MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 9236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017518	CTGC	2	8	2389	2396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017518	CGC	2	6	2461	2466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017518	TTC	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017518	A	8	8	2494	2501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017518	TTA	2	6	3539	3544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017518	CCCG	2	8	4157	4164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_017518	GCC	2	6	4286	4291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017518	CCT	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017518	CAA	2	6	5951	5956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017518	CA	3	6	6220	6225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017518	T	6	6	6264	6269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017518	TCTT	2	8	8506	8513	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017518	CCG	3	9	8584	8592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017518	TGG	2	6	9891	9896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017518	GGC	2	6	9932	9937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017518	A	6	6	10207	10212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017518	T	7	7	10234	10240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017518	TGG	2	6	10249	10254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017518	GCT	2	6	10297	10302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017518	ATTTA	2	10	14693	14702	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017518	T	6	6	14756	14761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017518	TAAA	2	8	14807	14814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017518	ATA	2	6	14828	14833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017518	GAT	2	6	14838	14843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017518	T	8	8	14876	14883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017518	ATC	2	6	14893	14898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017518	GAA	2	6	14970	14975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017518	TTG	2	6	14997	15002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017518	GCT	2	6	15036	15041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017518	GTG	2	6	15177	15182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017518	TCAG	2	8	15219	15226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017518	ATG	2	6	15339	15344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017518	A	6	6	15372	15377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017518	CCG	2	6	15389	15394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017518	AAC	2	6	15428	15433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017518	T	6	6	15542	15547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017518	ATG	2	6	15560	15565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017518	A	6	6	15593	15598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017518	AAT	2	6	16565	16570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017518	CGA	2	6	16685	16690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017518	GCC	2	6	16692	16697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017518	C	6	6	16696	16701	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_017518	A	6	6	16715	16720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017518	GTTC	2	8	16847	16854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017518	AGC	2	6	17002	17007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017518	GTG	2	6	17115	17120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017518	TCA	2	6	17142	17147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017518	GC	3	6	17202	17207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017518	GGC	2	6	17235	17240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017518	AT	3	6	17275	17280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017518	CCA	2	6	17287	17292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017518	GAC	2	6	17298	17303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017518	CTTGC	2	10	17308	17317	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017518	ATTT	2	8	17382	17389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017518	GGAAA	2	10	17929	17938	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017518	T	8	8	17989	17996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017518	TAT	2	6	18009	18014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017518	GGGT	2	8	18284	18291	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017518	TGGG	2	8	18292	18299	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017518	AATTT	2	10	18308	18317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017518	GTG	2	6	18360	18365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017518	ATC	2	6	18388	18393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017518	ATG	2	6	19285	19290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017518	ATG	2	6	19331	19336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017518	ATG	2	6	19377	19382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017518	CCG	2	6	19427	19432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017518	TCG	2	6	19842	19847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017518	ATG	2	6	20033	20038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017518	A	6	6	20066	20071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017518	CCGCT	2	10	20078	20087	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
71	NC_017518	ATG	2	6	20585	20590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017518	A	6	6	20617	20622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017518	CCG	2	6	20634	20639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017518	TCG	2	6	20668	20673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017518	TCG	2	6	21234	21239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017518	ATG	2	6	22032	22037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017518	A	6	6	22065	22070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017518	CCG	2	6	22082	22087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017518	T	6	6	22662	22667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017518	CGG	2	6	22680	22685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017518	CGTCGG	3	18	22689	22706	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017518	GC	3	6	22718	22723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017518	CGG	2	6	22830	22835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017518	ACG	2	6	22838	22843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017518	CGG	2	6	22905	22910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017518	CAT	2	6	22911	22916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017518	TCT	2	6	23064	23069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017518	GGC	3	9	23074	23082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017518	CGGCGT	2	12	23088	23099	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017518	GC	3	6	23108	23113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017518	T	6	6	23176	23181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017518	CGC	2	6	23202	23207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017518	ACG	2	6	23228	23233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017518	ATG	2	6	23821	23826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017518	CCG	2	6	23871	23876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017518	GGT	2	6	24034	24039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017518	TGC	2	6	24060	24065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017518	TGTCGG	2	12	24104	24115	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017518	GGC	2	6	24120	24125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017518	CGG	2	6	24137	24142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017518	CGC	2	6	24248	24253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017518	ACG	2	6	24274	24279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017518	CGG	2	6	24344	24349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017518	CAT	2	6	24350	24355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017518	T	6	6	24521	24526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017518	GTG	2	6	24548	24553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017518	ATC	2	6	24576	24581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017518	GTC	2	6	24618	24623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017518	TGGCGG	2	12	24632	24643	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017518	CGT	2	6	24650	24655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017518	GC	3	6	24672	24677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017518	T	6	6	24738	24743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017518	GTT	2	6	24756	24761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017518	CGC	2	6	24764	24769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017518	TTG	2	6	25155	25160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017518	CCGT	2	8	25184	25191	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017518	GAT	2	6	25465	25470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017518	TAAA	2	8	25521	25528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017518	A	6	6	26525	26530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017518	CGG	2	6	28746	28751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017518	A	8	8	30617	30624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017518	GGCTTG	2	12	30711	30722	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017518	A	6	6	30726	30731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017518	GGGA	2	8	30732	30739	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017518	TGCC	2	8	30777	30784	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017518	A	11	11	30824	30834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017518	CTCG	2	8	30842	30849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017518	GCC	2	6	31417	31422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017518	CGGG	2	8	31456	31463	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017518	T	6	6	31478	31483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017518	TCG	2	6	31672	31677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017518	TAA	2	6	33161	33166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017518	GCG	2	6	33182	33187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017518	CCG	2	6	33248	33253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017518	CG	3	6	33252	33257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017518	ATA	2	6	33313	33318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017518	TAT	2	6	33319	33324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017518	TCA	2	6	33325	33330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017518	GTTC	2	8	33336	33343	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017518	GCC	2	6	34248	34253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017518	GCCG	2	8	34272	34279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017518	ACA	2	6	34400	34405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017518	TGG	3	9	34445	34453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017518	CG	3	6	34549	34554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017518	TGG	2	6	34561	34566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017518	TGG	2	6	34672	34677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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