MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis alpha710 chromosome

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017505	GGCTTG	2	12	28928	28939	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017505	ACAAAG	2	12	58114	58125	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017505	TATAAG	2	12	76527	76538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017505	CAGGAG	2	12	82840	82851	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017505	CGCGGT	2	12	101757	101768	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017505	AAATTT	2	12	103033	103044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017505	CGCGGT	2	12	108746	108757	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017505	CTTATG	2	12	112889	112900	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017505	TACGCA	2	12	117235	117246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017505	GGAAAA	2	12	130629	130640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017505	CAAAAA	2	12	190140	190151	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017505	CAAAAA	2	12	190456	190467	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017505	CAAAAA	2	12	190502	190513	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017505	TTCGGT	2	12	196543	196554	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017505	TTCGGT	2	12	196716	196727	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017505	AGCAAA	2	12	220552	220563	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017505	CAAAAA	2	12	220609	220620	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017505	TCCCTT	2	12	235771	235782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017505	CCGCAC	2	12	285833	285844	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017505	AAGCCA	2	12	285938	285949	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017505	GCCTTT	2	12	308397	308408	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017505	ACAAAG	2	12	312832	312843	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017505	TTTCTT	2	12	319167	319178	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017505	TTCGGT	2	12	322747	322758	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017505	TTTTCA	2	12	323949	323960	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017505	TTAAAT	2	12	338309	338320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017505	TTAAAT	2	12	383731	383742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017505	TTCGGA	3	18	386890	386907	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017505	TTCAGA	3	18	386908	386925	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017505	ATTTAA	2	12	389096	389107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017505	TTGATA	2	12	404250	404261	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017505	CCACAC	2	12	404595	404606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017505	TGATTT	2	12	418253	418264	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017505	AAACGC	2	12	430531	430542	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017505	CAGTGC	2	12	458346	458357	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017505	TTTGTC	2	12	458530	458541	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017505	TTTCCG	2	12	462957	462968	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017505	TTAAAT	2	12	467031	467042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017505	CCGTCC	2	12	474711	474722	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017505	ATAAAA	2	12	504826	504837	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017505	GCGGCA	2	12	531610	531621	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017505	CAAATC	2	12	568412	568423	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017505	GTGTGG	2	12	578637	578648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017505	CTTGGG	2	12	581264	581275	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017505	AATTTA	2	12	583868	583879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017505	CGAAAA	2	12	601529	601540	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017505	AAATCC	2	12	612282	612293	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017505	TCGGTT	2	12	612671	612682	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017505	AAAAAC	2	12	614019	614030	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017505	TTCAAA	2	12	617309	617320	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017505	ATCCGC	2	12	627025	627036	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017505	CGGACA	2	12	647579	647590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017505	TTATGT	2	12	681998	682009	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017505	GGCCGG	2	12	689477	689488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017505	AGATGA	2	12	689585	689596	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017505	TTCGGC	2	12	691220	691231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017505	GCAGGT	2	12	691429	691440	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017505	TTCGGT	2	12	715553	715564	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017505	TTTTTG	2	12	733410	733421	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017505	TTTTTG	2	12	735241	735252	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017505	ATTTAA	2	12	735416	735427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017505	CCTTAA	2	12	740867	740878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017505	ATTTAA	2	12	741192	741203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017505	CCGAAC	2	12	741245	741256	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017505	TTAAAT	2	12	751334	751345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017505	ATTTAA	2	12	767251	767262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017505	AAAATA	2	12	783146	783157	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017505	TTCGGA	2	12	793036	793047	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017505	ATTTAA	2	12	797216	797227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017505	GGAAAG	2	12	853903	853914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017505	ACGGAT	2	12	869907	869918	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017505	AAGGAT	2	12	888023	888034	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017505	AAGGAA	2	12	900565	900576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017505	TTAAAT	2	12	900698	900709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017505	ATTTAT	2	