MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 9236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017518	ACGGAT	2	12	946892	946903	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4002	NC_017518	TG	3	6	947956	947961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_017518	ATA	2	6	949326	949331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017518	TTA	2	6	949354	949359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017518	AGAC	2	8	949362	949369	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4006	NC_017518	TTG	2	6	949388	949393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017518	GC	3	6	949414	949419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4008	NC_017518	TGAG	2	8	949444	949451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_017518	GAT	2	6	950200	950205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_017518	TGT	2	6	952248	952253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_017518	AG	3	6	953850	953855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_017518	ACA	2	6	956489	956494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_017518	GCA	2	6	956516	956521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_017518	GATAA	2	10	956529	956538	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017518	ACA	2	6	956546	956551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_017518	TCA	2	6	956580	956585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_017518	ATT	2	6	956637	956642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017518	AAT	2	6	956858	956863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017518	CCTTA	2	10	957375	957384	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4020	NC_017518	TAT	2	6	957390	957395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017518	T	6	6	958356	958361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017518	TGA	2	6	959398	959403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017518	ACAT	2	8	959453	959460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4024	NC_017518	A	10	10	959472	959481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_017518	AT	3	6	959492	959497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_017518	AT	3	6	959539	959544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_017518	TAAT	2	8	959548	959555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017518	ATT	2	6	959565	959570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017518	TAT	2	6	959576	959581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_017518	AT	3	6	959589	959594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017518	T	8	8	959611	959618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017518	ATTTT	2	10	959620	959629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017518	GAAAA	2	10	959670	959679	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017518	TACCT	2	10	959693	959702	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4035	NC_017518	CCAA	2	8	959713	959720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_017518	TTGG	2	8	959734	959741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_017518	TTTA	2	8	959749	959756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017518	CCA	2	6	959813	959818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_017518	TTC	2	6	959862	959867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_017518	T	6	6	959871	959876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017518	TTC	2	6	959889	959894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_017518	GCA	2	6	959902	959907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_017518	TGC	2	6	959940	959945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_017518	AAC	2	6	960728	960733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_017518	TAAA	2	8	961701	961708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017518	A	8	8	961719	961726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_017518	AT	3	6	961729	961734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017518	CCG	2	6	961796	961801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4049	NC_017518	CGG	2	6	962750	962755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_017518	GCC	2	6	962758	962763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_017518	GGC	2	6	963494	963499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_017518	CGGT	2	8	964301	964308	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_017518	AATT	2	8	964356	964363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017518	AAAT	2	8	964371	964378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017518	CTTT	2	8	964449	964456	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4056	NC_017518	CTG	2	6	964536	964541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_017518	CGGT	2	8	964695	964702	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4058	NC_017518	GCA	2	6	965587	965592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_017518	TTTTG	2	10	965621	965630	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_017518	GCGCG	2	10	965635	965644	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4061	NC_017518	ATTT	2	8	966585	966592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_017518	T	7	7	966590	966596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_017518	CGGA	2	8	966672	966679	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_017518	GAT	2	6	966692	966697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017518	CGGC	2	8	968649	968656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_017518	TTG	2	6	970124	970129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_017518	GTC	2	6	970134	970139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_017518	TCCT	2	8	970187	970194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_017518	GTC	2	6	970222	970227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_017518	TCCT	2	8	970275	970282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_017518	CAGC	2	8	970286	970293	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4072	NC_017518	GTC	2	6	970306	970311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_017518	TCCT	2	8	970359	970366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4074	NC_017518	CCAG	2	8	970369	970376	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4075	NC_017518	TTTG	2	8	970439	970446	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017518	ATG	2	6	972191	972196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017518	GAA	2	6	972357	972362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017518	CTTTT	2	10	972444	972453	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4079	NC_017518	GTAA	2	8	972488	972495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017518	AACCG	6	30	972522	972551	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4082	NC_017518	CAAA	2	8	972580	972587	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_017518	AT	3	6	972591	972596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017518	AAC	2	6	972606	972611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_017518	GGGC	2	8	972717	972724	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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4087	NC_017518	AGA	2	6	972784	972789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017518	CG	3	6	974487	974492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_017518	GTA	2	6	977185	977190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_017518	GCG	2	6	977209	977214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_017518	TG	3	6	978512	978517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017518	TAA	2	6	978618	978623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_017518	GGT	2	6	982163	982168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_017518	TGGT	2	8	982175	982182	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017518	GTC	2	6	982199	982204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4097	NC_017518	ATAA	2	8	982335	982342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017518	GAC	2	6	982404	982409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_017518	AAGGAA	2	12	983265	983276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017518	ACT	2	6	983279	983284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_017518	CAT	2	6	983518	983523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_017518	T	6	6	983911	983916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017518	AAT	2	6	983918	983923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_017518	A	7	7	983981	983987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_017518	TAT	2	6	983998	984003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017518	GCA	2	6	984011	984016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_017518	ATT	2	6	984020	984025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017518	TTA	2	6	984073	984078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017518	GCG	2	6	984088	984093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_017518	ATG	2	6	984122	984127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_017518	CAT	2	6	984136	984141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_017518	ATTTAT	2	12	984165	984176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017518	TTCAAT	2	12	984177	984188	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4114	NC_017518	TCA	2	6	984717	984722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4117	NC_017518	CGA	2	6	985276	985281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_017518	A	6	6	985491	985496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_017518	TGT	2	6	985779	985784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017518	TGT	2	6	986630	986635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017518	TGT	2	6	986643	986648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_017518	TGC	2	6	986662	986667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_017518	GCA	2	6	986678	986683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_017518	AGA	2	6	986742	986747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017518	TA	3	6	988192	988197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017518	TTA	2	6	988203	988208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_017518	A	6	6	988256	988261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_017518	CGA	2	6	991907	991912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_017518	A	7	7	992089	992095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_017518	CAC	2	6	992161	992166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_017518	T	6	6	992194	992199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_017518	GT	3	6	992231	992236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_017518	TAT	2	6	992271	992276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_017518	CAAAA	2	10	992294	992303	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4135	NC_017518	A	7	7	994107	994113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4137	NC_017518	A	6	6	995069	995074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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