MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 10981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018224	TAAA	2	8	189456	189463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_018224	GACG	2	8	189483	189490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
503	NC_018224	CGCGGC	2	12	189775	189786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_018224	C	6	6	191978	191983	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
505	NC_018224	CGC	2	6	192177	192182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_018224	CA	3	6	192193	192198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_018224	ACG	2	6	193155	193160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_018224	AGA	2	6	193164	193169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_018224	ATCGA	2	10	193225	193234	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
510	NC_018224	CGA	2	6	194297	194302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_018224	GCC	2	6	194426	194431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_018224	AGGT	2	8	194466	194473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018224	CGAT	2	8	196766	196773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
514	NC_018224	ACT	2	6	196775	196780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_018224	CA	3	6	196843	196848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_018224	GGCT	2	8	196984	196991	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
517	NC_018224	TTGGG	2	10	205241	205250	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018224	GA	3	6	205270	205275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_018224	TAC	2	6	205292	205297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_018224	GCG	2	6	205307	205312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_018224	CCGG	2	8	205357	205364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_018224	TTGA	2	8	205511	205518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018224	AGG	2	6	205544	205549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018224	GTG	2	6	205567	205572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018224	CAT	2	6	205581	205586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_018224	CTT	2	6	205634	205639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_018224	CGA	2	6	205653	205658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_018224	GTA	2	6	205666	205671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018224	GCT	2	6	205838	205843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_018224	TAGA	2	8	205867	205874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018224	ACG	2	6	205876	205881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_018224	GAG	2	6	205886	205891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018224	GCC	2	6	205896	205901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_018224	TGG	2	6	205927	205932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018224	AGG	2	6	205993	205998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018224	GTG	2	6	206016	206021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018224	CAT	2	6	206030	206035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_018224	CTT	2	6	206083	206088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_018224	CGA	2	6	206102	206107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_018224	GTA	2	6	206115	206120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_018224	AGC	2	6	206138	206143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_018224	CGA	2	6	206146	206151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_018224	CGT	2	6	206224	206229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_018224	CGT	2	6	206270	206275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_018224	CCT	2	6	206331	206336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_018224	GT	3	6	206358	206363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_018224	AG	3	6	206399	206404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018224	TC	3	6	206442	206447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_018224	GAA	2	6	206448	206453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018224	GACC	2	8	208604	208611	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
551	NC_018224	TAG	2	6	208769	208774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_018224	CCGT	2	8	208775	208782	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
553	NC_018224	TAC	2	6	208794	208799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_018224	C	6	6	208867	208872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
555	NC_018224	CGA	3	9	208933	208941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_018224	GCC	2	6	208948	208953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_018224	CGT	2	6	211210	211215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_018224	AGC	2	6	211825	211830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_018224	ACG	2	6	211857	211862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_018224	GAC	2	6	211892	211897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_018224	GACC	2	8	211920	211927	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
562	NC_018224	CCA	2	6	212970	212975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_018224	TCG	2	6	212995	213000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_018224	GTGC	2	8	213006	213013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
565	NC_018224	TCCGA	2	10	213055	213064	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
566	NC_018224	GGT	2	6	213106	213111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018224	GCC	2	6	214146	214151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_018224	CGC	2	6	214174	214179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_018224	CCA	2	6	214193	214198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_018224	CGGC	2	8	214199	214206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_018224	CGA	2	6	214244	214249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_018224	GGC	2	6	215626	215631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_018224	GA	3	6	215679	215684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018224	GAGT	2	8	215728	215735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018224	CGA	2	6	215758	215763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_018224	GGA	2	6	215794	215799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018224	GCG	2	6	215833	215838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_018224	TGG	2	6	216396	216401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_018224	TTAC	2	8	216402	216409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
580	NC_018224	GGC	2	6	216491	216496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_018224	TA	3	6	216780	216785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018224	TAG	2	6	216791	216796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_018224	GAC	2	6	216824	216829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_018224	CGT	2	6	216837	216842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_018224	ATCGA	2	10	216864	216873	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
586	NC_018224	GCC	2	6	216876	216881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_018224	GAAC	2	8	216884	216891	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
588	NC_018224	CGG	2	6	216947	216952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_018224	CCG	3	9	216966	216974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_018224	CCG	2	6	220099	220104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_018224	CCG	2	6	220621	220626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_018224	GGAAC	2	10	220704	220713	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
593	NC_018224	ACC	2	6	221622	221627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_018224	CGG	2	6	221637	221642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_018224	CGG	2	6	222730	222735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_018224	CGT	2	6	222746	222751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_018224	CGG	2	6	222757	222762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_018224	CGG	2	6	222766	222771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_018224	ATC	2	6	227505	227510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_018224	GTC	2	6	227551	227556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_018224	ACGC	2	8	227690	227697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
602	NC_018224	TCGT	2	8	227746	227753	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
603	NC_018224	CGTT	2	8	228245	228252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_018224	CGAG	2	8	228549	228556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
605	NC_018224	C	6	6	228872	228877	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
606	NC_018224	AGC	2	6	228911	228916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_018224	GGC	2	6	228917	228922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_018224	GGCA	2	8	229329	229336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
609	NC_018224	ACT	2	6	229392	229397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_018224	GCGA	2	8	231442	231449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