12	901465	901476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017505	TTCAAT	2	12	901477	901488	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017505	GTTTGC	2	12	912782	912793	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017505	TAATCA	2	12	926724	926735	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017505	TTTAAA	2	12	929260	929271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017505	ATTTAA	2	12	929338	929349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017505	TTTTTG	2	12	957828	957839	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017505	TCTTTT	2	12	965848	965859	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017505	AGACAA	2	12	973795	973806	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017505	TTAAAT	2	12	975823	975834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017505	TTAAAT	2	12	976291	976302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017505	TGCCTG	2	12	976641	976652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017505	GGGTCG	2	12	1003540	1003551	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017505	GGGGTT	2	12	1004224	1004235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017505	GGGGTT	2	12	1004246	1004257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017505	CAAATT	2	12	1030135	1030146	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017505	TTCGGC	2	12	1032636	1032647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017505	AATTTG	2	12	1051621	1051632	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017505	ATTTAA	2	12	1060777	1060788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017505	CCTCTG	2	12	1077817	1077828	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017505	TCGTGT	2	12	1093624	1093635	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017505	GAAACC	2	12	1145626	1145637	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017505	TGCGGG	2	12	1178187	1178198	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017505	TTAAAT	2	12	1191643	1191654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017505	TGCCGA	2	12	1197353	1197364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017505	CAAACC	2	12	1212664	1212675	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017505	TTTCAG	2	12	1254537	1254548	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017505	CGACAT	2	12	1257984	1257995	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017505	AAACAC	2	12	1271094	1271105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017505	CAAAAA	2	12	1343382	1343393	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017505	TGCCTT	2	12	1355828	1355839	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017505	TAAATA	2	12	1372195	1372206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017505	ATTTAA	2	12	1374828	1374839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017505	ATTTTT	2	12	1393802	1393813	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017505	ATTTAA	2	12	1393850	1393861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017505	TTAAAT	2	12	1398921	1398932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017505	CCAAAC	2	12	1435742	1435753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017505	CAAAGG	2	12	1435755	1435766	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017505	ATTTAA	2	12	1439262	1439273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017505	TTAAAT	2	12	1447012	1447023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017505	TTAAAT	2	12	1454789	1454800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017505	CAAACG	2	12	1463284	1463295	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017505	ATTTAA	2	12	1463439	1463450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017505	ATAAAA	2	12	1468954	1468965	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017505	CAAAGA	2	12	1476390	1476401	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017505	CAAAAA	2	12	1483590	1483601	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017505	TTAAAT	2	12	1488514	1488525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017505	CGGGCA	2	12	1510195	1510206	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017505	AGACAA	2	12	1519940	1519951	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017505	AAACCA	2	12	1520293	1520304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017505	TTATTT	2	12	1521330	1521341	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017505	TTCGGT	2	12	1529322	1529333	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017505	TTCGGT	2	12	1529602	1529613	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017505	ATCGGA	2	12	1542821	1542832	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017505	AAAACG	2	12	1557048	1557059	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017505	GATACG	2	12	1634082	1634093	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017505	GATTCA	2	12	1635940	1635951	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017505	ATCCTG	2	12	1638825	1638836	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017505	AAAATC	2	12	1683346	1683357	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017505	CTTTGT	2	12	1692665	1692676	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_017505	CATTTC	2	12	1727943	1727954	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017505	ATTTTT	2	12	1790032	1790043	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017505	GGCATA	2	12	1795255	1795266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_017505	TTAAAT	2	12	1837707	1837718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017505	AAATTC	2	12	1839472	1839483	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017505	ATTTAA	2	12	1842682	1842693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017505	TCTGAA	2	12	1890602	1890613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_017505	ATTTAA	2	12	1900454	1900465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017505	AACAAA	2	12	1914942	1914953	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_017505	AAGCCC	2	12	1919161	1919172	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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147	NC_017505	GGGTTG	2	12	1925601	1925612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_017505	CGCCCC	2	12	1981696	1981707	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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166	NC_017505	TTAAAT	2	12	2238623	2238634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.