MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis M01-240149 chromosome

Total Repeats: 8679

< Previous12...6789101112131415161718Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_017514	CAG	2	6	2180166	2180171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_017514	TGC	2	6	2180222	2180227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8503	NC_017514	A	6	6	2180261	2180266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_017514	A	6	6	2180373	2180378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_017514	A	6	6	2180427	2180432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_017514	CTG	2	6	2180434	2180439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_017514	TAA	2	6	2180540	2180545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_017514	A	6	6	2181128	2181133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_017514	ATTA	2	8	2181527	2181534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_017514	TGA	2	6	2181545	2181550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_017514	TTTA	2	8	2181577	2181584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_017514	TGA	2	6	2181599	2181604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_017514	AGA	2	6	2181611	2181616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_017514	AGG	2	6	2181647	2181652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_017514	ATTA	2	8	2181707	2181714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_017514	ATG	2	6	2181715	2181720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_017514	AGCAAA	2	12	2181750	2181761	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8518	NC_017514	GCA	2	6	2181913	2181918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_017514	TGC	2	6	2181970	2181975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_017514	A	6	6	2182121	2182126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_017514	CTG	2	6	2182182	2182187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8522	NC_017514	AGG	2	6	2182222	2182227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_017514	GTT	2	6	2182238	2182243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_017514	AAT	2	6	2182545	2182550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_017514	ATT	2	6	2182607	2182612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_017514	AT	3	6	2182617	2182622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_017514	AAT	2	6	2182660	2182665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_017514	CAG	2	6	2182837	2182842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8529	NC_017514	GCA	2	6	2182899	2182904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8530	NC_017514	TAA	2	6	2182920	2182925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_017514	TGC	2	6	2182956	2182961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_017514	AACAGC	2	12	2183046	2183057	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_017514	A	6	6	2183107	2183112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_017514	A	6	6	2183161	2183166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_017514	CTG	2	6	2183168	2183173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8536	NC_017514	TAA	2	6	2184051	2184056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_017514	TCTT	2	8	2184065	2184072	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8538	NC_017514	TTG	2	6	2184136	2184141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_017514	CAA	2	6	2184166	2184171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_017514	TAA	2	6	2184226	2184231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_017514	T	6	6	2184238	2184243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_017514	AAC	2	6	2184249	2184254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8543	NC_017514	TTATT	2	10	2184272	2184281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_017514	ATTT	2	8	2184292	2184299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_017514	CGAA	2	8	2184312	2184319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8546	NC_017514	T	8	8	2184333	2184340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_017514	A	7	7	2184372	2184378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_017514	AAGC	2	8	2184632	2184639	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8549	NC_017514	ATT	2	6	2184645	2184650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_017514	ACA	3	9	2184652	2184660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_017514	AGCA	2	8	2185074	2185081	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8552	NC_017514	A	6	6	2185128	2185133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_017514	CAC	2	6	2185153	2185158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8554	NC_017514	GTA	2	6	2185186	2185191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_017514	CAT	2	6	2185873	2185878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8556	NC_017514	GAC	2	6	2185922	2185927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8557	NC_017514	TAA	2	6	2185994	2185999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_017514	AGC	2	6	2186000	2186005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8559	NC_017514	CCAA	2	8	2186130	2186137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8560	NC_017514	GCA	2	6	2186265	2186270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_017514	CAA	3	9	2186368	2186376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8562	NC_017514	GCA	2	6	2186470	2186475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8563	NC_017514	TATTTT	2	12	2186503	2186514	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_017514	AAC	2	6	2186538	2186543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8565	NC_017514	CGG	2	6	2188402	2188407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8566	NC_017514	ATG	2	6	2188426	2188431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_017514	T	6	6	2188489	2188494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_017514	CAT	2	6	2189854	2189859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8569	NC_017514	GTC	2	6	2189874	2189879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_017514	GAT	2	6	2189886	2189891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_017514	ACCCC	2	10	2190355	2190364	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8572	NC_017514	GGC	2	6	2190400	2190405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8573	NC_017514	AAAGC	2	10	2191914	2191923	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8574	NC_017514	CCG	2	6	2191935	2191940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8575	NC_017514	TTC	2	6	2193240	2193245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_017514	TGT	2	6	2193250	2193255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_017514	A	6	6	2193264	2193269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_017514	TGT	2	6	2193270	2193275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_017514	T	8	8	2193303	2193310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_017514	GCTTT	2	10	2193366	2193375	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8581	NC_017514	ATTT	2	8	2193416	2193423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_017514	CGG	2	6	2193518	2193523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8583	NC_017514	CGG	2	6	2193543	2193548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8584	NC_017514	GC	3	6	2199699	2199704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8585	NC_017514	CCG	4	12	2199743	2199754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8586	NC_017514	CGA	2	6	2199810	2199815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8587	NC_017514	TGT	2	6	2200072	2200077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_017514	GGC	2	6	2200330	2200335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8589	NC_017514	A	6	6	2200406	2200411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_017514	TTGAA	2	10	2200490	2200499	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_017514	A	7	7	2200498	