MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 12433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015731	AGT	2	6	219808	219813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015731	TCT	2	6	223374	223379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015731	TTA	2	6	223413	223418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015731	TGAATC	2	12	223448	223459	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
505	NC_015731	AAT	2	6	224399	224404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015731	CA	3	6	224405	224410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_015731	AAT	2	6	224431	224436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015731	TCAA	2	8	225144	225151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_015731	GCAA	2	8	225252	225259	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_015731	TACA	2	8	225272	225279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
511	NC_015731	TGC	2	6	225948	225953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_015731	AGTTG	2	10	226000	226009	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015731	TC	3	6	231534	231539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_015731	GCGG	2	8	231541	231548	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
515	NC_015731	CAC	2	6	233476	233481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_015731	AT	3	6	233493	233498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015731	TGAA	2	8	233617	233624	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015731	TGT	2	6	233642	233647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015731	AAT	2	6	240025	240030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015731	GTT	2	6	240058	240063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015731	TTC	2	6	240182	240187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015731	TAA	2	6	241831	241836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015731	AAT	2	6	242261	242266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015731	T	6	6	242349	242354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015731	A	7	7	242365	242371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015731	G	6	6	242398	242403	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015731	TCGA	2	8	242455	242462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
528	NC_015731	A	6	6	242513	242518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015731	ATAGA	2	10	243213	243222	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015731	TTGG	2	8	243434	243441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015731	TTGT	2	8	243509	243516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015731	GCT	2	6	243567	243572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015731	GTATA	2	10	243599	243608	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015731	GGC	2	6	243618	243623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_015731	TTCA	2	8	243709	243716	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_015731	TTG	2	6	243746	243751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015731	TCG	2	6	243775	243780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_015731	TAA	2	6	243784	243789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015731	CCGT	2	8	243829	243836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
540	NC_015731	A	7	7	245800	245806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015731	T	6	6	245831	245836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015731	AGG	2	6	245908	245913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015731	AGC	2	6	248849	248854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015731	TTA	2	6	248868	248873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015731	TAT	2	6	248879	248884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015731	TGG	2	6	248886	248891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015731	A	8	8	248907	248914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015731	GAT	2	6	248919	248924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015731	AGC	2	6	248941	248946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015731	TA	3	6	248965	248970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015731	TAC	3	9	249771	249779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_015731	A	6	6	250975	250980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015731	AAAAT	2	10	250995	251004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015731	TATTT	2	10	252689	252698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015731	GAAA	3	12	252709	252720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015731	AATT	2	8	252736	252743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015731	TG	3	6	252771	252776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015731	TATG	2	8	252795	252802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015731	T	6	6	252809	252814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015731	CAA	2	6	252818	252823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_015731	ATTG	2	8	252838	252845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015731	TGT	2	6	253176	253181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015731	GAA	2	6	253200	253205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015731	TG	3	6	253259	253264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015731	TAT	2	6	253281	253286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015731	T	6	6	254242	254247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015731	AGA	2	6	254307	254312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015731	TTA	2	6	254329	254334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015731	TTA	2	6	254340	254345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015731	TGT	2	6	254379	254384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015731	TAA	2	6	254415	254420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015731	CTT	2	6	254445	254450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015731	TTG	2	6	259899	259904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015731	TTTCTT	2	12	259938	259949	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
575	NC_015731	ATC	2	6	259960	259965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_015731	ATT	2	6	261325	261330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015731	TCT	2	6	261372	261377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_015731	ATT	2	6	261382	261387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015731	TAC	2	6	261390	261395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_015731	AAT	2	6	261534	261539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015731	CTC	2	6	261631	261636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_015731	CAG	2	6	261679	261684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_015731	ATT	2	6	261691	261696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015731	ATA	2	6	261878	261883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015731	A	6	6	261984	261989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015731	TTG	2	6	262012	262017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015731	CGC	2	6	262018	262023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_015731	CAATA	2	10	262035	262044	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
589	NC_015731	TTG	2	6	262054	262059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015731	ATTT	2	8	262061	262068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015731	A	6	6	262521	262526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015731	TCT	2	6	262537	262542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015731	ATTG	2	8	262940	262947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015731	TGAT	2	8	262952	262959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015731	GTAA	2	8	265170	265177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015731	AATT	2	8	267522	267529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015731	ATCA	2	8	267558	267565	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
598	NC_015731	AGCT	2	8	267577	267584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
599	NC_015731	TC	3	6	267596	267601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_015731	TAA	2	6	267605	267610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015731	GAA	2	6	267690	267695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015731	CAA	2	6	267732	267737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_015731	GTATG	2	10	271490	271499	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015731	AGCT	2	8	271539	271546	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
605	NC_015731	TAAG	2	8	271565	271572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015731	A	7	7	271584	271590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015731	TAAT	2	8	273763	273770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015731	ATT	2	6	273776	273781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015731	ACA	2	6	273911	273916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_015731	ATT	2	6	273936	273941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015731	T	6	6	275205	275210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015731	TGAT	2	8	275215	275222	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015731	GTAA	2	8	275229	275236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015731	GGTT	2	8	275332	275339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015731	ATTTT	2	10	275342	275351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015731	CAT	2	6	276078	276083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_015731	T	6	6	276117	276122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015731	AAC	2	6	276147	276152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_015731	TTGA	2	8	276196	276203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015731	TTA	2	6	280737	280742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015731	AGA	2	6	280791	280796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015731	TGA	2	6	280866	280871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015731	TCGC	2	8	280880	280887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
624	NC_015731	TCT	2	6	280904	280909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_015731	T	6	6	280953	280958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015731	A	6	6	280969	280974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015731	TAAA	2	8	281012	281019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015731	AGAA	2	8	281034	281041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015731	CAT	2	6	281182	281187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_015731	CTTG	2	8	281190	281197	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_015731	CAG	2	6	281210	281215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_015731	ATGG	2	8	281329	281336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015731	ATTT	2	8	281341	281348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015731	CAAA	2	8	281360	281367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
635	NC_015731	CG	3	6	281422	281427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
636	NC_015731	TATC	2	8	281428	281435	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
637	NC_015731	AT	3	6	281478	281483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015731	CGT	2	6	281484	281489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_015731	TCT	2	6	281529	281534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_015731	AAGC	2	8	281552	281559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
641	NC_015731	ATA	2	6	281660	281665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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912	NC_015731	T	7	7	321917	321923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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