MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis M04-240196 chromosome

Total Repeats: 9094

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_017515	CCCGT	2	10	2230052	2230061	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9002	NC_017515	GCG	2	6	2230064	2230069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_017515	T	7	7	2231295	2231301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_017515	TA	3	6	2232253	2232258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_017515	AAC	2	6	2232293	2232298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_017515	TCA	3	9	2232336	2232344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_017515	T	7	7	2232358	2232364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_017515	CCG	2	6	2232423	2232428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9009	NC_017515	TCCTT	2	10	2232451	2232460	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9010	NC_017515	CTTT	2	8	2232473	2232480	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9011	NC_017515	T	7	7	2233456	2233462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_017515	CAAA	2	8	2233468	2233475	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9013	NC_017515	T	6	6	2233478	2233483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_017515	CAT	2	6	2233492	2233497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_017515	A	6	6	2235724	2235729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_017515	CTT	2	6	2235748	2235753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_017515	ACC	2	6	2235775	2235780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9018	NC_017515	AC	4	8	2235803	2235810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9019	NC_017515	CTG	2	6	2235811	2235816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_017515	AAC	2	6	2235879	2235884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_017515	AAAT	2	8	2235895	2235902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_017515	ATA	2	6	2235980	2235985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_017515	AGC	2	6	2235997	2236002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_017515	TCC	2	6	2236007	2236012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9025	NC_017515	AT	3	6	2236020	2236025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_017515	TTCT	2	8	2236117	2236124	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9027	NC_017515	ATT	2	6	2236705	2236710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_017515	T	6	6	2236709	2236714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_017515	CGA	2	6	2236766	2236771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_017515	TA	3	6	2236838	2236843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_017515	GCG	2	6	2236965	2236970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9032	NC_017515	AAGA	2	8	2237042	2237049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_017515	A	6	6	2238054	2238059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_017515	CGA	2	6	2238120	2238125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_017515	AAAC	2	8	2238277	2238284	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9036	NC_017515	A	7	7	2238293	2238299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_017515	ATC	2	6	2238328	2238333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_017515	ACA	2	6	2238362	2238367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_017515	ATT	2	6	2238412	2238417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_017515	T	6	6	2238521	2238526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_017515	A	7	7	2238539	2238545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_017515	TTCA	2	8	2238549	2238556	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9043	NC_017515	CAT	2	6	2239187	2239192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_017515	GAA	2	6	2240541	2240546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_017515	TAG	2	6	2240551	2240556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_017515	CAAA	2	8	2240560	2240567	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9047	NC_017515	A	6	6	2240615	2240620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_017515	GTC	2	6	2240962	2240967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9049	NC_017515	GAC	2	6	2240993	2240998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_017515	GAC	2	6	2241629	2241634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_017515	TAA	2	6	2241640	2241645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_017515	GTC	2	6	2241650	2241655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9053	NC_017515	CCT	2	6	2243377	2243382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9054	NC_017515	GCT	2	6	2243392	2243397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9055	NC_017515	AAACC	2	10	2243412	2243421	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9056	NC_017515	TTC	2	6	2243422	2243427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_017515	ATTC	2	8	2243462	2243469	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9058	NC_017515	TAA	2	6	2243550	2243555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_017515	GCC	2	6	2243571	2243576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9060	NC_017515	GAC	2	6	2243589	2243594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_017515	CTG	2	6	2243609	2243614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_017515	T	6	6	2243680	2243685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_017515	ATCGG	2	10	2243716	2243725	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9064	NC_017515	GCA	2	6	2243774	2243779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9065	NC_017515	CAG	2	6	2243817	2243822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_017515	CTGC	2	8	2243828	2243835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9067	NC_017515	ATTT	2	8	2243841	2243848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_017515	CA	3	6	2243854	2243859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9069	NC_017515	T	6	6	2243900	2243905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_017515	ATTGC	2	10	2243934	2243943	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9071	NC_017515	TTC	2	6	2243946	2243951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9072	NC_017515	GCA	2	6	2243963	2243968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9073	NC_017515	ATA	2	6	2244030	2244035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_017515	T	6	6	2244154	2244159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_017515	AGC	2	6	2244195	2244200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9076	NC_017515	CG	3	6	2244209	2244214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9077	NC_017515	GCC	2	6	2244386	2244391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9078	NC_017515	TCA	2	6	2244395	2244400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9079	NC_017515	T	8	8	2244407	2244414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9080	NC_017515	GC	3	6	2244429	2244434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9081	NC_017515	ATT	2	6	2245242	2245247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_017515	TAT	2	6	2245270	2245275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_017515	GATAA	2	10	2245312	2245321	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_017515	A	6	6	2245331	2245336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_017515	TGT	2	6	2246079	2246084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_017515	TTAAAT	2	12	2246122	2246133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_017515	TA	3	6	2247296	2247301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_017515	TGTAT	2	10	2247332	2247341	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_017515	ACT	2	6	2247376	2247381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9090	NC_017515	ATG	2	6	2247466	2247471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_017515	TGA	2	6	2247476	2247481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_017515	T	6	6	2247590	2247595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_017515	TAA	2	6	2247600	2247605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_017515	A	6	6	2250411	2250416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.