MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis H44/76 chromosome

Total Repeats: 9030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017516	CGG	3	9	1167672	1167680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_017516	T	6	6	1167690	1167695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017516	CGG	3	9	1167749	1167757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_017516	T	6	6	1167767	1167772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017516	G	6	6	1167870	1167875	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017516	GCG	2	6	1167908	1167913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_017516	GGC	2	6	1167963	1167968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_017516	TCGG	2	8	1167979	1167986	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5009	NC_017516	CGG	2	6	1167998	1168003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_017516	CGG	2	6	1170976	1170981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_017516	CGG	2	6	1171008	1171013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017516	AGC	2	6	1171040	1171045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_017516	CCGT	2	8	1171108	1171115	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_017516	GCG	2	6	1171118	1171123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_017516	CCG	2	6	1171177	1171182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_017516	T	6	6	1171209	1171214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017516	TCG	2	6	1171233	1171238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_017516	CGA	2	6	1171271	1171276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_017516	CGG	2	6	1171285	1171290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_017516	GCC	2	6	1171397	1171402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_017516	GCGG	2	8	1171404	1171411	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_017516	CGG	2	6	1171413	1171418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_017516	CAG	2	6	1171439	1171444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_017516	TCGG	2	8	1171460	1171467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_017516	GCC	2	6	1171469	1171474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_017516	GGC	2	6	1171486	1171491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_017516	CGG	2	6	1171507	1171512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_017516	GGC	2	6	1171514	1171519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_017516	GGC	2	6	1171549	1171554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_017516	TCG	2	6	1171565	1171570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_017516	CCG	2	6	1171587	1171592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_017516	GCC	2	6	1171594	1171599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_017516	GCGG	2	8	1171615	1171622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_017516	GTC	2	6	1171660	1171665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017516	GCG	2	6	1171726	1171731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_017516	CGG	2	6	1171776	1171781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017516	A	7	7	1172389	1172395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_017516	AGC	2	6	1177734	1177739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_017516	TTTG	2	8	1177827	1177834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017516	A	8	8	1178496	1178503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017516	GTC	2	6	1178505	1178510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_017516	GAC	2	6	1178520	1178525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_017516	TG	3	6	1178714	1178719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017516	T	6	6	1179494	1179499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017516	AAGA	2	8	1182714	1182721	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017516	TGC	2	6	1183742	1183747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_017516	T	7	7	1184920	1184926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017516	CG	3	6	1184937	1184942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_017516	GATT	2	8	1184986	1184993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017516	A	7	7	1185029	1185035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017516	AAT	2	6	1185092	1185097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017516	GTC	3	9	1185126	1185134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_017516	CCG	2	6	1185193	1185198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_017516	GGC	2	6	1185210	1185215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_017516	GAC	2	6	1185281	1185286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_017516	CCG	2	6	1185367	1185372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_017516	CAG	2	6	1185401	1185406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_017516	GAC	2	6	1185452	1185457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_017516	ATCA	2	8	1185479	1185486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5060	NC_017516	TAT	2	6	1185490	1185495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_017516	AAT	2	6	1190074	1190079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017516	TCAT	2	8	1192196	1192203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_017516	T	6	6	1192424	1192429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017516	CCTC	2	8	1194181	1194188	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5065	NC_017516	CAA	2	6	1194271	1194276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_017516	A	6	6	1194275	1194280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017516	GCC	2	6	1194281	1194286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_017516	TGT	2	6	1194287	1194292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017516	AAC	2	6	1196035	1196040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_017516	CAA	2	6	1196329	1196334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017516	CAT	2	6	1196369	1196374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_017516	GTTTC	2	10	1198466	1198475	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5073	NC_017516	TCT	2	6	1198497	1198502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_017516	GCT	2	6	1198518	1198523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_017516	GATA	2	8	1198598	