MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis M01-240149 chromosome

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017514	CAATCA	2	12	18036	18047	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017514	GGCTTG	2	12	27737	27748	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017514	TTGCCG	2	12	36002	36013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017514	CGGCAT	2	12	36731	36742	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017514	ACAAAG	2	12	57499	57510	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017514	CAGGAG	2	12	83458	83469	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017514	CGCGGT	2	12	102375	102386	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017514	AAATTT	2	12	103651	103662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017514	CGCGGT	2	12	109364	109375	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017514	ACAAAG	2	12	182782	182793	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017514	AAGCCG	2	12	202557	202568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017514	TTTTGT	2	12	211213	211224	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017514	CGGAAG	2	12	228336	228347	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017514	CAAAAA	2	12	249354	249365	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017514	TTTGCA	2	12	255105	255116	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017514	TGCAGT	2	12	256152	256163	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017514	ATTTAA	2	12	297957	297968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017514	CAAAAA	2	12	301079	301090	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017514	GCAGGG	2	12	302465	302476	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017514	GGGGCG	2	12	310523	310534	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017514	ATTTAA	2	12	319345	319356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017514	TTAAAT	2	12	360838	360849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017514	CAACCC	2	12	367233	367244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017514	TTTTGT	2	12	378780	378791	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017514	TTTTAC	2	12	404472	404483	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017514	ATTTAA	2	12	411558	411569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017514	GTAGGC	2	12	415846	415857	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017514	ACCGAA	2	12	420587	420598	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017514	ACCGAA	2	12	420787	420798	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017514	AACCGG	2	12	423220	423231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017514	TTAAAT	2	12	451991	452002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017514	GAATTT	2	12	455201	455212	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017514	ATTTAA	2	12	456977	456988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017514	ACCAAC	2	12	488025	488036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017514	ATTCAA	2	12	503586	503597	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017514	ATAAAA	2	12	504147	504158	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017514	ATCTTC	2	12	506298	506309	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017514	GAAATG	2	12	565973	565984	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017514	ACAAAG	2	12	601251	601262	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017514	GGCGAA	2	12	604909	604920	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017514	TGATTT	2	12	610569	610580	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017514	GGCTGC	2	12	629979	629990	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017514	ACCGAA	2	12	630632	630643	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017514	CAGGAT	2	12	654795	654806	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017514	CGTATC	2	12	659540	659551	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017514	TTAAAT	2	12	670326	670337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017514	TCGTTT	2	12	737061	737072	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017514	TCCGAT	2	12	751357	751368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017514	AACCGA	2	12	764990	765001	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017514	GCAAAT	2	12	765975	765986	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017514	TTTCTT	2	12	767602	767613	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017514	TTTTTG	2	12	789618	789629	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017514	TTCGGT	2	12	804235	804246	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017514	TGCCTG	2	12	807750	807761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017514	ATTTAA	2	12	858250	858261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017514	TTAAAT	2	12	863322	863333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017514	ATTTAT	2	12	863349	863360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017514	CTTTGT	2	12	882165	882176	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017514	TTAAAT	2	12	910557	910568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017514	CATATT	2	12	921769	921780	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017514	CTGAAA	2	12	1001826	1001837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017514	CACAGC	2	12	1029277	1029288	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017514	GACGAA	2	12	1037424	1037435	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017514	GGTTTG	2	12	1042839	1042850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017514	TCGGCA	2	12	1058021	1058032	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017514	ATTTAA	2	12	1063731	1063742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017514	TCGGTT	2	12	1109578	1109589	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017514	CGATGA	2	12	1110448	1110459	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017514	CAGAGG	2	12	1177994	1178005	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017514	TCAAAT	2	12	1204079	1204090	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017514	GCCGAA	2	12	1225806	1225817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017514	TCATTT	2	12	1228106	1228117	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017514	AAACAC	2	12	1231569	1231580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017514	ATTTAA	2	12	1236553	1236564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017514	TTAAAT	2	12	1244154	1244165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017514	ATCGGC	2	12	1246214	1246225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017514	GTGTGG	2	12	1255561	1255572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017514	GGTTTT	2	12	1256034	1256045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017514	CAAACG	2	12	1260667	1260678	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017514	ATTTAA	2	12	1260822	1260833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017514	ATAAAA	2	12	1266351	1266362	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017514	ATCTTC	2	12	1268502	1268513	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017514	CAAAGA	2	12	1273786	1273797	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017514	TTAAAT	2	12	1285666	1285677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017514	GAAAAA	2	12	1302175	1302186	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017514	ATTTAA	2	12	1321879	1321890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017514	TTTAAA	2	12	1321959	1321970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017514	TGATTA	2	12	1324497	1324508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017514	TCGGTT	2	12	1342541	1342552	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017514	ATTGAA	2	12	1350439	1350450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017514	ATAAAT	2	12	1350451	1350462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017514	TCCGTA	2	12	1387877	1387888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017514	ATTTAA	2	12	1402369	1402380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017514	ACCAAC	2	12	1413418	1413429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017514	GCAACA	2	12	1423679	1423690	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017514	TCCGAA	2	12	1467902	1467913	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017514	TATTTT	2	12	1477842	1477853	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017514	GCAGGC	2	12	1481374	1481385	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017514	CCGATA	2	12	1481422	1481433	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017514	CAAACG	2	12	1493701	1493712	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017514	ATTTAA	2	12	1509721	1509732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017514	GTTCGG	2	12	1519809	1519820	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017514	TTAAAT	2	12	1519862	1519873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017514	TTAAGG	2	12	1520187	1520198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017514	TTTAAA	2	12	1525638	1525649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017514	TTTAAA	2	12	1525717	1525728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017514	CAAAAA	2	12	1527739	1527750	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017514	CCTGCA	2	12	1568326	1568337	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017514	ACATAA	2	12	1579872	1579883	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017514	TCATTA	2	12	1581265	1581276	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017514	GTGTCC	2	12	1614648	1614659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017514	TTTGAA	2	12	1644919	1644930	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017514	ATTTTT	2	12	1648944	1648955	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017514	GCCGTC	2	12	1649092	1649103	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017514	AATTAA	2	12	1653880	1653891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017514	GAAAAA	2	12	1655830	1655841	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017514	GTTTTT	2	12	1655907	1655918	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017514	AAACCG	2	12	1657254	1657265	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017514	TAAATT	2	12	1683378	1683389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017514	CCCAAG	2	12	1685982	1685993	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017514	TGGATT	2	12	1698587	1698598	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017514	ATTTAA	2	12	1698791	1698802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017514	ATTTTG	2	12	1731428	1731439	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017514	ATTTTG	2	12	1738046	1738057	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017514	ATTTTT	2	12	1766245	1766256	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017514	GAAATA	2	12	1787104	1787115	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017514	ATTTAA	2	12	1802664	1802675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017514	CGGAAA	2	12	1806759	1806770	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017514	GCAGCC	2	12	1809586	1809597	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017514	AAATCA	2	12	1848869	1848880	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017514	CCATTC	2	12	1853379	1853390	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017514	TATCAA	2	12	1862879	1862890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017514	CTGAAT	2	12	1880098	1880109	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017514	ATTTAA	2	12	1883262	1883273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017514	CGGACA	2	12	1889513	1889524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017514	TTCAAA	2	12	1919785	1919796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017514	ATTTAA	2	12	1930089	1930100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017514	ATAAAA	2	12	1934430	1934441	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_017514	TTAAAT	2	12	2219194	2219205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.