MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 12433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015731	AATCT	2	10	335983	335992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1002	NC_015731	CAAT	2	8	336003	336010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_015731	GATCT	2	10	336024	336033	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1004	NC_015731	TGGT	2	8	336050	336057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015731	ATG	2	6	336083	336088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015731	T	11	11	336125	336135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015731	AAG	2	6	336155	336160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015731	TCT	3	9	336166	336174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_015731	TCC	2	6	336497	336502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_015731	ATT	2	6	336510	336515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015731	ATT	2	6	336566	336571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015731	CT	3	6	336576	336581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_015731	ACC	2	6	336803	336808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_015731	CAA	3	9	336851	336859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_015731	GTT	2	6	336865	336870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015731	TCA	2	6	336878	336883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015731	TATT	2	8	336886	336893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015731	ACA	2	6	336909	336914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_015731	A	6	6	336946	336951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015731	TTA	2	6	337052	337057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015731	AGA	2	6	337062	337067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015731	ATG	2	6	337622	337627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015731	A	6	6	337642	337647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015731	AAT	2	6	338378	338383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015731	AAC	2	6	338636	338641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015731	TTC	2	6	338685	338690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015731	ATA	2	6	338763	338768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015731	TATT	2	8	342198	342205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015731	TTC	2	6	342215	342220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_015731	TTA	2	6	342250	342255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015731	TGC	2	6	342277	342282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_015731	CCT	2	6	342312	342317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_015731	ATA	2	6	342367	342372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015731	T	6	6	342379	342384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015731	GAA	2	6	342427	342432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015731	TGAT	2	8	342487	342494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015731	CTA	2	6	342513	342518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_015731	A	6	6	343889	343894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015731	CAG	2	6	343993	343998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_015731	TA	3	6	344004	344009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015731	AGT	2	6	344010	344015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015731	TTA	2	6	344032	344037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015731	GAA	2	6	344066	344071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015731	GCG	2	6	344077	344082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_015731	AC	4	8	344105	344112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_015731	CGTC	2	8	344113	344120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_015731	CAG	2	6	344129	344134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015731	TTG	2	6	344135	344140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015731	TAA	2	6	344147	344152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015731	ATT	2	6	344156	344161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015731	GAA	2	6	344163	344168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015731	TTA	2	6	344169	344174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015731	CCAA	2	8	344276	344283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_015731	ATT	2	6	344294	344299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015731	ACA	2	6	344309	344314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015731	AGG	2	6	344353	344358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015731	GAA	2	6	344371	344376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015731	CT	3	6	344377	344382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_015731	ATT	2	6	344438	344443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015731	CGA	2	6	344518	344523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_015731	AGA	2	6	344526	344531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015731	TGCG	2	8	344534	344541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_015731	TGC	2	6	344579	344584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_015731	TAC	2	6	344654	344659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015731	ATATGG	2	12	344705	344716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015731	CAA	2	6	344785	344790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_015731	GAT	2	6	344892	344897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015731	CAA	2	6	344971	344976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_015731	GAT	2	6	344977	344982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015731	TGC	2	6	345021	345026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_015731	AGTT	2	8	345062	345069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015731	GA	3	6	345098	345103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015731	TAA	2	6	345132	345137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015731	CAT	2	6	345888	345893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_015731	A	6	6	345897	345902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015731	AAAG	2	8	345907	345914	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015731	ACGC	2	8	346639	346646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1078	NC_015731	GGT	2	6	346684	346689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015731	TCA	2	6	346733	346738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_015731	GCA	2	6	346807	346812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_015731	GT	3	6	346814	346819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015731	TAG	2	6	346837	346842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_015731	ATTAA	2	10	347617	347626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015731	TAA	2	6	347726	347731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015731	T	6	6	347742	347747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015731	TAA	2	6	347802	347807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_015731	TTG	2	6	349204	349209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015731	TGA	2	6	349229	349234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_015731	TTA	2	6	349278	349283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015731	ATA	2	6	349339	349344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015731	ATCT	4	16	349359	349374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_015731	AT	3	6	349375	349380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015731	TA	3	6	349382	349387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015731	TCTA	2	8	349388	349395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_015731	TAT	2	6	349401	349406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015731	TA	3	6	349408	349413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015731	AT	3	6	349420	349425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015731	TTATA	2	10	349444	349453	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015731	TAA	2	6	349458	349463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015731	TC	3	6	349464	349469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_015731	TAATA	2	10	349470	349479	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015731	AT	3	6	349480	349485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015731	TTAAA	2	10	349939	349948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1111	NC_015731	TTA	2	6	350159	350164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015731	AAG	2	6	350175	350180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015731	TCC	2	6	350275	350280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_015731	A	8	8	350308	350315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015731	T	6	6	350337	350342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015731	TAAA	2	8	350370	350377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015731	AATT	2	8	350378	350385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_015731	AATT	2	8	350432	350439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015731	ATT	2	6	350447	350452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015731	TAA	2	6	350474	350479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015731	TCTT	2	8	350542	350549	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_015731	TGC	2	6	350630	350635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_015731	TAA	2	6	350685	350690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015731	GAG	2	6	351651	351656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015731	AGT	2	6	351659	351664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015731	A	7	7	352728	352734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015731	AG	4	8	352765	352772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015731	ATGC	2	8	353844	353851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_015731	AG	3	6	353865	353870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015731	A	6	6	354258	354263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015731	TAA	2	6	354264	354269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015731	ACT	2	6	354303	354308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_015731	TACG	2	8	354366	354373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_015731	A	6	6	354401	354406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015731	GAA	2	6	354413	354418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_015731	AAG	2	6	354534	354539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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