MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 12433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015731	CAGA	2	8	38	45	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015731	A	6	6	54	59	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015731	AAC	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015731	CTT	2	6	1461	1466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015731	ACAA	2	8	1524	1531	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015731	TTG	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015731	ATTC	2	8	1555	1562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015731	TAT	2	6	1608	1613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015731	TA	3	6	1619	1624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015731	A	6	6	5258	5263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015731	A	6	6	5295	5300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015731	AAT	2	6	16772	16777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015731	TGA	2	6	16820	16825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015731	ACG	2	6	16845	16850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015731	A	6	6	16912	16917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015731	GC	3	6	18034	18039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015731	GTT	2	6	19929	19934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015731	ACTG	2	8	19957	19964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015731	ATT	2	6	19984	19989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015731	T	6	6	20122	20127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015731	TGG	2	6	20153	20158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015731	TGT	2	6	20199	20204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015731	GTT	2	6	20670	20675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015731	GTA	2	6	20711	20716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015731	T	8	8	20973	20980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015731	ATA	2	6	21436	21441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015731	AAG	2	6	24052	24057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015731	ACGA	2	8	24088	24095	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015731	AT	3	6	24098	24103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015731	GTG	2	6	24115	24120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015731	AAT	2	6	24178	24183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015731	TCA	2	6	24193	24198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015731	GAA	2	6	24210	24215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015731	CAA	2	6	24249	24254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015731	CTG	2	6	24275	24280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015731	TGAT	2	8	24372	24379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015731	TGC	2	6	24390	24395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015731	TCA	2	6	24415	24420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015731	TCG	2	6	24424	24429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015731	T	7	7	24474	24480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015731	GGAAT	2	10	24552	24561	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015731	TAC	2	6	24605	24610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015731	TACC	2	8	24628	24635	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015731	GAA	2	6	26418	26423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015731	T	6	6	26432	26437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015731	ATT	2	6	26541	26546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015731	GT	3	6	28083	28088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015731	ATGA	2	8	28106	28113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015731	AACAA	2	10	28114	28123	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015731	AAT	2	6	28621	28626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015731	CCT	2	6	28636	28641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015731	TCA	2	6	28662	28667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015731	TAA	2	6	28696	28701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015731	TTTGT	2	10	28718	28727	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015731	TACT	2	8	28788	28795	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015731	TTG	2	6	29193	29198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015731	ATT	2	6	29241	29246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015731	TCAT	2	8	29261	29268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015731	CAAA	2	8	29270	29277	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015731	T	6	6	29300	29305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015731	AAG	2	6	29318	29323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015731	AGC	2	6	29356	29361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015731	CCACA	2	10	29429	29438	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_015731	CGTGTG	2	12	29469	29480	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015731	TGA	2	6	29526	29531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015731	T	6	6	29536	29541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015731	CAA	2	6	29586	29591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015731	ATC	2	6	29597	29602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015731	AATT	2	8	29619	29626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015731	AGTT	2	8	29660	29667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015731	GA	3	6	29696	29701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015731	ATA	2	6	39853	39858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015731	TGT	2	6	39862	39867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015731	T	6	6	39867	39872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015731	TGC	2	6	40246	40251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015731	AAG	2	6	40274	40279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015731	ATT	2	6	42773	42778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015731	T	7	7	42777	42783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015731	AGG	2	6	42786	42791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015731	TAA	2	6	43120	43125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015731	CAC	2	6	43173	43178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015731	AT	3	6	43190	43195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015731	A	6	6	43254	43259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015731	TTG	2	6	43311	43316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015731	GGC	2	6	43361	43366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015731	AC	3	6	43380	43385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015731	AAATT	2	10	43402	43411	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015731	T	6	6	43417	43422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015731	AAG	2	6	45206	45211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015731	AGA	2	6	47800	47805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015731	A	6	6	47816	47821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015731	CAG	2	6	47833	47838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015731	A	6	6	63513	63518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015731	GTT	2	6	63538	63543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015731	TTC	2	6	63594	63599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015731	AAATTA	2	12	63619	63630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015731	A	6	6	64355	64360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015731	A	7	7	64363	64369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015731	ATA	2	6	64450	64455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015731	T	7	7	64464	64470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015731	TGA	2	6	64520	64525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015731	CCA	2	6	64560	