MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis M04-240196 chromosome

Total Repeats: 9094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017515	CGT	2	6	230435	230440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017515	CTGCC	2	10	230446	230455	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1003	NC_017515	CCT	2	6	230467	230472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_017515	TAA	2	6	230499	230504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017515	AT	3	6	230518	230523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017515	ATA	2	6	230574	230579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017515	C	13	13	230607	230619	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1008	NC_017515	CCG	2	6	230685	230690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_017515	TCA	2	6	230702	230707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017515	CAA	2	6	230722	230727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017515	T	6	6	230834	230839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017515	GTC	2	6	230875	230880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_017515	CGA	2	6	231021	231026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017515	T	7	7	231111	231117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017515	GGTA	2	8	231186	231193	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017515	ATA	2	6	231218	231223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017515	T	6	6	231286	231291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017515	TGT	2	6	231331	231336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017515	TAT	2	6	231446	231451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017515	CGC	2	6	231568	231573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_017515	CGG	3	9	231642	231650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017515	GTTG	2	8	232921	232928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017515	GCA	2	6	233031	233036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017515	TGT	2	6	233042	233047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017515	CGA	2	6	233054	233059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017515	GTT	2	6	233330	233335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017515	AAAT	2	8	233342	233349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017515	GGT	2	6	233351	233356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017515	TCTA	2	8	233382	233389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_017515	TAT	2	6	233395	233400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017515	GCG	2	6	233433	233438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_017515	TG	3	6	233462	233467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017515	GGC	2	6	233498	233503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017515	A	6	6	234746	234751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017515	ATG	2	6	234812	234817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017515	CGG	2	6	234833	234838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_017515	GGCA	2	8	235595	235602	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_017515	T	7	7	236463	236469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017515	GGTA	2	8	236473	236480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017515	TCCG	2	8	236481	236488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_017515	GAC	2	6	236509	236514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_017515	A	6	6	239328	239333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017515	ATG	2	6	239498	239503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017515	T	6	6	239507	239512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017515	ACAA	2	8	239531	239538	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_017515	CCG	2	6	239558	239563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_017515	TCTT	2	8	240598	240605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_017515	CCG	2	6	240676	240681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_017515	CAG	2	6	240696	240701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_017515	TCCCTT	2	12	240707	240718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_017515	CT	3	6	240784	240789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_017515	CTCC	2	8	240798	240805	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1053	NC_017515	GGC	2	6	241607	241612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017515	ATA	2	6	241622	241627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017515	GTT	2	6	242875	242880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017515	TGT	2	6	245278	245283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_017515	GCG	2	6	245321	245326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_017515	TCT	2	6	245338	245343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_017515	TGC	2	6	245345	245350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_017515	ATC	2	6	245351	245356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017515	TGC	2	6	245376	245381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017515	GAC	2	6	245402	245407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017515	A	6	6	247777	247782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017515	AAC	2	6	247822	247827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017515	CCG	2	6	247845	247850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_017515	GACG	2	8	247953	247960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_017515	GAA	2	6	248014	248019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_017515	CGG	2	6	248566	248571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_017515	ATC	2	6	248585	248590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_017515	TGG	2	6	248646	248651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_017515	ATT	2	6	248704	248709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017515	AATT	2	8	248786	248793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_017515	GTT	2	6	248794	248799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017515	TTC	2	6	248849	248854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017515	AAT	2	6	248901	248906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017515	CTCTT	2	10	248912	248921	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1077	NC_017515	ATA	2	6	248931	248936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017515	TCA	2	6	248940	248945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_017515	ATA	2	6	248967	248972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017515	ATTTT	2	10	248973	248982	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017515	AAGT	2	8	248992	248999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017515	CCA	2	6	249028	249033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_017515	ATC	2	6	249075	249080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_017515	GTC	2	6	249514	249519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_017515	ATG	2	6	249628	249633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017515	ATCA	2	8	249666	249673	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_017515	CA	3	6	249677	249682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1088	NC_017515	AAC	2	6	249816	249821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_017515	ATT	2	6	249898	249903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017515	CAG	2	6	249926	249931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_017515	CATTT	2	10	250040	250049	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1092	NC_017515	A	7	7	252227	252233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017515	CAG	2	6	252242	252247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_017515	TA	4	8	252292	252299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017515	CGA	2	6	252326	252331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_017515	TATT	2	8	252522	252529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017515	T	7	7	252533	252539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017515	ATT	2	6	252596	252601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017515	GTC	2	6	255790	255795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017515	ACG	2	6	255800	255805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_017515	TAA	2	6	255951	255956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017515	GGAT	2	8	255975	255982	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017515	GAC	2	6	256001	256006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017515	CAAG	2	8	256010	256017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_017515	CAA	2	6	256029	256034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017515	GTC	2	6	256047	256052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_017515	GAC	2	6	256089	256094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017515	GTC	2	6	256126	256131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017515	AAAC	2	8	256158	256165	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_017515	A	6	6	258046	258051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017515	CGG	2	6	258077	258082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_017515	A	6	6	258127	258132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017515	GTT	3	9	258133	258141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017515	TA	3	6	258195	258200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017515	GTT	2	6	258460	258465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017515	CGG	2	6	258535	258540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017515	ATTG	2	8	258655	258662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017515	GAC	2	6	258702	258707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017515	ATT	2	6	258717	258722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017515	GAAC	2	8	258743	258750	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_017515	AGGT	2	8	263638	263645	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017515	GTC	2	6	264249	264254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_017515	GAC	2	6	264280	264285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017515	AAT	2	6	264340	264345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017515	AAAC	2	8	264721	264728	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_017515	AATC	2	8	264740	264747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_017515	TCAA	2	8	264752	264759	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_017515	CGT	2	6	266813	266818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_017515	AACC	2	8	266825	266832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_017515	TTTTA	2	10	266846	266855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017515	GT	3	6	268371	268376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017515	GCC	2	6	269822	269827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_017515	CGC	2	6	269900	269905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_017515	TTCA	2	8	270278	270285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_017515	CAG	2	6	271509	271514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_017515	AGGA	2	8	274398	274405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1409	NC_017515	GCA	2	6	326544	326549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1439	NC_017515	CGG	2	6	327712	327717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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