224	GCC	2	6	623239	623244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_018224	CCGTC	2	10	623277	623286	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1547	NC_018224	CAG	2	6	623327	623332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_018224	GTA	2	6	623336	623341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_018224	ACT	2	6	623364	623369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_018224	GT	3	6	623378	623383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_018224	GT	3	6	623404	623409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_018224	GTG	2	6	623423	623428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_018224	CGT	2	6	623456	623461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_018224	TTC	2	6	623479	623484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_018224	ACCG	2	8	623543	623550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_018224	CGC	2	6	623591	623596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_018224	CAG	2	6	625739	625744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_018224	CGT	2	6	625779	625784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_018224	C	6	6	625787	625792	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1560	NC_018224	ATCGA	2	10	626615	626624	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1561	NC_018224	GAA	2	6	626651	626656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_018224	GGTC	2	8	626778	626785	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_018224	TC	3	6	626788	626793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_018224	TAG	2	6	626805	626810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_018224	AC	3	6	626826	626831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_018224	CTA	2	6	626879	626884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_018224	CGT	2	6	626924	626929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_018224	GC	3	6	626984	626989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_018224	CGA	2	6	628443	628448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_018224	GCTGC	2	10	628471	628480	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1571	NC_018224	CGA	2	6	628486	628491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_018224	GCG	2	6	628591	628596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_018224	TCGG	2	8	628598	628605	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_018224	CGG	2	6	628640	628645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_018224	TC	3	6	628688	628693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_018224	AAC	2	6	629877	629882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_018224	TA	3	6	629906	629911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_018224	GCC	2	6	629961	629966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_018224	GCG	2	6	634831	634836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_018224	CCCCT	2	10	634843	634852	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1581	NC_018224	CGG	2	6	634860	634865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_018224	AAC	2	6	636548	636553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_018224	GGC	2	6	636599	636604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_018224	GTCG	2	8	637103	637110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1585	NC_018224	GC	3	6	637119	637124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_018224	CT	3	6	637190	637195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_018224	GCT	2	6	637238	637243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_018224	CGGTG	2	10	637271	637280	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1589	NC_018224	CCGA	2	8	637372	637379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_018224	TCGGT	2	10	637602	637611	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1591	NC_018224	GC	3	6	637623	637628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_018224	TCGA	2	8	637646	637653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_018224	CGA	2	6	638576	638581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_018224	GC	3	6	638620	638625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_018224	GCG	2	6	638643	638648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_018224	GCCG	2	8	638660	638667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_018224	GC	4	8	638683	638690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_018224	CGA	2	6	638709	638714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_018224	GTG	2	6	638748	638753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_018224	GGA	2	6	638800	638805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_018224	TCA	2	6	638824	638829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_018224	GT	3	6	638870	638875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_018224	GAC	2	6	638891	638896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_018224	AC	3	6	638895	638900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_018224	CCGA	2	8	638923	638930	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_018224	GGT	2	6	638951	638956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_018224	TGTGG	2	10	638959	638968	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_018224	CCGG	2	8	638992	638999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_018224	CGAG	2	8	639015	639022	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_018224	ACC	2	6	639034	639039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_018224	CA	3	6	639050	639055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_018224	CCG	2	6	639068	639073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_018224	AGC	2	6	639295	639300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_018224	CGT	2	6	639328	639333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_018224	TTGC	2	8	639374	639381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_018224	ATCT	2	8	639481	639488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_018224	GAC	2	6	639587	639592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_018224	GC	3	6	639594	639599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_018224	GTC	2	6	639636	639641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_018224	GCC	2	6	639646	639651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_018224	GCC	2	6	639663	639668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_018224	TCG	2	6	639689	639694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_018224	CTC	2	6	639706	639711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_018224	T	7	7	643068	643074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_018224	CGG	2	6	644268	644273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_018224	CGA	2	6	644279	644284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_018224	G	6	6	644322	644327	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_018224	TCG	2	6	644559	644564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_018224	GTC	2	6	645205	645210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_018224	ACGG	2	8	645295	645302	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_018224	GTTC	2	8	646149	646156	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_018224	TCT	2	6	646181	646186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_018224	GCAT	2	8	646203	646210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_018224	AATA	2	8	646234	646241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_018224	GGGC	2	8	646247	646254	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1636	NC_018224	GAG	2	6	646316	646321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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