MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Mpl

Total Repeats: 2516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015583	TGA	2	6	243974	243979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015583	C	6	6	244000	244005	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
503	NC_015583	C	6	6	244030	244035	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
504	NC_015583	GC	3	6	244082	244087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_015583	C	6	6	244131	244136	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
506	NC_015583	GC	4	8	244157	244164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_015583	CTT	2	6	244165	244170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_015583	C	7	7	244172	244178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
509	NC_015583	GC	4	8	244189	244196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_015583	CAGG	2	8	244665	244672	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
511	NC_015583	GCG	2	6	244701	244706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_015583	GC	3	6	245930	245935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
513	NC_015583	CCG	2	6	250601	250606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_015583	CCCG	2	8	250619	250626	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
515	NC_015583	GC	3	6	250700	250705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_015583	TTC	2	6	250721	250726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_015583	CGAA	2	8	256619	256626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
518	NC_015583	GAA	2	6	256701	256706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015583	ATA	2	6	256757	256762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015583	AAC	2	6	259054	259059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015583	CG	3	6	259097	259102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_015583	GATC	2	8	259151	259158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
523	NC_015583	CGT	2	6	259174	259179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015583	CGA	2	6	259777	259782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_015583	GC	3	6	263611	263616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
526	NC_015583	AGG	2	6	263664	263669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015583	GCC	2	6	263697	263702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_015583	TCC	2	6	263704	263709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_015583	GGC	2	6	263736	263741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015583	GCG	2	6	263758	263763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015583	ACTTA	2	10	263768	263777	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
532	NC_015583	CG	3	6	263825	263830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_015583	TCC	2	6	264704	264709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_015583	CTGC	2	8	264724	264731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
535	NC_015583	GTA	2	6	266622	266627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015583	AAG	2	6	267658	267663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015583	CGCGG	2	10	267696	267705	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
538	NC_015583	GC	3	6	267707	267712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_015583	TCT	2	6	267723	267728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_015583	CGGCC	2	10	267748	267757	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
541	NC_015583	AGTG	2	8	267777	267784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015583	CGG	2	6	267798	267803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015583	GAT	2	6	267813	267818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015583	GCCG	2	8	267829	267836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_015583	ATT	3	9	270409	270417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015583	TC	3	6	270424	270429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_015583	GC	4	8	270548	270555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_015583	CT	3	6	271572	271577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_015583	CGG	2	6	277316	277321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015583	TCGT	2	8	277342	277349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
551	NC_015583	GCC	2	6	277357	277362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_015583	GCC	2	6	277378	277383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_015583	T	6	6	277511	277516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015583	AT	4	8	277523	277530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015583	GCA	2	6	277561	277566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_015583	CT	3	6	277576	277581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_015583	GAA	2	6	277589	277594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015583	GTCA	2	8	278561	278568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
559	NC_015583	GGC	2	6	278628	278633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015583	GCC	2	6	279377	279382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_015583	CGC	2	6	279390	279395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_015583	CCGC	2	8	279412	279419	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
563	NC_015583	TGCC	2	8	279434	279441	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
564	NC_015583	TC	3	6	279458	279463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_015583	CCG	3	9	282178	282186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_015583	CGC	2	6	282242	282247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_015583	CAA	2	6	285667	285672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_015583	ATT	2	6	285704	285709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015583	GC	3	6	285723	285728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_015583	AATA	2	8	285783	285790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015583	AT	4	8	285794	285801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015583	ATG	2	6	285829	285834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015583	CGC	2	6	285942	285947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_015583	GGCC	2	8	286814	286821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_015583	CGC	2	6	286864	286869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_015583	AAC	2	6	286891	286896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015583	CCCGG	2	10	289468	289477	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
578	NC_015583	CCAG	2	8	289611	289618	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
579	NC_015583	CTC	2	6	289638	289643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_015583	CCGGG	2	10	289647	289656	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
581	NC_015583	CTC	2	6	306748	306753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_015583	TC	3	6	306752	306757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
583	NC_015583	ATTT	2	8	306867	306874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015583	GA	3	6	306920	306925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015583	ACGC	2	8	313888	313895	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
586	NC_015583	AGG	2	6	314696	314701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015583	CG	3	6	316769	316774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_015583	TAA	2	6	317628	317633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015583	ATC	2	6	317665	317670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_015583	GAG	2	6	318401	318406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015583	TCCTC	2	10	321508	321517	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
592	NC_015583	TCC	3	9	323897	323905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_015583	CGG	2	6	324688	324693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_015583	TCG	2	6	329268	329273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_015583	TAC	2	6	329276	329281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015583	CTG	2	6	329312	329317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_015583	CCG	2	6	329335	329340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_015583	GCGCC	2	10	329379	329388	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
599	NC_015583	ACCGC	2	10	329427	329436	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
600	NC_015583	TGC	2	6	330035	330040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_015583	TCC	2	6	331431	331436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_015583	CT	3	6	336420	336425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_015583	CAG	2	6	336434	336439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015583	TCG	2	6	336450	336455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_015583	CGG	2	6	336501	336506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_015583	TC	3	6	336587	336592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_015583	CCG	3	9	336593	336601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_015583	ATG	2	6	336616	336621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015583	CG	3	6	336830	336835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_015583	CGG	2	6	336844	336849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_015583	TCT	2	6	337685	337690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_015583	GGGC	2	8	337751	337758	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
613	NC_015583	TC	3	6	339875	339880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
614	NC_015583	CCGG	2	8	339890	339897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_015583	CGC	2	6	339922	339927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_015583	CG	3	6	339937	339942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_015583	AGCG	2	8	339965	339972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
618	NC_015583	GAT	2	6	340065	340070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015583	CGA	2	6	340182	340187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_015583	TCA	2	6	340223	340228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_015583	TCG	2	6	340235	340240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_015583	TC	4	8	340350	340357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
623	NC_015583	TA	3	6	340382	340387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015583	AAG	2	6	340410	340415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015583	ATTG	2	8	340453	340460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015583	CGC	2	6	340529	340534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_015583	GA	4	8	340559	340566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015583	CG	3	6	344332	344337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
629	NC_015583	GCA	2	6	344361	344366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_015583	ACAT	2	8	344501	344508	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_015583	ATT	2	6	344512	344517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015583	AGC	2	6	345324	345329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_015583	CGC	3	9	346054	346062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_015583	CGGAT	2	10	347527	347536	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
635	NC_015583	CAA	2	6	347571	347576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015583	TTC	2	6	347609	347614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_015583	GCC	2	6	347628	347633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_015583	CGGC	2	8	347640	347647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
639	NC_015583	TAC	2	6	349449	349454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_015583	TTG	2	6	350341	350346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_015583	GA	3	6	350393	350398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
642	NC_015583	CGGC	2	8	354355	354362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
643	NC_015583	GAT	2	6	355159	355164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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645	NC_015583	CGG	2	6	356305	356310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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649	NC_015583	AT	4	8	362057	362064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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655	NC_015583	GA	3	6	366481	366486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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673	NC_015583	TCG	2	6	374657	374662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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765	NC_015583	TGC	2	6	420396	420401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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770	NC_015583	CAG	2	6	420567	420572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
771	NC_015583	ATCG	2	8	420649	420656	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
772	NC_015583	CCCGCG	2	12	420681	420692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
773	NC_015583	GCT	2	6	420699	420704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
774	NC_015583	T	6	6	420799	420804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
775	NC_015583	TGC	2	6	420829	420834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
776	NC_015583	ATCGC	2	10	421299	421308	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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778	NC_015583	CTGCTC	2	12	421326	421337	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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