MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae TCDC-NG08107 chromosome

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017511	TCTTGT	2	12	33358	33369	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017511	AATCAA	2	12	34620	34631	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017511	TTTTGT	2	12	49204	49215	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017511	CGTGCC	2	12	84847	84858	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017511	TGGGGA	2	12	114242	114253	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017511	GAATTT	2	12	120780	120791	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017511	AACTTC	2	12	120894	120905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017511	ATTTAA	2	12	125242	125253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017511	ATTTGC	2	12	125262	125273	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017511	ACGCAA	2	12	136326	136337	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017511	GTTCGG	2	12	147218	147229	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017511	AAAATC	2	12	156381	156392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017511	CGGTTT	2	12	162968	162979	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017511	TTGAGG	2	12	163189	163200	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017511	GAATTG	2	12	163398	163409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017511	ATCCGC	2	12	167179	167190	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017511	CTGAAT	2	12	181334	181345	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017511	GTTTTT	2	12	182325	182336	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017511	ATTTAA	2	12	202526	202537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017511	ATTTAA	2	12	218628	218639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017511	AGGATT	2	12	263750	263761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017511	TTATGT	2	12	283844	283855	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017511	CCTTAA	2	12	335539	335550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017511	TGTCGA	2	12	340856	340867	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017511	AAAATA	2	12	376094	376105	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017511	TCTGCA	2	12	379389	379400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017511	TTCGGA	2	12	385774	385785	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017511	TGCCGT	2	12	430173	430184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017511	AAAATA	2	12	476857	476868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017511	AAGGAA	2	12	495433	495444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017511	ATTTAT	2	12	496227	496238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017511	TTCAAT	2	12	496239	496250	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017511	GCAGGA	2	12	504065	504076	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017511	TGATGT	2	12	511475	511486	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017511	CCGACC	2	12	519558	519569	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017511	TTGGGT	2	12	526390	526401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017511	ATTGCT	2	12	540365	540376	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017511	TAATCA	2	12	540908	540919	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017511	TGCAGT	2	12	550171	550182	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017511	AATTCC	2	12	554189	554200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017511	AAATAG	2	12	559371	559382	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017511	ATTTTT	2	12	559440	559451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017511	GCTGTT	2	12	560798	560809	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017511	ATTTAA	2	12	601917	601928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017511	CTCAAA	2	12	609291	609302	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017511	TCGTTT	2	12	633368	633379	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017511	TTTTAT	2	12	661066	661077	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017511	TATTTT	2	12	710370	710381	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017511	AATTTG	2	12	749136	749147	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017511	ATTTAA	2	12	749241	749252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017511	ATTTAA	2	12	758361	758372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017511	ATCCGA	2	12	817478	817489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017511	TGGGAA	2	12	829510	829521	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017511	TTTATT	2	12	833251	833262	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017511	GCACCG	2	12	834906	834917	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017511	CAAACA	2	12	849279	849290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017511	CAAAGG	2	12	857271	857282	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017511	TTAAAT	2	12	874740	874751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017511	ATTTAA	2	12	878078	878089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017511	TAAATA	2	12	879371	879382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017511	CTGTCG	2	12	883988	883999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017511	GTGCCG	2	12	916967	916978	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017511	CTTTTC	2	12	985112	985123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017511	TTTCAG	2	12	987621	987632	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017511	CCGGCT	2	12	987734	987745	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017511	ATTTAA	2	12	988493	988504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017511	CCTGTT	2	12	1001772	1001783	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017511	GCTGCC	2	12	1021257	1021268	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017511	CTTTTT	2	12	1030460	1030471	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017511	CGCTGC	2	12	1076525	1076536	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017511	TGGGGG	2	12	1086117	1086128	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017511	TTATTT	2	12	1095428	1095439	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017511	CGAAGC	2	12	1097864	