MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis M04-240196 chromosome

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017515	GGCTTG	2	12	27472	27483	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017515	TTGCCG	2	12	35731	35742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017515	CGGCAT	2	12	36459	36470	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017515	CGGTTT	2	12	43214	43225	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017515	TTATTT	2	12	43624	43635	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017515	GGTAAT	2	12	52713	52724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017515	AAGCCC	2	12	52819	52830	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017515	TGTATG	2	12	53890	53901	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017515	ACAAAG	2	12	65931	65942	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017515	CAAACA	2	12	84517	84528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017515	AAATTT	2	12	110243	110254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017515	AACAAG	2	12	112429	112440	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017515	GTTTTA	2	12	114215	114226	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017515	CTTATG	2	12	120281	120292	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017515	GGAAAA	2	12	137621	137632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017515	CTGAAA	2	12	155563	155574	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017515	GGTGTC	2	12	193682	193693	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017515	CAAAAA	2	12	195894	195905	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017515	TTCGGT	2	12	202241	202252	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017515	TTCGGT	2	12	202413	202424	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017515	TTCGGT	2	12	202582	202593	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017515	CAAAAA	2	12	225258	225269	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017515	AGCAAA	2	12	226224	226235	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017515	CAAAAA	2	12	226281	226292	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017515	TCCCTT	2	12	240707	240718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017515	ACAAAG	2	12	314902	314913	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017515	CTTTGC	2	12	320925	320936	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017515	TTCGGT	2	12	325027	325038	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017515	TTCGGT	2	12	326090	326101	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017515	TTTTCA	2	12	326630	326641	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017515	TTTGAA	2	12	353131	353142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017515	CAAACA	2	12	371340	371351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017515	TTAAAT	2	12	392161	392172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017515	TTCGGA	2	12	395326	395337	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017515	AGATTC	8	48	395347	395394	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017515	TTGATA	2	12	412827	412838	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017515	TGATTT	2	12	426811	426822	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017515	AGCCCA	2	12	436848	436859	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017515	ACCGAA	2	12	458513	458524	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017515	TTTCCG	2	12	468768	468779	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017515	TTAAAT	2	12	472863	472874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017515	CCGTCC	2	12	481684	481695	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017515	TTCGGT	2	12	481871	481882	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017515	TTCGGT	2	12	490717	490728	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017515	CGGTAT	2	12	494879	494890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017515	ATAAAA	2	12	512696	512707	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017515	GTATAT	2	12	542102	542113	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017515	GAAATG	2	12	574571	574582	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017515	GGAAGG	2	12	595842	595853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017515	ACAAAG	2	12	608820	608831	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017515	ACCGAA	2	12	637894	637905	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017515	CATGGT	2	12	640708	640719	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017515	ATTTAA	2	12	657621	657632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017515	TTCGGT	2	12	657876	657887	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017515	TTTAAA	2	12	658316	658327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017515	TCTGAA	2	12	663912	663923	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017515	AAAACC	2	12	665932	665943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017515	TCGTTT	2	12	746190	746201	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017515	TTAAAT	2	12	753968	753979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017515	ATTTAA	2	12	754045	754056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017515	TCCGAT	2	12	760382	760393	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017515	CGGTTT	2	12	762476	762487	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017515	TGGGTT	2	12	779524	779535	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017515	TTTTTG	2	12	790377	790388	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017515	TTCGGT	2	12	805112	805123	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017515	TTATTT	2	12	805880	805891	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017515	TGCCTG	2	12	815119	815130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017515	TATTTT	2	12	856094	856105	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017515	ATTTAA	2	12	869460	869471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017515	TTAAAT	2	12	875530	875541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017515	ATTTAT	2	12	875557	875568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017515	AATTAA	2	12	883815	883826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017515	ATTTTT	2	12	886484	886495	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017515	GCCGTC	2	12	886632	886643	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017515	CTTTGT	2	12	893727	893738	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017515	TTTGTT	2	12	918739	918750	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017515	TCGGAT	2	12	919128	919139	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017515	CACGAA	2	12	930670	930681	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017515	CATATT	2	12	931913	931924	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017515	AGCCGG	2	12	1011954	1011965	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017515	CTGAAA	2	12	1012067	1012078	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017515	CACAGC	2	12	1039190	1039201	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017515	CAAACA	2	12	1052722	1052733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017515	ACCCGC	2	12	1059834	1059845	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017515	CGGTTT	2	12	1094223	1094234	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017515	CGATGA	2	12	1095132	1095143	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017515	AACGGG	2	12	1136887	1136898	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017515	TTAAAT	2	12	1193516	1193527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017515	ACTTTT	2	12	1193925	1193936	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017515	TTAAAT	2	12	1198732	1198743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017515	TCAAAT	2	12	1208041	1208052	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017515	TTAAAT	2	12	1230537	1230548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017515	TGCCGA	2	12	1236558	1236569	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017515	CAAACC	2	12	1252155	1252166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017515	GCCGAA	2	12	1261228	1261239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017515	AAACAC	2	12	1266329	1266340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017515	ATTTAA	2	12	1271360	1271371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017515	TTAAAT	2	12	1279785	1279796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017515	GTGTGG	2	12	1291398	1291409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017515	GGTTTT	2	12	1291871	1291882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017515	CTTTTG	2	12	1294290	1294301	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017515	CAAACG	2	12	1296507	1296518	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017515	ATTTAA	2	12	1296662	1296673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017515	ATAAAA	2	12	1302159	1302170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017515	CAAAGA	2	12	1309593	1309604	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017515	TTAAAT	2	12	1320699	1320710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017515	GAAAAA	2	12	1337218	1337229	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017515	ATTTCG	2	12	1347180	1347191	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017515	TTCGGT	2	12	1351157	1351168	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017515	TTTAAA	2	12	1357028	1357039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017515	TTTAAA	2	12	1357107	1357118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017515	TGATTA	2	12	1359643	1359654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017515	AAAACC	2	12	1360605	1360616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017515	TTCGGT	2	12	1380077	1380088	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017515	TTCGGT	2	12	1380357	1380368	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017515	TTCGGT	2	12	1380661	1380672	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017515	TTCGGT	2	12	1380965	1380976	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017515	TCGGTT	2	12	1381421	1381432	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017515	ATTGAA	2	12	1389485	1389496	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017515	ATAAAT	2	12	1389497	1389508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017515	ATCCTT	2	12	1403062	1403073	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017515	ATTTAA	2	12	1409199	1409210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017515	ATCGAC	2	12	1421799	1421810	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017515	ATTTAA	2	12	1437237	1437248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017515	GCAACA	2	12	1458478	1458489	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017515	TTAAAT	2	12	1500101	1500112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017515	TCCGAA	2	12	1504232	1504243	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017515	TGCAGA	2	12	1510745	1510756	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017515	TATTTT	2	12	1514143	1514154	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017515	GCAGGC	2	12	1517672	1517683	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017515	CCGATA	2	12	1517720	1517731	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017515	ATCGGC	2	12	1546949	1546960	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017515	GTTCGG	2	12	1555057	1555068	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017515	TTAAGG	2	12	1555482	1555493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017515	TTTAAA	2	12	1560932	1560943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017515	CAAAAA	2	12	1561904	1561915	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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162	NC_017515	TTAAAT	2	12	1857214	1857225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017515	TCCGGT	2	12	1885913	1885924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.