MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 12433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015731	T	6	6	3470303	3470308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_015731	CGT	2	6	3470309	3470314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_015731	TGGA	3	12	3471396	3471407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_015731	CAC	2	6	3471419	3471424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11505	NC_015731	CCAT	2	8	3471431	3471438	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11506	NC_015731	CCT	2	6	3472892	3472897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11507	NC_015731	A	7	7	3472920	3472926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_015731	GTT	2	6	3472959	3472964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_015731	TAA	2	6	3472966	3472971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_015731	TTTAC	2	10	3472977	3472986	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11511	NC_015731	A	7	7	3473005	3473011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_015731	ATCA	2	8	3473508	3473515	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11513	NC_015731	ATA	2	6	3473537	3473542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_015731	ATT	2	6	3473580	3473585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_015731	ATT	2	6	3474495	3474500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_015731	T	7	7	3474499	3474505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_015731	ATTG	2	8	3478752	3478759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_015731	T	6	6	3478769	3478774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_015731	CTTA	2	8	3478777	3478784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11520	NC_015731	TTG	2	6	3478873	3478878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_015731	AAT	2	6	3480814	3480819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_015731	GGT	2	6	3480821	3480826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_015731	TAA	2	6	3482788	3482793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_015731	AAT	2	6	3482835	3482840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_015731	TTC	2	6	3483629	3483634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_015731	AAC	2	6	3483657	3483662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_015731	AT	3	6	3483689	3483694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_015731	ACT	2	6	3483724	3483729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_015731	CTC	2	6	3485283	3485288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11530	NC_015731	CAA	2	6	3485328	3485333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_015731	GTTT	2	8	3485383	3485390	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_015731	ATA	2	6	3485398	3485403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_015731	TGA	2	6	3485411	3485416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_015731	TA	3	6	3486613	3486618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_015731	ATT	2	6	3486624	3486629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_015731	GTG	2	6	3486739	3486744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_015731	AATC	2	8	3486846	3486853	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11538	NC_015731	GCC	2	6	3486905	3486910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11539	NC_015731	ATTA	2	8	3493060	3493067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_015731	CAAA	2	8	3493090	3493097	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11541	NC_015731	AAG	2	6	3493203	3493208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_015731	ATT	2	6	3493287	3493292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_015731	CAAG	2	8	3493313	3493320	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11544	NC_015731	GGC	2	6	3493427	3493432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_015731	ATT	2	6	3493449	3493454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_015731	GTT	2	6	3493482	3493487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_015731	TGC	2	6	3493540	3493545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_015731	T	6	6	3493553	3493558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_015731	ACA	2	6	3493587	3493592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_015731	GAC	2	6	3493692	3493697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_015731	GTC	2	6	3493746	3493751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_015731	GCC	2	6	3493768	3493773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11553	NC_015731	GCCAA	2	10	3493833	3493842	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11554	NC_015731	CG	3	6	3493947	3493952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11555	NC_015731	GATA	2	8	3494045	3494052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_015731	TAA	2	6	3496687	3496692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_015731	A	8	8	3496719	3496726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_015731	GCT	2	6	3497503	3497508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_015731	A	6	6	3497514	3497519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_015731	TAA	2	6	3497566	3497571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_015731	ATC	2	6	3497575	3497580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_015731	CAA	2	6	3497585	3497590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_015731	AGC	2	6	3497640	3497645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_015731	ATA	2	6	3497763	3497768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_015731	AAT	2	6	3497783	3497788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_015731	GCA	2	6	3497814	3497819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_015731	AGC	2	6	3497851	3497856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_015731	TAC	2	6	3497988	3497993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_015731	T	6	6	3498003	3498008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_015731	ATT	2	6	3500002	3500007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_015731	ACT	2	6	3500042	3500047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_015731	ATTA	2	8	3500057	3500064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_015731	CTC	2	6	3500756	3500761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11574	NC_015731	AAT	2	6	3500793	3500798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_015731	ATCTT	2	10	3500809	3500818	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11576	NC_015731	ACA	2	6	3501932	3501937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_015731	TTTC	2	8	3504564	3504571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11578	NC_015731	GC	3	6	3504653	3504658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11579	NC_015731	TTC	2	6	3506036	3506041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11580	NC_015731	CAAT	2	8	3506107	3506114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11581	NC_015731	CCA	2	6	3506131	3506136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11582	NC_015731	T	6	6	3507732	3507737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_015731	AGCA	2	8	3507768	3507775	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11584	NC_015731	TGG	2	6	3510619	3510624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_015731	TGTT	2	8	3510629	3510636	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_015731	A	6	6	3510652	3510657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_015731	CAG	2	6	3510671	3510676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11590	NC_015731	ATT	2	6	3510714	3510719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_015731	CAT	2	6	3511989	3511994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_015731	AAT	2	6	3512045	3512050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_015731	GGCACA	2	12	3512052	3512063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_015731	TAA	2	6	3512074	3512079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_015731	ATCA	2	8	3514883	3514890	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11596	NC_015731	AAAG	2	8	3514893	3514900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_015731	AAT	2	6	3514959	3514964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_015731	GAT	2	6	3514971	3514976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_015731	AAAC	2	8	3514997	3515004	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11600	NC_015731	TTG	2	6	3515011	3515016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_015731	TCGATG	2	12	3515070	3515081	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11602	NC_015731	A	6	6	3515108	3515113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_015731	CGGC	2	8	3515115	3515122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11604	NC_015731	AAC	2	6	3515131	3515136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_015731	CGAC	2	8	3515180	3515187	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11606	NC_015731	A	6	6	3515189	3515194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_015731	TTC	2	6	3517529	3517534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11609	NC_015731	TTC	2	6	3518667	3518672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_015731	TTA	2	6	3520233	3520238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_015731	TAA	2	6	3520264	3520269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_015731	A	6	6	3520268	3520273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_015731	TTG	2	6	3520287	3520292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_015731	TA	3	6	3520318	3520323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_015731	TGC	2	6	3520351	3520356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_015731	TATT	2	8	3520378	3520385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_015731	CAT	2	6	3522979	3522984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_015731	CTG	2	6	3523709	3523714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_015731	ATT	2	6	3523715	3523720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_015731	TCA	2	6	3523735	3523740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_015731	GCA	2	6	3523751	3523756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_015731	GATA	2	8	3523789	3523796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_015731	TTA	2	6	3523821	3523826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_015731	ATA	2	6	3523849	3523854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_015731	TA	3	6	3523859	3523864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_015731	GTCA	2	8	3523872	3523879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11627	NC_015731	ATT	2	6	3523901	3523906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_015731	TAG	2	6	3523919	3523924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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