MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 9236

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017518	CAT	2	6	92203	92208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017518	A	6	6	92270	92275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017518	GAAG	2	8	93559	93566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017518	CAAT	2	8	93603	93610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_017518	TAAA	2	8	93629	93636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017518	TAA	2	6	93730	93735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017518	CA	3	6	93736	93741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_017518	CGC	2	6	93866	93871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_017518	GCA	2	6	93881	93886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017518	CCGC	2	8	93906	93913	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
511	NC_017518	T	6	6	95343	95348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017518	TTTC	2	8	95413	95420	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
513	NC_017518	CGG	2	6	95458	95463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_017518	AC	3	6	95482	95487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_017518	AGG	2	6	95528	95533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017518	GGAA	2	8	96844	96851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017518	AC	3	6	98203	98208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_017518	GCC	2	6	98279	98284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_017518	CAT	2	6	98356	98361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017518	GAG	2	6	98365	98370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017518	C	17	17	98384	98400	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
522	NC_017518	CCGT	2	8	98439	98446	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
523	NC_017518	TCAA	2	8	98454	98461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
524	NC_017518	GCC	2	6	98540	98545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_017518	TTAC	2	8	98601	98608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
526	NC_017518	TCT	2	6	98633	98638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017518	CTGT	2	8	100159	100166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
528	NC_017518	CGC	2	6	100321	100326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_017518	CGG	2	6	100421	100426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017518	CGA	2	6	101891	101896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017518	A	6	6	101966	101971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017518	T	6	6	102044	102049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017518	CCG	2	6	102063	102068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_017518	CGC	3	9	102069	102077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_017518	A	6	6	102078	102083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017518	TTG	2	6	103653	103658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017518	TGA	2	6	103697	103702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017518	GCG	2	6	103705	103710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017518	T	6	6	103770	103775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017518	ATTT	2	8	103811	103818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017518	GTC	2	6	103882	103887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017518	GCA	2	6	103950	103955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_017518	TAG	2	6	103960	103965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017518	TAA	2	6	103970	103975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017518	TAT	2	6	103989	103994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017518	TTAT	2	8	104014	104021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017518	ATCA	2	8	104330	104337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_017518	CA	3	6	104341	104346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_017518	ACG	2	6	104470	104475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017518	AAC	2	6	104480	104485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017518	TATT	2	8	104566	104573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017518	A	6	6	104574	104579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017518	ACCAA	2	10	104653	104662	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
554	NC_017518	CTG	2	6	104692	104697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017518	T	7	7	104704	104710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017518	A	6	6	104771	104776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017518	ATC	2	6	105039	105044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_017518	AAG	2	6	105093	105098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017518	GT	3	6	105111	105116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017518	GTT	2	6	105122	105127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017518	AAT	2	6	105198	105203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017518	GTA	2	6	105218	105223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017518	CAAC	2	8	105296	105303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_017518	AAATTT	2	12	105379	105390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017518	T	6	6	105388	105393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017518	CTTA	2	8	105399	105406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
567	NC_017518	CCA	2	6	105422	105427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_017518	ATTTA	2	10	105494	105503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017518	AAATA	2	10	105504	105513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017518	A	7	7	105519	105525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017518	ATTAA	2	10	105528	105537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017518	CTT	2	6	105578	105583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017518	AC	3	6	105609	105614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_017518	GGC	2	6	105667	105672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017518	A	6	6	105682	105687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017518	AGCA	2	8	105757	105764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_017518	A	6	6	105823	105828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017518	T	6	6	105837	105842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017518	TAA	2	6	105862	105867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017518	AAT	2	6	106051	106056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017518	T	6	6	106077	106082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017518	TGAA	2	8	106128	106135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017518	TGC	2	6	106153	106158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_017518	A	6	6	106180	106185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017518	AGC	2	6	106210	106215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_017518	TGG	2	6	106216	106221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017518	TTG	2	6	106227	106232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017518	GGT	2	6	106244	106249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017518	TGG	2	6	106285	106290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017518	TTG	2	6	106324	106329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017518	TAA	2	6	106344	106349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017518	A	6	6	106430	106435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017518	ATT	2	6	106443	106448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017518	T	7	7	106463	106469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017518	CAA	2	6	106481	106486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017518	TTC	2	6	106545	106550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017518	TAA	2	6	106553	106558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017518	T	8	8	106568	106575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017518	ATAA	2	8	106607	106614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017518	CTG	3	9	106727	106735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017518	ATG	2	6	106759	106764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017518	CAT	2	6	106782	106787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017518	ATT	2	6	106933	106938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017518	ATCA	2	8	106969	106976	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
605	NC_017518	TTA	2	6	106991	106996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017518	ATT	2	6	107011	107016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017518	T	7	7	107033	107039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017518	ATA	3	9	107045	107053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017518	T	6	6	110452	110457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017518	AAT	2	6	110460	110465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017518	ATC	2	6	110510	110515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017518	TGT	2	6	110568	110573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017518	T	6	6	110573	110578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017518	T	6	6	110802	110807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017518	GTC	2	6	110871	110876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_017518	CAG	3	9	110937	110945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017518	TAG	2	6	110949	110954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017518	TAA	2	6	110959	110964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017518	TAT	2	6	110978	110983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017518	TTAT	2	8	111003	111010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017518	AAC	2	6	111468	111473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017518	T	6	6	111553	111558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017518	CGG	2	6	111562	111567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017518	AGC	2	6	112166	112171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017518	G	7	7	112196	112202	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017518	TCG	2	6	112351	112356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017518	TA	3	6	112372	112377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017518	AAAT	2	8	112378	112385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017518	TAT	2	6	112401	112406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017518	TTA	2	6	112464	112469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017518	A	6	6	112469	112474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017518	T	6	6	112500	112505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017518	TTCC	2	8	112525	112532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_017518	CAGC	2	8	112606	112613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
635	NC_017518	GTT	2	6	112655	112660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017518	ATC	2	6	112772	112777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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638	NC_017518	AAT	2	6	112831	112836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017518	ATT	2	6	112850	112855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_017518	AAG	2	6	112960	112965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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953	NC_017518	CGG	3	9	227861	227869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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