MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Niastella koreensis GR20-10 chromosome

Total Repeats: 379

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016609	AACCCT	2	12	1699	1710	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016609	TAAAGA	2	12	50866	50877	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016609	AAAGGC	2	12	78635	78646	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016609	AAAGCA	2	12	82276	82287	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016609	TGCTTT	2	12	82304	82315	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016609	TTTTCC	2	12	101637	101648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016609	TAAGTT	2	12	103724	103735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016609	CAATAA	2	12	118693	118704	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016609	AGCTAT	2	12	121951	121962	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016609	TTTCCT	2	12	144125	144136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016609	GTTATA	2	12	146550	146561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016609	TTATCC	2	12	223440	223451	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016609	TCTTTT	2	12	238818	238829	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016609	TAAAAA	2	12	245826	245837	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016609	TAACCA	2	12	285678	285689	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016609	TTACCC	2	12	299129	299140	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016609	AAAAGG	2	12	393551	393562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016609	TCATTT	2	12	395582	395593	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016609	GCCAAA	2	12	415307	415318	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016609	ATTGAT	2	12	423618	423629	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016609	AGAACA	2	12	426870	426881	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016609	TCCGAA	2	12	452762	452773	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016609	GCAACC	2	12	483543	483554	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016609	TACTGG	2	12	498652	498663	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016609	TTTACC	2	12	521866	521877	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016609	GGAAAT	2	12	529024	529035	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016609	AAAAAT	2	12	548055	548066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016609	TTAATT	2	12	548095	548106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016609	GCCTTT	2	12	549784	549795	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016609	GTATAA	2	12	593739	593750	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016609	CTAACG	2	12	597605	597616	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016609	AGCTTA	2	12	598667	598678	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016609	TATTTT	2	12	603897	603908	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016609	GCCCTG	2	12	612173	612184	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016609	TTCCTG	2	12	624963	624974	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016609	GATAAA	2	12	626679	626690	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016609	GCCAAA	2	12	636549	636560	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016609	GCAATT	2	12	656868	656879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016609	AATACA	2	12	697016	697027	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016609	CCTTTG	2	12	706529	706540	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016609	AGTTTT	2	12	709005	709016	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016609	TTCAAA	2	12	716331	716342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016609	GAAAGA	2	12	719710	719721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016609	AAACAA	2	12	729721	729732	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016609	AAAAGC	2	12	756212	756223	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016609	AAATTA	2	12	786444	786455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016609	AACTTA	2	12	832825	832836	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016609	GTAAGC	2	12	837708	837719	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016609	TTTAAC	2	12	913512	913523	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016609	ATCAAA	2	12	937159	937170	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016609	GATTTT	2	12	948794	948805	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016609	ATCAAA	2	12	987220	987231	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016609	TAATTG	2	12	1024031	1024042	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016609	TTTACT	2	12	1027459	1027470	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016609	GTTTTC	2	12	1064966	1064977	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016609	TGTATT	2	12	1092101	1092112	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016609	GGGTTT	2	12	1121781	1121792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016609	AGTAAT	2	12	1186499	1186510	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016609	GCAAAG	2	12	1189819	1189830	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016609	GTACTT	2	12	1210751	1210762	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016609	TCTTTC	2	12	1211494	1211505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016609	GTTCAA	2	12	1216146	1216157	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016609	TTGCAT	2	12	1305259	1305270	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016609	AAAAGA	2	12	1312126	1312137	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016609	AAAAGA	2	12	1324026	1324037	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016609	CCCTTA	2	12	1324595	1324606	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016609	ACATGT	2	12	1383624	1383635	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016609	TTGAAA	2	12	1383688	1383699	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016609	CTGCAG	2	12	1395048	1395059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016609	TTTAGA	2	12	1427683	1427694	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016609	CTGAGC	2	12	1496527	1496538	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016609	ACCAAA	2	12	1502329	1502340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016609	ATTAAT	2	12	1504409	1504420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016609	GCCTTT	2	12	1529216	1529227	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016609	GTCCCG	2	12	1615565	1615576	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016609	TTGGAA	2	12	1634297	1634308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016609	CACCTA	2	12	1634552	1634563	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016609	GCAAAA	2	12	1660293	1660304	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016609	TAATGT	2	12	1749764	1749775	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016609	TTTTCA	2	12	1772572	1772583	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016609	