MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis H44/76 chromosome

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017516	GGCTTG	2	12	29760	29771	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017516	TTGCCG	2	12	38018	38029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017516	AGGAAG	2	12	38081	38092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017516	TTCGGT	2	12	45350	45361	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017516	TTCGGT	2	12	45670	45681	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017516	TTCGGT	2	12	45918	45929	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017516	TTCGGT	2	12	46799	46810	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017516	GCGCAA	2	12	48167	48178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017516	ACAAAG	2	12	62874	62885	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017516	CAGGAG	2	12	86644	86655	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017516	AAATTT	2	12	104270	104281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017516	AACAAG	2	12	106456	106467	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017516	GTTTTA	2	12	108241	108252	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017516	CTTATG	2	12	114307	114318	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017516	GGAAAA	2	12	131645	131656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017516	CTGAAA	2	12	149586	149597	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017516	GGTGTC	2	12	187546	187557	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017516	CAAAAA	2	12	189758	189769	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017516	CAAAAA	2	12	190074	190085	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017516	TTCGGT	2	12	196428	196439	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017516	TTCGGT	2	12	196600	196611	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017516	TTCGGT	2	12	196769	196780	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017516	CAAAAA	2	12	219586	219597	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017516	AGCAAA	2	12	220552	220563	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017516	CAAAAA	2	12	220609	220620	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017516	TCCCTT	2	12	234113	234124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017516	TTCTTT	2	12	292408	292419	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017516	TTTTGA	2	12	292752	292763	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017516	AAGCCG	2	12	293617	293628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017516	ACAAAG	2	12	309204	309215	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017516	CTTTGC	2	12	315222	315233	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017516	TTCGGT	2	12	319324	319335	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017516	TTCGGT	2	12	319845	319856	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017516	TTCGGT	2	12	320367	320378	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017516	TTTTCA	2	12	320923	320934	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017516	TTTGAA	2	12	346948	346959	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017516	TTAAAT	2	12	384222	384233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017516	TTCGGA	2	12	387381	387392	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017516	TTCAGA	6	36	387393	387428	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017516	TTGATA	2	12	405010	405021	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017516	TGATTT	2	12	418998	419009	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017516	ACCGAA	2	12	450937	450948	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017516	GGCTGC	2	12	456532	456543	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017516	TTTCCG	2	12	460251	460262	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017516	TTAAAT	2	12	464349	464360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017516	TTCGGT	2	12	481702	481713	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017516	ATAAAA	2	12	503627	503638	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017516	CCGCTG	2	12	520801	520812	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017516	GAAATG	2	12	568138	568149	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017516	ACAAAG	2	12	602613	602624	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017516	GGCTGC	2	12	630840	630851	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017516	ACCGAA	2	12	632017	632028	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017516	TTTCTT	2	12	634737	634748	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017516	TTCGGT	2	12	660211	660222	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017516	TTTAAA	2	12	660651	660662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017516	TCTGAA	2	12	666097	666108	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017516	AAAACC	2	12	668116	668127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017516	CCACAC	2	12	668589	668600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017516	GGGTTT	2	12	670448	670459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017516	TTAAAT	2	12	678969	678980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017516	TTATTT	2	12	722108	722119	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017516	ATTTGC	2	12	730041	730052	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017516	ATTTAA	2	12	750691	750702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017516	TCGTTT	2	12	755889	755900	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017516	TTAAAT	2	12	763660	763671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017516	ATTTAA	2	12	763737	763748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017516	TCCGAT	2	12	770089	770100	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017516	CGGTTT	2	12	772183	772194	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017516	TGGGTT	2	12	788803	788814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017516	TTTTTG	2	12	800271	800282	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017516	GCAGCC	2	12	815284	815295	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017516	TTAAAT	2	12	817577	817588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017516	TTAAAT	2	12	818045	818056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017516	TGCCTG	2	12	818209	818220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017516	TATTTT	2	12	859419	859430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017516	TTAAAT	2	12	879399	879410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017516	ATTTAT	2	12	879426	879437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017516	CGCGGT	2	12	889097	889108	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017516	TAAACA	2	12	893153	893164	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017516	AATTAA	2	12	894861	894872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017516	ATTTTT	2	12	897530	897541	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017516	GCCGTC	2	12	897678	897689	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017516	CTTTGT	2	12	904751	904762	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017516	TATTTA	2	12	906004	906015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017516	ATTGGG	2	12	927853	927864	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017516	GGTTTT	2	12	928366	928377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017516	TATCGC	2	12	928521	928532	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017516	TTTGTT	2	12	929785	929796	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017516	TCGGAT	2	12	930174	930185	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017516	CATATT	2	12	942912	942923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017516	AGCCGG	2	12	1022286	1022297	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017516	CTGAAA	2	12	1022399	1022410	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017516	GGTTCA	2	12	1049500	1049511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017516	TCGGTT	2	12	1103127	1103138	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017516	CGATGA	2	12	1103997	1104008	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017516	GCTTTG	2	12	1164361	1164372	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017516	ACACGA	2	12	1165043	1165054	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017516	TTAAAT	2	12	1202225	1202236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017516	TCAAAT	2	12	1216474	1216485	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017516	TTAAAT	2	12	1239043	1239054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017516	TGCCGA	2	12	1245064	1245075	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017516	CAAACC	2	12	1260250	1260261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017516	GCCGAA	2	12	1269323	1269334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017516	AAACAC	2	12	1274407	1274418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017516	ATTTAA	2	12	1279391	1279402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017516	TTAAAT	2	12	1287246	1287257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017516	GGTTTT	2	12	1299216	1299227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017516	CTTTTG	2	12	1301634	1301645	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017516	ATTTAA	2	12	1304006	1304017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017516	ATAAAA	2	12	1309228	1309239	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017516	CAAAGA	2	12	1316665	1316676	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017516	TTAAAT	2	12	1327779	1327790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017516	GAAAAA	2	12	1344406	1344417	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017516	TTCGGT	2	12	1359006	1359017	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017516	GCAGCC	2	12	1359431	1359442	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017516	TTTAAA	2	12	1364994	1365005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017516	TTTAAA	2	12	1365073	1365084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017516	TGATTA	2	12	1367609	1367620	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017516	AAAACC	2	12	1368571	1368582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017516	TTCGGT	2	12	1387954	1387965	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017516	TCGGTT	2	12	1388390	1388401	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017516	ATTGAA	2	12	1395478	1395489	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017516	ATAAAT	2	12	1395490	1395501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017516	ATCCTT	2	12	1408936	1408947	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017516	ATTTAA	2	12	1417103	1417114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017516	CATCGA	2	12	1430155	1430166	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017516	TCCGTA	2	12	1432315	1432326	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017516	GCAACA	2	12	1469419	1469430	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017516	TCCGAA	2	12	1515033	1515044	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017516	TATTTT	2	12	1524870	1524881	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017516	GCAGGC	2	12	1528399	1528410	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017516	CCGATA	2	12	1528447	1528458	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017516	CAAACG	2	12	1541723	1541734	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017516	ATCGGC	2	12	1558848	1558859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017516	GTTCGG	2	12	1566958	1566969	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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137	NC_017516	TTAAGG	2	12	1567336	1567347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_017516	CCTGCA	2	12	1613497	1613508	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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148	NC_017516	CGGCAT	2	12	1712946	1712957	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_017516	AAAACC	2	12	1723748	1723759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_017516	TTAAAT	2	12	1973894	1973905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.