64565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015731	TTA	2	6	66155	66160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015731	CCT	2	6	66833	66838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_015731	TGGA	2	8	66883	66890	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015731	ACC	2	6	66926	66931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_015731	CG	3	6	67029	67034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015731	AGT	2	6	67072	67077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015731	ACGGC	2	10	67101	67110	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_015731	ACCA	2	8	67175	67182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015731	ACT	2	6	67247	67252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015731	CTT	2	6	67274	67279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015731	A	6	6	67433	67438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015731	A	7	7	67448	67454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015731	AGTT	2	8	68056	68063	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015731	CTA	2	6	68137	68142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015731	TATTT	2	10	68304	68313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015731	AGG	2	6	68486	68491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015731	AGC	2	6	68555	68560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015731	CTG	2	6	68685	68690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015731	ATCC	2	8	68699	68706	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015731	GAC	2	6	68713	68718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015731	AGC	2	6	68726	68731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015731	GA	3	6	68732	68737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015731	TTA	2	6	68742	68747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015731	AGAA	2	8	68762	68769	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015731	TGCA	2	8	68773	68780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015731	TCCA	2	8	68849	68856	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015731	TTG	2	6	68922	68927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015731	TTA	2	6	69070	69075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015731	ATAG	2	8	69112	69119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015731	GGGAT	2	10	70364	70373	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015731	TTA	2	6	71608	71613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015731	ATC	2	6	71621	71626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015731	CAA	2	6	71672	71677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015731	ATT	3	9	71855	71863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015731	AAT	2	6	71864	71869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015731	TCT	2	6	71882	71887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015731	AGT	2	6	72136	72141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015731	CTTC	2	8	72258	72265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_015731	GAT	2	6	74465	74470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015731	CAT	2	6	74521	74526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015731	TGC	2	6	74537	74542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015731	A	8	8	74612	74619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015731	GGCA	2	8	74644	74651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015731	GTTC	2	8	74659	74666	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015731	TAA	2	6	74745	74750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015731	TGAA	2	8	74920	74927	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015731	TAT	2	6	74949	74954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015731	GTT	2	6	74971	74976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015731	A	6	6	75029	75034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015731	CTG	2	6	75044	75049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_015731	TTA	2	6	75123	75128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_015731	CAG	2	6	75343	75348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_015731	TGCTT	2	10	75356	75365	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
159	NC_015731	CAG	2	6	75476	75481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_015731	T	6	6	75486	75491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_015731	ATT	2	6	76443	76448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_015731	GT	3	6	77554	77559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015731	TTTC	2	8	77561	77568	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
167	NC_015731	ATTT	2	8	77579	77586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_015731	A	6	6	80332	80337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_015731	A	6	6	80382	80387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015731	TAA	2	6	80397	80402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_015731	GAAT	2	8	81426	81433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_015731	TAG	2	6	105893	105898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_015731	ATA	2	6	107645	107650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_015731	AT	3	6	107682	107687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_015731	TAAGTT	2	12	107744	107755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_015731	GACC	2	8	107815	107822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
284	NC_015731	CCT	2	6	107829	107834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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288	NC_015731	TCCTG	2	10	114288	114297	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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291	NC_015731	ATG	2	6	115848	115853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015731	ACC	2	6	115902	115907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_015731	TTG	2	6	115988	115993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015731	TAA	2	6	116015	116020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015731	TTC	2	6	117847	117852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_015731	CTT	2	6	117894	117899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
297	NC_015731	GAT	2	6	117913	117918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_015731	TCA	2	6	117985	117990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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302	NC_015731	AAT	2	6	122353	122358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_015731	AAT	2	6	123608	123613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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314	NC_015731	CAA	2	6	124944	124949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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323	NC_015731	CTG	2	6	128512	128517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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325	NC_015731	TCA	2	6	129762	129767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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327	NC_015731	ATT	2	6	135792	135797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_015731	TAT	2	6	140353	140358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_015731	TAA	2	6	180947	180952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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417	NC_015731	ACA	2	6	181334	181339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
418	NC_015731	GTA	2	6	181416	181421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_015731	GAAT	2	8	181450	181457	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
421	NC_015731	AT	4	8	184063	184070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_015731	AAATG	2	10	184073	184082	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
423	NC_015731	GAA	2	6	184109	184114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_015731	A	6	6	185638	185643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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