MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Mpl

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015583	GACCTG	2	12	79590	79601	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015583	AACCGC	2	12	94786	94797	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015583	CCTGTG	2	12	121187	121198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015583	GGTCAA	2	12	126007	126018	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015583	GTCTTC	2	12	128997	129008	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015583	GCCAAG	2	12	162373	162384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015583	CAAGCC	2	12	162405	162416	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015583	GGGCGG	2	12	199367	199378	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015583	TGCCTT	2	12	218019	218030	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015583	GCGAAA	2	12	382174	382185	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015583	CCCGCG	2	12	420681	420692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_015583	CTGCTC	2	12	421326	421337	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015583	GGATTG	2	12	426355	426366	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015583	GCCCAT	2	12	426843	426854	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015583	CCTATC	2	12	428630	428641	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015583	AAAAGC	2	12	447812	447823	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015583	CCCAGA	2	12	494455	494466	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015583	TGCAGG	2	12	519418	519429	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015583	ATTGGA	2	12	568510	568521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015583	CTTGCC	2	12	595465	595476	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015583	CGAACT	2	12	629962	629973	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015583	ATAACG	2	12	635545	635556	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015583	CGCAGA	2	12	673247	673258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015583	CAATCG	2	12	682827	682838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015583	GTCATT	2	12	734634	734645	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015583	TATAAC	2	12	743659	743670	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015583	GAGGGA	2	12	762115	762126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015583	GCCATC	2	12	763676	763687	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015583	AACCCG	2	12	779563	779574	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015583	TCTCTT	2	12	789279	789290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015583	GCATCA	2	12	796456	796467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015583	GCGGAC	2	12	846634	846645	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015583	CGCGTC	2	12	871635	871646	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015583	CCTTGC	2	12	874883	874894	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015583	CAGGTG	2	12	875355	875366	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015583	TGCAGG	2	12	876855	876866	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015583	CGCGTC	2	12	919454	919465	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015583	GTTCGC	2	12	955124	955135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015583	GGGAGA	2	12	1008372	1008383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015583	CGGGCG	2	12	1060926	1060937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015583	CGGCAA	2	12	1067879	1067890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015583	TTTTCC	2	12	1134855	1134866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.