MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natrinema sp. J7-2 chromosome

Total Repeats: 10981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018224	CGT	2	6	1553431	1553436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_018224	GAT	2	6	1553460	1553465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_018224	GCC	2	6	1553476	1553481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_018224	TA	3	6	1553509	1553514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_018224	CAG	2	6	1554929	1554934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_018224	TCA	2	6	1554988	1554993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_018224	CGC	2	6	1555009	1555014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_018224	AC	3	6	1555049	1555054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_018224	ACC	2	6	1555063	1555068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NC_018224	CGG	2	6	1555083	1555088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_018224	GCA	2	6	1555111	1555116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_018224	AAC	2	6	1558623	1558628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_018224	AC	3	6	1561004	1561009	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4514	NC_018224	AGC	2	6	1561048	1561053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_018224	CT	3	6	1561129	1561134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_018224	CGA	2	6	1561200	1561205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_018224	CAT	2	6	1561352	1561357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_018224	CCG	2	6	1561389	1561394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_018224	GTC	2	6	1561408	1561413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_018224	CTCG	2	8	1561416	1561423	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4521	NC_018224	CCG	2	6	1561435	1561440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_018224	CA	3	6	1561450	1561455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4523	NC_018224	GAAC	2	8	1561456	1561463	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_018224	GCCG	2	8	1561833	1561840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4525	NC_018224	CG	3	6	1561843	1561848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_018224	CGG	2	6	1561857	1561862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_018224	GCG	2	6	1561872	1561877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_018224	GCCCT	2	10	1561916	1561925	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4529	NC_018224	CGG	2	6	1561984	1561989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_018224	CGC	2	6	1561999	1562004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_018224	TCGC	2	8	1563037	1563044	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_018224	T	6	6	1563047	1563052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_018224	CCG	2	6	1563065	1563070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_018224	CGAC	2	8	1564354	1564361	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_018224	GTA	2	6	1564406	1564411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_018224	CGG	2	6	1564413	1564418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_018224	CCGATC	2	12	1566409	1566420	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_018224	ACC	2	6	1566423	1566428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4539	NC_018224	CGGGT	2	10	1566438	1566447	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4540	NC_018224	GAC	2	6	1567260	1567265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_018224	GGTT	2	8	1567730	1567737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_018224	GAC	3	9	1568284	1568292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_018224	TAA	2	6	1571602	1571607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_018224	CT	3	6	1571609	1571614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4545	NC_018224	CGA	2	6	1571670	1571675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_018224	CGT	2	6	1571722	1571727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_018224	CGG	2	6	1571733	1571738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_018224	CGA	2	6	1573215	1573220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_018224	CCGG	2	8	1573223	1573230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_018224	TCG	3	9	1573255	1573263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_018224	GGTGC	2	10	1573264	1573273	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4552	NC_018224	TCG	2	6	1573288	1573293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_018224	GCC	3	9	1573323	1573331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_018224	GA	3	6	1574672	1574677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_018224	GAC	2	6	1574744	1574749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_018224	CGA	2	6	1575164	1575169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_018224	ACG	2	6	1577683	1577688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_018224	GTC	2	6	1577735	1577740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_018224	AGT	2	6	1577795	1577800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_018224	AAT	3	9	1578194	1578202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_018224	TAA	2	6	1578225	1578230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_018224	CTT	2	6	1578240	1578245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_018224	TA	3	6	1578247	1578252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_018224	GTA	2	6	1578259	1578264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_018224	CAA	2	6	1578403	1578408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_018224	AG	3	6	1578409	1578414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_018224	A	6	6	1578417	1578422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_018224	AG	3	6	1578455	1578460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_018224	GTG	2	6	1578461	1578466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_018224	GGA	2	6	1578512	1578517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_018224	GAC	2	6	1578529	1578534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_018224	AAG	2	6	1580125	1580130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_018224	TCG	2	6	1580188	1580193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_018224	GGGATT	2	12	1580265	1580276	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_018224	CAAT	2	8	1581182	1581189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4576	NC_018224	TC	3	6	1581207	1581212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_018224	ACG	2	6	1581220	1581225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_018224	AGTT	2	8	1581267	1581274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_018224	GTT	2	6	1581287	1581292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_018224	CTG	2	6	1581297	1581302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_018224	CTGG	2	8	1581304	1581311	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4582	NC_018224	CAG	2	6	1581365	1581370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_018224	ATT	2	6	1581383	1581388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_018224	TTA	4	12	1581390	1581401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_018224	TCG	2	6	1581443	1581448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_018224	AG	3	6	1581458	1581463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_018224	GTG	2	6	1581464	1581469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_018224	ATG	2	6	1581526	1581531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_018224	CGA	2	6	1581574	1581579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_018224	GCG	2	6	1581693	1581698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_018224	TCG	2	6	1581762	1581767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_018224	CGAT	2	8	1581769	1581776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4593	NC_018224	TCGT	2	8	1582133	1582140	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4594	NC_018224	AAC	2	6	1582235	1582240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_018224	TGGC	2	8	1582245	1582252	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4596	NC_018224	AGT	2	6	1584493	1584498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_018224	TCC	2	6	1585594	1585599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_018224	AAT	2	6	1585670	1585675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_018224	TTA	2	6	1585689	1585694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_018224	CTG	3	9	1586607	1586615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_018224	TGC	2	6	1586653	1586658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_018224	TCGTCT	2	12	1586687	1586698	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_018224	GAT	2	6	1586818	1586823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_018224	CAC	2	6	1586826	1586831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4605	NC_018224	TTC	2	6	1586853	1586858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_018224	TAT	2	6	1586874	1586879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_018224	TAA	2	6	1586892	1586897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_018224	TAT	2	6	1586912	1586917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_018224	AAC	2	6	1586929	1586934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_018224	TCC	2	6	1586944	1586949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_018224	AGG	2	6	1587093	1587098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_018224	AACACG	2	12	1587221	1587232	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_018224	TCGC	2	8	1587246	1587253	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_018224	TCC	2	6	1587280	1587285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4615	NC_018224	GTG	2	6	1587304	1587309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_018224	TCC	2	6	1587365	1587370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_018224	AT	3	6	1587808	1587813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_018224	TATT	2	8	1587883	1587890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_018224	TA	3	6	1587896	1587901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_018224	TTC	2	6	1587903	1587908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_018224	TGGT	2	8	1587923	1587930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_018224	TGAT	2	8	1587943	1587950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_018224	GCG	2	6	1587965	1587970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_018224	CGT	2	6	1588052	1588057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_018224	TGGCTT	2	12	1588060	1588071	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4626	NC_018224	CCG	2	6	1588114	1588119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_018224	GC	3	6	1588167	1588172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4628	NC_018224	ACG	2	6	1588202	1588207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_018224	CGC	2	6	1588221	1588226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4630	NC_018224	GGA	2	6	1588288	1588293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4632	NC_018224	TCC	2	6	1588369	1588374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4755	NC_018224	CGT	2	6	1619878	1619883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4759	NC_018224	TAGC	2	8	1621573	1621580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4762	NC_018224	ACG	2	6	1621648	1621653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4767	NC_018224	GCGT	2	8	1622123	1622130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4768	NC_018224	TCG	2	6	1622134	1622139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4844	NC_018224	GT	3	6	1640195	1640200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4884	NC_018224	GCCG	2	8	1672091	1672098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4885	NC_018224	GACGG	2	10	1672107	1672116	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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4890	NC_018224	ATA	2	6	1672369	1672374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5000	NC_018224	CTGTC	2	10	1708333	1708342	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

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