TAATCA	2	12	1787059	1787070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_016609	TTTGAT	2	12	1831876	1831887	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016609	AGTGGT	2	12	1868352	1868363	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016609	TTACAA	2	12	1890487	1890498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016609	AGTTTT	2	12	1927918	1927929	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016609	TGTATT	2	12	1952336	1952347	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016609	ATTTTG	2	12	1978445	1978456	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016609	ATTCAA	2	12	1987136	1987147	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016609	AAATTT	2	12	2014780	2014791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016609	TCCCAG	2	12	2016808	2016819	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016609	TAATAT	2	12	2025683	2025694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016609	GCCAAA	2	12	2034640	2034651	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016609	GATTTA	2	12	2034741	2034752	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016609	ATTGCC	2	12	2061080	2061091	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016609	GTATAT	2	12	2080743	2080754	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016609	TTTAAC	2	12	2117312	2117323	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016609	TGATTT	2	12	2135812	2135823	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016609	TAAAAA	2	12	2154265	2154276	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016609	ATTTGA	2	12	2159160	2159171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016609	AATTAA	2	12	2162922	2162933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016609	TGTAAT	2	12	2192210	2192221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016609	TGTGCC	2	12	2216438	2216449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016609	TTAAAT	2	12	2227170	2227181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016609	ATTTTC	2	12	2266573	2266584	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_016609	ACAATA	2	12	2275850	2275861	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_016609	TTTAAA	2	12	2290097	2290108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016609	GATTTT	2	12	2330593	2330604	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016609	AAAGTA	2	12	2338556	2338567	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016609	ATTAGT	2	12	2398341	2398352	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016609	ATATTT	2	12	2398480	2398491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016609	TTCTAC	2	12	2444026	2444037	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016609	ATAAAA	2	12	2516794	2516805	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016609	GAAATT	2	12	2553049	2553060	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016609	TTACGA	2	12	2592768	2592779	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_016609	ATTGAA	2	12	2610318	2610329	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016609	GGAAAG	2	12	2627841	2627852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016609	TTGGTT	2	12	2639144	2639155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016609	GCTGTT	2	12	2659060	2659071	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016609	AAAAGA	2	12	2665120	2665131	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016609	GGTCGG	2	12	2665855	2665866	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016609	TTGCCA	2	12	2697502	2697513	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016609	TTTGAA	2	12	2734081	2734092	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016609	CATTTT	2	12	2739701	2739712	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016609	TAGTTT	2	12	2741632	2741643	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016609	GAAACC	2	12	2742823	2742834	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016609	AATATC	2	12	2751695	2751706	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_016609	TGCCAT	2	12	2753428	2753439	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016609	TTCCTG	2	12	2769946	2769957	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016609	CCCATA	2	12	2769997	2770008	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016609	CAGGAT	2	12	2796488	2796499	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_016609	TTTTAC	2	12	2852695	2852706	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_016609	GCTACA	2	12	2852733	2852744	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016609	GTTTTG	2	12	2903718	2903729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016609	TTTTTC	2	12	2935760	2935771	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_016609	GGTGCC	2	12	2977674	2977685	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016609	TAATTA	2	12	2979989	2980000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016609	CGGTAA	2	12	2991445	2991456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_016609	CCTGAA	2	12	3179311	3179322	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016609	TTGTTA	2	12	3180062	3180073	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016609	CTTTTA	2	12	3196966	3196977	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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146	NC_016609	TAAATG	2	12	3538090	3538101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_016609	ACCATC	2	12	3714166	3714177	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_016609	GCGAGG	2	12	3781331	3781342	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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152	NC_016609	ATCCGT	2	12	3828292	3828303	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_016609	ATTGCC	2	12	3875227	3875238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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244	NC_016609	GCCAAA	2	12	5637327	5637338	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
245	NC_016609	TGCTAA	2	12	5684262	5684273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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370	NC_016609	TAAATG	2	12	8745415	8745426	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
371	NC_016609	GTCGAC	2	12	8765045	8765056	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
372	NC_016609	ACCACA	2	12	8802677	8802688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
373	NC_016609	CAAACC	2	12	8855236	8855247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
374	NC_016609	TAGCTG	2	12	8862050	8862061	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
375	NC_016609	AAAGGC	2	12	8937386	8937397	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
376	NC_016609	AAACAA	2	12	9011887	9011898	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
377	NC_016609	ATTGTG	2	12	9021296	9021307	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
378	NC_016609	TTAAAA	2	12	9031125	9031136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
379	NC_016609	TCACGG	2	12	9033375	9033386	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.