611	NC_018224	GTG	2	6	231472	231477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_018224	GCG	2	6	231487	231492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_018224	CGA	3	9	231543	231551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_018224	TCG	2	6	231677	231682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_018224	CGC	2	6	231705	231710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_018224	CAC	2	6	231712	231717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_018224	GAC	2	6	231772	231777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_018224	CGT	2	6	231822	231827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_018224	GAC	2	6	231868	231873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_018224	CGA	2	6	231887	231892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_018224	TCG	2	6	231905	231910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_018224	TCT	2	6	231920	231925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_018224	TGTA	2	8	236104	236111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018224	TAT	2	6	236124	236129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018224	CGG	2	6	238430	238435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_018224	ACCAC	2	10	239438	239447	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
627	NC_018224	ATG	2	6	239483	239488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018224	GGT	2	6	239503	239508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_018224	ACT	2	6	239638	239643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_018224	ACA	2	6	239756	239761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_018224	CGA	2	6	239817	239822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_018224	TCG	2	6	239848	239853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_018224	CGA	2	6	239858	239863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_018224	GCGGT	2	10	239870	239879	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
635	NC_018224	GC	3	6	239889	239894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
636	NC_018224	TG	4	8	240062	240069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018224	ACCG	2	8	246282	246289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
638	NC_018224	ACGG	2	8	246295	246302	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
639	NC_018224	CCG	2	6	246385	246390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
640	NC_018224	CCGT	2	8	246404	246411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
641	NC_018224	TTA	2	6	247345	247350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_018224	TTCGGT	2	12	247792	247803	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
643	NC_018224	TCAG	2	8	247821	247828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
644	NC_018224	CCGA	2	8	247864	247871	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
645	NC_018224	G	6	6	249145	249150	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
646	NC_018224	TCAG	2	8	249425	249432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
647	NC_018224	CGG	2	6	250040	250045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_018224	TGC	2	6	250995	251000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_018224	CGC	2	6	251013	251018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
650	NC_018224	TG	3	6	256266	256271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
651	NC_018224	CGC	2	6	256412	256417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
652	NC_018224	CGG	2	6	256431	256436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_018224	GCC	2	6	256477	256482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
654	NC_018224	TGC	2	6	259335	259340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
655	NC_018224	AGT	2	6	259393	259398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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657	NC_018224	GCC	3	9	259436	259444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
658	NC_018224	CCG	2	6	259456	259461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
659	NC_018224	GCCG	2	8	259579	259586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
660	NC_018224	CCG	2	6	260768	260773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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663	NC_018224	GCC	2	6	261050	261055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
664	NC_018224	TCGG	2	8	263805	263812	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
665	NC_018224	CGAC	2	8	263823	263830	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
666	NC_018224	GGC	2	6	263831	263836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
667	NC_018224	CCG	2	6	263842	263847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
668	NC_018224	CGGC	2	8	263853	263860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
669	NC_018224	CG	3	6	263864	263869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
670	NC_018224	GGC	2	6	265298	265303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
671	NC_018224	GCC	2	6	265336	265341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
672	NC_018224	CCG	2	6	265362	265367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
673	NC_018224	G	6	6	266052	266057	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
674	NC_018224	GCG	2	6	266107	266112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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677	NC_018224	CCG	2	6	266160	266165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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679	NC_018224	CGA	2	6	266253	266258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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681	NC_018224	CGGA	2	8	266339	266346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
682	NC_018224	GAC	2	6	266578	266583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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684	NC_018224	GCGG	2	8	269003	269010	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
685	NC_018224	GGAC	2	8	269039	269046	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
686	NC_018224	CAG	2	6	271581	271586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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688	NC_018224	ACCG	2	8	271657	271664	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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705	NC_018224	CGA	3	9	280920	280928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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723	NC_018224	ACG	2	6	288726	288731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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759	NC_018224	CGA	2	6	303724	303729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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761	NC_018224	CGA	2	6	303745	303750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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763	NC_018224	CGG	2	6	303832	303837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
764	NC_018224	CCGT	2	8	303851	303858	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
765	NC_018224	CGAC	2	8	303916	303923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
766	NC_018224	CCA	2	6	303941	303946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
767	NC_018224	CCA	2	6	303955	303960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
768	NC_018224	TCCA	2	8	303989	303996	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
769	NC_018224	TCC	2	6	304001	304006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
770	NC_018224	CCACT	2	10	304007	304016	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
771	NC_018224	C	6	6	304022	304027	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
772	NC_018224	GCC	2	6	304065	304070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
773	NC_018224	CAAGC	2	10	304104	304113	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
774	NC_018224	CG	3	6	304135	304140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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776	NC_018224	GACAC	2	10	305457	305466	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
777	NC_018224	AGCA	2	8	305493	305500	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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784	NC_018224	CGA	2	6	306019	306024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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793	NC_018224	ACA	2	6	307973	307978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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943	NC_018224	CGAG	2	8	367054	367061	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
944	NC_018224	CGA	2	6	367067	367072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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952	NC_018224	AT	3	6	372039	372044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
953	NC_018224	TA	3	6	372063	372068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
954	NC_018224	CGA	2	6	373681	373686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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973	NC_018224	TA	3	6	382769	382774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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