1198605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_017516	GCCT	2	8	1198622	1198629	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_017516	T	7	7	1198683	1198689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017516	TTAA	2	8	1198705	1198712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017516	CCG	2	6	1198726	1198731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_017516	ATT	2	6	1198812	1198817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017516	ATT	2	6	1198832	1198837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017516	T	7	7	1198868	1198874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017516	T	6	6	1198922	1198927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017516	GCT	2	6	1199082	1199087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_017516	GCA	3	9	1199239	1199247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_017516	GAA	2	6	1199272	1199277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017516	CTGT	2	8	1199344	1199351	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5088	NC_017516	TCA	2	6	1199408	1199413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_017516	GAC	2	6	1199569	1199574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_017516	CAT	2	6	1199580	1199585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_017516	A	7	7	1199743	1199749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017516	T	7	7	1199783	1199789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017516	GC	3	6	1200472	1200477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5094	NC_017516	AAC	2	6	1200481	1200486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_017516	ACC	2	6	1200504	1200509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_017516	A	6	6	1201916	1201921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017516	A	6	6	1201953	1201958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017516	ACA	2	6	1201980	1201985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_017516	TCCG	2	8	1202025	1202032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5100	NC_017516	ATTA	2	8	1202122	1202129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017516	TAT	2	6	1202133	1202138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_017516	AGTG	2	8	1202189	1202196	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017516	CCAC	2	8	1202200	1202207	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5104	NC_017516	TTAAAT	2	12	1202225	1202236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017516	TA	3	6	1202772	1202777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017516	ACC	2	6	1202807	1202812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5107	NC_017516	CAC	2	6	1202820	1202825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_017516	T	6	6	1203064	1203069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017516	A	6	6	1203156	1203161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017516	AAC	2	6	1203185	1203190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_017516	A	6	6	1203199	1203204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017516	CGG	2	6	1203214	1203219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_017516	CGA	2	6	1203283	1203288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_017516	T	6	6	1203408	1203413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017516	TTG	2	6	1204415	1204420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017516	CAT	2	6	1205732	1205737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_017516	AAAC	2	8	1206696	1206703	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_017516	TAT	2	6	1207400	1207405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_017516	CGC	2	6	1207406	1207411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_017516	TC	3	6	1209024	1209029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_017516	T	7	7	1209040	1209046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017516	A	6	6	1209049	1209054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017516	GCCT	2	8	1209071	1209078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_017516	CG	3	6	1209131	1209136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5125	NC_017516	GGC	2	6	1209153	1209158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_017516	GTC	2	6	1209160	1209165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_017516	CGC	2	6	1209215	1209220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_017516	AAAT	2	8	1209273	1209280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017516	CAG	2	6	1209288	1209293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_017516	GCC	2	6	1209359	1209364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5132	NC_017516	TTG	2	6	1209419	1209424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5251	NC_017516	A	7	7	1239651	1239657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_017516	AT	4	8	1239665	1239672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5256	NC_017516	ACA	2	6	1239746	1239751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5262	NC_017516	CCTA	2	8	1239802	1239809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5263	NC_017516	CTT	2	6	1239818	1239823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5266	NC_017516	ATC	2	6	1239924	1239929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5267	NC_017516	TGA	2	6	1239935	1239940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5274	NC_017516	T	6	6	1248082	1248087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5281	NC_017516	TTG	2	6	1250835	1250840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5293	NC_017516	AGC	2	6	1251574	1251579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5296	NC_017516	A	7	7	1251600	1251606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5301	NC_017516	TGGA	2	8	1251783	1251790	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5302	NC_017516	A	6	6	1251904	1251909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5303	NC_017516	A	6	6	1251969	1251974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5380	NC_017516	GCCGAA	2	12	1269323	1269334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5384	NC_017516	GAA	2	6	1269530	1269535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5385	NC_017516	A	6	6	1269619	1269624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5386	NC_017516	GCC	2	6	1269927	1269932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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