2200504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_017514	CCGC	2	8	2200516	2200523	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8593	NC_017514	CGT	2	6	2200538	2200543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8594	NC_017514	A	6	6	2200587	2200592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_017514	GA	3	6	2200628	2200633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_017514	AAACC	2	10	2202173	2202182	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8597	NC_017514	GACAG	2	10	2202193	2202202	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8598	NC_017514	C	6	6	2202206	2202211	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8599	NC_017514	CTGA	2	8	2202248	2202255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8600	NC_017514	TGC	2	6	2202348	2202353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8601	NC_017514	AT	3	6	2202363	2202368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_017514	CGA	2	6	2202396	2202401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_017514	TAAA	2	8	2202532	2202539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_017514	CGG	2	6	2202686	2202691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8605	NC_017514	TGC	2	6	2202800	2202805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8606	NC_017514	AGC	2	6	2202809	2202814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8607	NC_017514	CGG	2	6	2202818	2202823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8608	NC_017514	TCC	2	6	2202903	2202908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8609	NC_017514	CCCGT	2	10	2202943	2202952	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8610	NC_017514	GCG	2	6	2202955	2202960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8611	NC_017514	TTG	2	6	2204102	2204107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_017514	T	7	7	2204186	2204192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_017514	TA	3	6	2205144	2205149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_017514	AAC	2	6	2205184	2205189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8615	NC_017514	TCA	3	9	2205227	2205235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8616	NC_017514	T	7	7	2205249	2205255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_017514	CCG	2	6	2205314	2205319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8618	NC_017514	TCCTT	2	10	2205342	2205351	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8619	NC_017514	CTTT	2	8	2205364	2205371	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8620	NC_017514	T	6	6	2206347	2206352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_017514	CAAA	2	8	2206358	2206365	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8622	NC_017514	T	6	6	2206368	2206373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8623	NC_017514	CAT	2	6	2206382	2206387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8624	NC_017514	A	6	6	2208614	2208619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_017514	CTT	2	6	2208638	2208643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_017514	ACC	2	6	2208665	2208670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8627	NC_017514	AC	4	8	2208693	2208700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8628	NC_017514	CTG	2	6	2208701	2208706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8629	NC_017514	AAC	2	6	2208769	2208774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8630	NC_017514	AAAT	2	8	2208785	2208792	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8631	NC_017514	A	7	7	2208830	2208836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8632	NC_017514	ATA	2	6	2208870	2208875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8633	NC_017514	AGC	2	6	2208887	2208892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8634	NC_017514	TCC	2	6	2208897	2208902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8635	NC_017514	AT	3	6	2208910	2208915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8636	NC_017514	TTCT	2	8	2208998	2209005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8637	NC_017514	ATT	2	6	2209588	2209593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8638	NC_017514	T	6	6	2209592	2209597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8639	NC_017514	CGA	2	6	2209648	2209653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8640	NC_017514	TA	3	6	2209769	2209774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8641	NC_017514	A	6	6	2209902	2209907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8642	NC_017514	CGA	2	6	2209968	2209973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8643	NC_017514	AAAC	2	8	2210125	2210132	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8644	NC_017514	A	7	7	2210141	2210147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8645	NC_017514	ATC	2	6	2210176	2210181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8646	NC_017514	ACA	2	6	2210210	2210215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8647	NC_017514	ATT	2	6	2210260	2210265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8648	NC_017514	T	6	6	2210369	2210374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8649	NC_017514	A	7	7	2210387	2210393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8650	NC_017514	TTCA	2	8	2210397	2210404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8651	NC_017514	CCA	2	6	2210460	2210465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8652	NC_017514	GGA	2	6	2211528	2211533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8653	NC_017514	GGGA	2	8	2211612	2211619	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8654	NC_017514	CAT	2	6	2212258	2212263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8655	NC_017514	GAA	2	6	2213612	2213617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8656	NC_017514	CAAA	2	8	2213631	2213638	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8657	NC_017514	A	6	6	2213686	2213691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8658	NC_017514	GTC	2	6	2214033	2214038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8659	NC_017514	GAC	2	6	2214064	2214069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8660	NC_017514	TAA	2	6	2214711	2214716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8661	NC_017514	GTC	2	6	2214721	2214726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8662	NC_017514	CCT	2	6	2216448	2216453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8663	NC_017514	GCT	2	6	2216463	2216468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8664	NC_017514	AAACC	2	10	2216483	2216492	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8665	NC_017514	TTC	2	6	2216493	2216498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8666	NC_017514	ATTC	2	8	2216533	2216540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8667	NC_017514	TAA	2	6	2216621	2216626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8668	NC_017514	GCC	2	6	2216642	2216647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8669	NC_017514	TCA	2	6	2218311	2218316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8670	NC_017514	TAT	2	6	2218341	2218346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8671	NC_017514	GATAA	2	10	2218383	2218392	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8672	NC_017514	TGT	2	6	2219151	2219156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8673	NC_017514	TTAAAT	2	12	2219194	2219205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8674	NC_017514	ACT	2	6	2220447	2220452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8675	NC_017514	ATG	2	6	2220536	2220541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8676	NC_017514	TGA	2	6	2220546	2220551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8677	NC_017514	T	6	6	2220660	2220665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8678	NC_017514	TAA	2	6	2220670	2220675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8679	NC_017514	AAG	2	6	2223464	2223469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...6789101112131415161718Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.