MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 12433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015731	CCGG	2	8	966797	966804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_015731	TTC	2	6	967945	967950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_015731	GCT	3	9	968009	968017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_015731	G	7	7	968278	968284	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_015731	CTG	2	6	968446	968451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_015731	GATG	2	8	968457	968464	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_015731	ATTA	2	8	968539	968546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015731	TTG	2	6	968623	968628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_015731	GTT	2	6	968631	968636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_015731	TTG	2	6	968637	968642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_015731	AAG	2	6	968681	968686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015731	GCG	2	6	968699	968704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_015731	TCA	2	6	968729	968734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_015731	GTT	2	6	968739	968744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_015731	AGT	2	6	968936	968941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_015731	A	6	6	969064	969069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_015731	CGC	2	6	969189	969194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_015731	ATTTT	2	10	969248	969257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015731	T	6	6	969254	969259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_015731	T	6	6	969288	969293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_015731	GGA	2	6	969317	969322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_015731	AAG	2	6	969413	969418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015731	ATC	2	6	969484	969489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_015731	A	6	6	969496	969501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015731	AGT	2	6	969529	969534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3029	NC_015731	CTC	2	6	969697	969702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_015731	GCA	2	6	969762	969767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_015731	GTC	2	6	969778	969783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_015731	GCT	2	6	969787	969792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_015731	TTC	2	6	969817	969822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_015731	TAG	2	6	969928	969933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_015731	AT	3	6	969934	969939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_015731	AT	3	6	970049	970054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_015731	TCT	2	6	970099	970104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_015731	CT	3	6	970144	970149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_015731	GTG	2	6	970199	970204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_015731	CCA	2	6	970220	970225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_015731	CTA	2	6	970232	970237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_015731	CGC	2	6	970258	970263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_015731	TGA	2	6	972599	972604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_015731	AG	3	6	972606	972611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015731	AAAAT	2	10	975620	975629	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3047	NC_015731	AGT	2	6	975688	975693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_015731	TAT	2	6	976050	976055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_015731	T	6	6	976055	976060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_015731	ATT	3	9	976071	976079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_015731	TAA	2	6	976097	976102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_015731	T	6	6	977195	977200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_015731	ATT	2	6	977201	977206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_015731	GACT	2	8	977212	977219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_015731	TGC	3	9	980613	980621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_015731	TTA	2	6	980651	980656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_015731	GTAGG	2	10	980735	980744	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015731	A	7	7	982858	982864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_015731	GCAA	2	8	982873	982880	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_015731	TCAT	2	8	982908	982915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3061	NC_015731	T	6	6	982969	982974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_015731	AG	3	6	983060	983065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_015731	CTTT	2	8	983159	983166	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_015731	GCA	2	6	983280	983285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3066	NC_015731	GCA	2	6	986558	986563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_015731	ATTCT	2	10	987757	987766	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3068	NC_015731	AAT	2	6	987783	987788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_015731	CATG	2	8	987818	987825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_015731	A	6	6	987900	987905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_015731	T	7	7	987911	987917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_015731	TGC	2	6	990020	990025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_015731	AGA	2	6	991489	991494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_015731	AGGA	2	8	991497	991504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_015731	AAT	2	6	991943	991948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_015731	GAT	2	6	993377	993382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_015731	ACA	2	6	994111	994116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_015731	AT	3	6	994211	994216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_015731	A	6	6	994223	994228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_015731	TTA	2	6	994244	994249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_015731	CA	3	6	994968	994973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_015731	TTG	2	6	996771	996776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_015731	TAGGG	2	10	996780	996789	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_015731	ATA	2	6	997101	997106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3087	NC_015731	GATT	2	8	997521	997528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_015731	TTGT	2	8	997557	997564	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_015731	TTA	2	6	1000154	1000159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3091	NC_015731	T	6	6	1003069	1003074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_015731	CCCG	2	8	1003082	1003089	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3093	NC_015731	ATC	2	6	1003092	1003097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_015731	TTTA	2	8	1003101	1003108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_015731	CCG	2	6	1004672	1004677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3097	NC_015731	TGG	2	6	1004871	1004876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_015731	GTTA	2	8	1008963	1008970	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_015731	AT	3	6	1008975	1008980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_015731	GAG	2	6	1009150	1009155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_015731	AAAT	2	8	1009966	1009973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_015731	A	6	6	1010006	1010011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_015731	TTA	2	6	1010034	1010039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_015731	TTA	2	6	1010093	1010098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_015731	TCA	2	6	1011373	1011378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3108	NC_015731	TAATG	2	10	1011585	1011594	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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3111	NC_015731	GTT	2	6	1012334	1012339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3114	NC_015731	AAT	2	6	1012822	1012827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3116	NC_015731	TGCT	2	8	1012851	1012858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3117	NC_015731	AAC	2	6	1012877	1012882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_015731	TTA	2	6	1015130	1015135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_015731	TTA	2	6	1015714	1015719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015731	TCA	2	6	1017470	1017475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3122	NC_015731	GTG	2	6	1017501	1017506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_015731	GTAG	2	8	1017563	1017570	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_015731	TTAG	2	8	1017613	1017620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_015731	TTA	2	6	1017621	1017626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_015731	AAT	2	6	1017678	1017683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015731	ATT	2	6	1017710	1017715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_015731	ATG	2	6	1017734	1017739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_015731	TAA	2	6	1017742	1017747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015731	GCT	2	6	1017791	1017796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_015731	GGAT	2	8	1017822	1017829	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_015731	AT	3	6	1017828	1017833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_015731	GTAAA	2	10	1020464	1020473	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_015731	A	6	6	1020471	1020476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_015731	ATG	2	6	1020996	1021001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3263	NC_015731	A	6	6	1055213	1055218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_015731	TCGCT	2	10	1055796	1055805	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3265	NC_015731	AT	3	6	1055939	1055944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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