MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. Is79A3 chromosome

Total Repeats: 12433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015731	T	6	6	1516713	1516718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_015731	A	6	6	1516742	1516747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_015731	ATTA	2	8	1516783	1516790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_015731	TAT	2	6	1518679	1518684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_015731	TTGCAT	2	12	1518697	1518708	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5006	NC_015731	ACA	2	6	1519144	1519149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_015731	ATC	2	6	1519154	1519159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_015731	TCA	2	6	1519481	1519486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_015731	A	6	6	1519498	1519503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_015731	CAG	2	6	1520302	1520307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_015731	TCCC	2	8	1520323	1520330	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5012	NC_015731	T	6	6	1520348	1520353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_015731	AGA	2	6	1521798	1521803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_015731	AAG	2	6	1521833	1521838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_015731	AG	3	6	1521868	1521873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_015731	TGAA	2	8	1521938	1521945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_015731	GAAAAA	2	12	1521957	1521968	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_015731	AGG	2	6	1521974	1521979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_015731	CGC	2	6	1522034	1522039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_015731	GGC	2	6	1522049	1522054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_015731	AAC	2	6	1525572	1525577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_015731	CAATC	2	10	1525615	1525624	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5023	NC_015731	CAAG	2	8	1525659	1525666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5024	NC_015731	TGC	2	6	1525701	1525706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_015731	GTT	2	6	1525709	1525714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_015731	CGG	2	6	1525805	1525810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_015731	CAA	2	6	1525835	1525840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_015731	TGAA	2	8	1525868	1525875	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_015731	TTA	2	6	1525893	1525898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_015731	GTT	2	6	1525910	1525915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_015731	CAC	2	6	1525986	1525991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_015731	GAAT	2	8	1527418	1527425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_015731	GA	3	6	1530845	1530850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_015731	TCC	2	6	1531257	1531262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_015731	GAT	2	6	1531265	1531270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_015731	GGAA	2	8	1531273	1531280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_015731	ATT	2	6	1531291	1531296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_015731	TAG	2	6	1531306	1531311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_015731	CTAC	2	8	1531324	1531331	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_015731	AAC	2	6	1531338	1531343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_015731	ATTT	2	8	1533413	1533420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_015731	TAT	2	6	1533440	1533445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_015731	AAGT	2	8	1533446	1533453	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_015731	TTAA	2	8	1534164	1534171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_015731	TTG	2	6	1535453	1535458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_015731	T	7	7	1535582	1535588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_015731	ATA	2	6	1535605	1535610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_015731	CAG	2	6	1535651	1535656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_015731	ATT	2	6	1535659	1535664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_015731	CTA	2	6	1535772	1535777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_015731	AAAT	2	8	1535815	1535822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_015731	TTG	2	6	1535853	1535858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_015731	CAG	2	6	1536548	1536553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_015731	GCA	2	6	1537007	1537012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_015731	ATG	2	6	1537035	1537040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_015731	ATG	2	6	1541696	1541701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_015731	T	6	6	1541779	1541784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_015731	ATT	2	6	1541793	1541798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_015731	TCCG	2	8	1546252	1546259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5060	NC_015731	AGA	2	6	1546284	1546289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_015731	TAA	2	6	1547997	1548002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_015731	TAA	2	6	1548026	1548031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_015731	TATT	2	8	1550433	1550440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_015731	T	6	6	1551217	1551222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_015731	GA	4	8	1552093	1552100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_015731	GGTA	2	8	1552250	1552257	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_015731	CTT	2	6	1552268	1552273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_015731	CCA	2	6	1552298	1552303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_015731	AAAC	2	8	1556927	1556934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_015731	AGG	2	6	1556935	1556940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_015731	CAAT	2	8	1557525	1557532	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_015731	TCA	2	6	1557617	1557622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_015731	T	7	7	1558155	1558161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_015731	ACTT	2	8	1560423	1560430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5075	NC_015731	AGAA	2	8	1561425	1561432	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_015731	T	7	7	1561462	1561468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_015731	CCA	2	6	1561489	1561494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_015731	CA	3	6	1567118	1567123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5079	NC_015731	CAT	2	6	1568628	1568633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_015731	GAATT	2	10	1575053	1575062	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_015731	CGT	2	6	1575590	1575595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_015731	TGC	2	6	1575629	1575634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_015731	TAG	2	6	1575643	1575648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_015731	TAT	2	6	1575672	1575677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_015731	TAT	2	6	1575760	1575765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_015731	GTA	2	6	1575784	1575789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_015731	AT	3	6	1575837	1575842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_015731	AAT	2	6	1576886	1576891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_015731	AAATC	2	10	1576985	1576994	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5090	NC_015731	AAT	2	6	1577018	1577023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_015731	CAT	2	6	1577478	1577483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_015731	ATT	2	6	1577489	1577494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_015731	ATT	2	6	1577504	1577509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_015731	GAA	2	6	1577576	1577581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_015731	T	6	6	1577614	1577619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_015731	CTG	2	6	1577644	1577649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_015731	TAA	2	6	1577650	1577655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_015731	TTA	2	6	1577656	1577661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_015731	ATA	2	6	1577678	1577683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_015731	TGAT	2	8	1577713	1577720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_015731	TAC	2	6	1577731	1577736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_015731	CCA	2	6	1577769	1577774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_015731	ATT	2	6	1580953	1580958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_015731	A	7	7	1582940	1582946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_015731	ATC	2	6	1585292	1585297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5107	NC_015731	TA	4	8	1585339	1585346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_015731	TGA	2	6	1585350	1585355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_015731	ATT	2	6	1586781	1586786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_015731	ATTTG	2	10	1586809	1586818	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_015731	ACT	2	6	1586824	1586829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_015731	ATC	2	6	1586854	1586859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_015731	A	6	6	1586928	1586933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015731	ATT	2	6	1587052	1587057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_015731	CAG	2	6	1587080	1587085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_015731	GAT	2	6	1587090	1587095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_015731	CTTA	2	8	1587269	1587276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_015731	TAAA	2	8	1587289	1587296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_015731	TGA	2	6	1587306	1587311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_015731	T	7	7	1587317	1587323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_015731	ATA	2	6	1588750	1588755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_015731	ATC	2	6	1588767	1588772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_015731	ATT	2	6	1589413	1589418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_015731	GA	3	6	1589524	1589529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_015731	GTC	2	6	1589558	1589563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_015731	AAT	2	6	1589572	1589577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_015731	ATT	2	6	1589642	1589647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_015731	A	6	6	1589674	1589679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_015731	TGA	2	6	1589711	1589716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5131	NC_015731	T	7	7	1590976	1590982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5264	NC_015731	TCCT	2	8	1608295	1608302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5361	NC_015731	AGCA	2	8	1622718	1622725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5386	NC_015731	CTT	2	6	1633155	1633160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5390	NC_015731	TC	3	6	1633216	1633221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5391	NC_015731	GC	4	8	1633464	1633471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5392	NC_015731	CG	3	6	1633478	1633483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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