1097875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017511	GGGTCG	2	12	1119617	1119628	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017511	TTTATA	2	12	1122584	1122595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017511	ACATCA	2	12	1127217	1127228	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017511	TTTGAA	2	12	1164628	1164639	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017511	AAAATC	2	12	1167324	1167335	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017511	CATTTC	2	12	1211189	1211200	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017511	TTAAAT	2	12	1230839	1230850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017511	CTGCGC	2	12	1279639	1279650	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017511	TAAATT	2	12	1306578	1306589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017511	CCCAAG	2	12	1309183	1309194	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017511	TGGGCT	3	18	1310186	1310203	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017511	AAAACA	2	12	1327317	1327328	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017511	CCGTAT	2	12	1344762	1344773	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017511	ATTTAA	2	12	1345998	1346009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017511	GAAATA	2	12	1371426	1371437	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017511	GAAACC	2	12	1372684	1372695	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017511	AAATCA	2	12	1431664	1431675	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017511	TTTAGC	2	12	1463413	1463424	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017511	ATTTAA	2	12	1480188	1480199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017511	AAAATA	2	12	1482340	1482351	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017511	CGTTTC	2	12	1488745	1488756	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017511	TGATGT	2	12	1499812	1499823	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017511	CCGACC	2	12	1509299	1509310	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017511	AAAGTA	2	12	1519623	1519634	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017511	ACTTCC	2	12	1519866	1519877	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017511	TCCGCC	2	12	1521023	1521034	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017511	TTTATC	2	12	1522013	1522024	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017511	CGGCTT	2	12	1541095	1541106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017511	TCCGCC	2	12	1541455	1541466	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017511	GTCGAT	2	12	1566286	1566297	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017511	TTTTCA	2	12	1570458	1570469	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017511	ATCCTT	2	12	1587358	1587369	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017511	TTCAAA	2	12	1594687	1594698	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017511	AATAAA	2	12	1609012	1609023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017511	AAAGAA	2	12	1623084	1623095	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017511	TTTGTT	2	12	1654233	1654244	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017511	TTAAAT	2	12	1661676	1661687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017511	TTCCTT	2	12	1690991	1691002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017511	GGCTGC	2	12	1710479	1710490	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017511	CTTTTT	2	12	1712571	1712582	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017511	CAAGCC	2	12	1712858	1712869	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017511	AAAGAA	2	12	1781036	1781047	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017511	GCCCAC	2	12	1785741	1785752	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017511	CGTTCC	2	12	1785937	1785948	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017511	ATTAAA	2	12	1792136	1792147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017511	GTTATT	2	12	1794317	1794328	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017511	AGCAAC	4	24	1795408	1795431	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017511	TTCGGT	2	12	1855370	1855381	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017511	TTAAAT	2	12	1883460	1883471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017511	AAATTT	2	12	1891264	1891275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017511	TTAAAT	2	12	1896968	1896979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017511	CTTATG	2	12	1900157	1900168	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017511	GGAAAA	2	12	1918323	1918334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017511	CTATTT	2	12	1933644	1933655	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017511	GGTCGT	2	12	1944656	1944667	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017511	GTGGTC	2	12	1949327	1949338	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017511	AGGTCC	2	12	1952063	1952074	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017511	TTAAAT	2	12	1964427	1964438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017511	TTTAAA	2	12	1967443	1967454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017511	ATTTAA	2	12	1967521	1967532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017511	GATAAA	2	12	1969068	1969079	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017511	TAAACC	2	12	1969275	1969286	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017511	TTTTAA	2	12	1979876	1979887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017511	CAAAAA	2	12	1984528	1984539	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_017511	AAGATA	2	12	1996455	1996466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017511	ATGGTA	2	12	2012258	2012269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017511	CAAAAA	2	12	2014573	2014584	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_017511	TGTTTT	2	12	2061162	2061173	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017511	ATTTAA	2	12	2070778	2070789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017511	GCTTCC	2	12	2075376	2075387	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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147	NC_017511	ATGCTG	2	12	2153182	2153193	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.