MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 9484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015580	TTC	2	6	1699182	1699187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_015580	CGC	2	6	1699220	1699225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_015580	TGC	2	6	1699246	1699251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_015580	GAG	3	9	1699270	1699278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_015580	GAG	2	6	1699312	1699317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_015580	TCC	2	6	1699735	1699740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_015580	GTA	2	6	1699785	1699790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_015580	GGCG	2	8	1705062	1705069	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_015580	AGGGA	2	10	1705090	1705099	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_015580	GCC	2	6	1707924	1707929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_015580	CCT	2	6	1707934	1707939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_015580	AAC	2	6	1708029	1708034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_015580	GT	3	6	1708083	1708088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_015580	CT	3	6	1711217	1711222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_015580	ATG	2	6	1711252	1711257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_015580	CGG	2	6	1711281	1711286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_015580	CCG	2	6	1711324	1711329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_015580	GCCG	2	8	1711338	1711345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_015580	GGCA	2	8	1711369	1711376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_015580	CG	4	8	1711392	1711399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4021	NC_015580	CG	4	8	1711449	1711456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_015580	AGG	2	6	1711469	1711474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_015580	GCG	2	6	1713223	1713228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_015580	CGCGC	2	10	1713313	1713322	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4025	NC_015580	CTG	2	6	1713357	1713362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_015580	TCA	2	6	1713378	1713383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_015580	CG	3	6	1713450	1713455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_015580	GAT	2	6	1713460	1713465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_015580	CGGG	2	8	1717575	1717582	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4030	NC_015580	AGG	2	6	1717590	1717595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015580	GCG	2	6	1717644	1717649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_015580	GCCTT	2	10	1717670	1717679	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4033	NC_015580	CAG	2	6	1717705	1717710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_015580	GTC	2	6	1717717	1717722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_015580	CGC	2	6	1717740	1717745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_015580	CGC	2	6	1717767	1717772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_015580	GCT	2	6	1717837	1717842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_015580	AGC	2	6	1717865	1717870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_015580	GC	5	10	1717936	1717945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_015580	GCG	2	6	1718062	1718067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_015580	CG	3	6	1719581	1719586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_015580	CGA	2	6	1719641	1719646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_015580	GGC	2	6	1719660	1719665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_015580	TCG	2	6	1719674	1719679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_015580	TCC	2	6	1719770	1719775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_015580	GC	3	6	1719847	1719852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_015580	GCGCG	2	10	1719897	1719906	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4048	NC_015580	GCC	2	6	1720266	1720271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4049	NC_015580	CTGC	2	8	1720306	1720313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_015580	GGC	2	6	1720328	1720333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_015580	CG	3	6	1720345	1720350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_015580	CCG	2	6	1720366	1720371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_015580	CGC	2	6	1720372	1720377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_015580	CAGG	2	8	1721240	1721247	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4055	NC_015580	GAAGG	2	10	1721255	1721264	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_015580	GTGC	2	8	1721271	1721278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4057	NC_015580	AGG	2	6	1721288	1721293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_015580	AGA	2	6	1721308	1721313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_015580	TGC	2	6	1721333	1721338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_015580	GGC	2	6	1721356	1721361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_015580	CGA	2	6	1721417	1721422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_015580	GAA	2	6	1721435	1721440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015580	G	6	6	1721457	1721462	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015580	ACG	2	6	1721494	1721499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_015580	TC	3	6	1721537	1721542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_015580	CCT	2	6	1721549	1721554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_015580	TGC	2	6	1721567	1721572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_015580	AGC	2	6	1721576	1721581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_015580	TCGGGC	2	12	1721600	1721611	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_015580	TCG	2	6	1721654	1721659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_015580	GAT	2	6	1721679	1721684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_015580	GGGCA	2	10	1721700	1721709	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4073	NC_015580	TCA	2	6	1722606	1722611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_015580	GATG	2	8	1722642	1722649	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_015580	TTC	2	6	1723842	1723847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_015580	ATGA	2	8	1723863	1723870	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_015580	GTC	2	6	1723946	1723951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_015580	CGA	2	6	1723963	1723968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_015580	AGG	2	6	1723974	1723979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_015580	GATC	2	8	1724020	1724027	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_015580	CGA	2	6	1724116	1724121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_015580	GC	3	6	1724134	1724139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_015580	TG	3	6	1731412	1731417	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_015580	A	6	6	1731461	1731466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_015580	A	6	6	1731470	1731475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_015580	GCCG	2	8	1733204	1733211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_015580	TGA	2	6	1733229	1733234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_015580	GACG	2	8	1733257	1733264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4089	NC_015580	TCA	2	6	1733279	1733284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_015580	TGAG	2	8	1733327	1733334	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_015580	GGAA	2	8	1733335	1733342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015580	G	6	6	1733343	1733348	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_015580	TTG	2	6	1733355	1733360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015580	AAG	2	6	1733362	1733367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_015580	ATT	2	6	1733373	1733378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_015580	CAT	2	6	1734997	1735002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_015580	CG	3	6	1735007	1735012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_015580	TTG	2	6	1737024	1737029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_015580	TCC	2	6	1737892	1737897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_015580	CTG	2	6	1738360	1738365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_015580	AAGGC	2	10	1738379	1738388	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4102	NC_015580	GGA	2	6	1738417	1738422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015580	GCT	2	6	1738434	1738439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_015580	GGC	2	6	1738446	1738451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_015580	GGT	2	6	1738467	1738472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015580	TGGT	2	8	1738488	1738495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_015580	TCG	2	6	1738569	1738574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_015580	TCG	2	6	1738586	1738591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_015580	GAA	2	6	1738848	1738853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_015580	AGG	2	6	1738865	1738870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_015580	TTC	2	6	1738884	1738889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_015580	TC	3	6	1738958	1738963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_015580	AGGA	2	8	1738983	1738990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_015580	GGCC	2	8	1740621	1740628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4115	NC_015580	GC	3	6	1741435	1741440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_015580	CGC	2	6	1741488	1741493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_015580	GGC	2	6	1741495	1741500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_015580	GC	3	6	1741499	1741504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4119	NC_015580	GGC	2	6	1741524	1741529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_015580	GCC	2	6	1741534	1741539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_015580	GCC	2	6	1741585	1741590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_015580	CGG	2	6	1741617	1741622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_015580	CAGC	2	8	1741705	1741712	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_015580	CAC	2	6	1741742	1741747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_015580	G	6	6	1741785	1741790	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_015580	GACG	2	8	1741874	1741881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4127	NC_015580	TCG	2	6	1741965	1741970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_015580	GAG	2	6	1742005	1742010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_015580	TTCA	2	8	1742052	1742059	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4130	NC_015580	GC	3	6	1742134	1742139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_015580	CG	3	6	1746964	1746969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4251	NC_015580	TC	3	6	1775336	1775341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4263	NC_015580	CGG	3	9	1779059	1779067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4382	NC_015580	GCG	3	9	1812923	1812931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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