MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 9484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015580	CTT	2	6	1490230	1490235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_015580	GC	3	6	1490264	1490269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_015580	GGCT	2	8	1490698	1490705	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3504	NC_015580	GGCA	2	8	1492824	1492831	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_015580	CGGTT	2	10	1492842	1492851	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3506	NC_015580	TGC	2	6	1493028	1493033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_015580	GCGCC	2	10	1493524	1493533	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3508	NC_015580	GCG	2	6	1493549	1493554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_015580	TTC	2	6	1493566	1493571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_015580	CGC	2	6	1493574	1493579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_015580	CAGG	2	8	1493606	1493613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3512	NC_015580	CAA	2	6	1495362	1495367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_015580	A	6	6	1495366	1495371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_015580	CTC	2	6	1495433	1495438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_015580	TCCT	2	8	1495449	1495456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_015580	GCA	2	6	1495525	1495530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_015580	CCA	3	9	1495581	1495589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_015580	CGA	2	6	1495659	1495664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_015580	AGA	2	6	1495673	1495678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_015580	ATC	2	6	1497317	1497322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_015580	GCG	2	6	1497407	1497412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_015580	TCAAG	2	10	1497594	1497603	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3523	NC_015580	TGCA	2	8	1497612	1497619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_015580	GGC	2	6	1497629	1497634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_015580	GGC	2	6	1497795	1497800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_015580	CTT	2	6	1497894	1497899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_015580	CG	3	6	1498757	1498762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_015580	GC	3	6	1498781	1498786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_015580	GAA	2	6	1498799	1498804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_015580	CAGC	2	8	1499743	1499750	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_015580	TTG	2	6	1499805	1499810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_015580	CGC	2	6	1499821	1499826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_015580	TTG	2	6	1499872	1499877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_015580	TCA	2	6	1499889	1499894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_015580	TCGG	2	8	1499901	1499908	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_015580	GACC	2	8	1499910	1499917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_015580	GAGAG	2	10	1499934	1499943	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_015580	GCGCG	2	10	1500515	1500524	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3539	NC_015580	CTT	2	6	1500539	1500544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_015580	CG	3	6	1500630	1500635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_015580	TG	3	6	1502742	1502747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_015580	GCAGG	2	10	1502753	1502762	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3543	NC_015580	AGG	2	6	1506084	1506089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_015580	GCT	2	6	1506123	1506128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_015580	CCAT	2	8	1506139	1506146	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_015580	CTGC	2	8	1506164	1506171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_015580	CCG	2	6	1510075	1510080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_015580	ACGG	2	8	1510094	1510101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_015580	CCCACT	2	12	1510106	1510117	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_015580	GC	3	6	1510143	1510148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_015580	AGGC	2	8	1510158	1510165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3552	NC_015580	GCC	2	6	1510473	1510478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_015580	T	6	6	1510479	1510484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_015580	CGG	2	6	1510505	1510510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_015580	GGT	2	6	1510928	1510933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_015580	AGCCT	2	10	1510996	1511005	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3557	NC_015580	TGC	2	6	1511025	1511030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_015580	TTTGC	2	10	1512418	1512427	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3559	NC_015580	GC	3	6	1512451	1512456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_015580	GCT	2	6	1512470	1512475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_015580	GGC	2	6	1512488	1512493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_015580	AGGC	2	8	1512501	1512508	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3563	NC_015580	ATCG	2	8	1512596	1512603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3564	NC_015580	TTC	2	6	1512611	1512616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_015580	CG	4	8	1512684	1512691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_015580	GAT	2	6	1513561	1513566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_015580	CGC	2	6	1513604	1513609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_015580	TGC	2	6	1517725	1517730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_015580	CTG	2	6	1519807	1519812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_015580	AGGC	2	8	1519816	1519823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_015580	C	6	6	1520451	1520456	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3572	NC_015580	ATGGG	2	10	1520526	1520535	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_015580	GAG	2	6	1520536	1520541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_015580	GC	3	6	1524176	1524181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_015580	GTG	2	6	1524211	1524216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_015580	C	6	6	1525972	1525977	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3577	NC_015580	TC	3	6	1526079	1526084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3578	NC_015580	GTG	2	6	1527034	1527039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_015580	CCTA	2	8	1527065	1527072	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_015580	GGC	2	6	1527884	1527889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_015580	CG	4	8	1527936	1527943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_015580	GCC	2	6	1528056	1528061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_015580	AGG	2	6	1528117	1528122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_015580	GCA	2	6	1528124	1528129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_015580	CGGG	2	8	1528165	1528172	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3586	NC_015580	TCG	2	6	1528210	1528215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_015580	TCC	2	6	1529669	1529674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_015580	GCG	2	6	1530299	1530304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_015580	CGT	2	6	1530317	1530322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_015580	GGA	2	6	1530354	1530359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_015580	GCG	2	6	1532504	1532509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_015580	CGA	2	6	1532578	1532583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_015580	GGT	2	6	1532673	1532678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_015580	AGA	2	6	1532761	1532766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_015580	GCG	2	6	1532767	1532772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_015580	GGT	2	6	1532789	1532794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_015580	CGG	2	6	1532942	1532947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_015580	CGA	2	6	1532954	1532959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_015580	AGGAT	2	10	1532961	1532970	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_015580	TGC	2	6	1532975	1532980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_015580	GCG	2	6	1533084	1533089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_015580	CGC	2	6	1533107	1533112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_015580	GCT	2	6	1533125	1533130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_015580	TCG	2	6	1533157	1533162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_015580	GTC	2	6	1533183	1533188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_015580	GCG	2	6	1533220	1533225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_015580	GCC	2	6	1533234	1533239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_015580	GAAGC	2	10	1533242	1533251	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3609	NC_015580	GTA	2	6	1533288	1533293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_015580	GCG	2	6	1533308	1533313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_015580	GC	3	6	1533389	1533394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3612	NC_015580	GTC	2	6	1533416	1533421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_015580	AGG	2	6	1533448	1533453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_015580	GGCCT	2	10	1533549	1533558	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3615	NC_015580	ATGGC	2	10	1533577	1533586	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3616	NC_015580	TC	3	6	1533638	1533643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_015580	TGA	2	6	1533645	1533650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_015580	GGC	2	6	1533785	1533790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_015580	GAA	2	6	1533830	1533835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_015580	GCG	2	6	1535802	1535807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_015580	TCC	2	6	1536326	1536331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_015580	CGC	2	6	1536608	1536613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_015580	CTGA	2	8	1536618	1536625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3624	NC_015580	GGGC	2	8	1536682	1536689	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_015580	GCCG	2	8	1539048	1539055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_015580	CGC	2	6	1539056	1539061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_015580	GC	3	6	1539067	1539072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_015580	GAG	2	6	1539078	1539083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_015580	CCA	2	6	1539085	1539090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3630	NC_015580	GC	3	6	1539139	1539144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3631	NC_015580	CTG	2	6	1539147	1539152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_015580	GCGCC	2	10	1539200	1539209	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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3765	NC_015580	TGGA	2	8	1610298	1610305	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3773	NC_015580	CG	4	8	1618123	1618130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3780	NC_015580	GAAA	2	8	1618956	1618963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3781	NC_015580	GC	3	6	1618979	1618984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3796	NC_015580	GCTC	2	8	1619852	1619859	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3888	NC_015580	GGCA	2	8	1653006	1653013	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3889	NC_015580	GC	3	6	1655286	1655291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3896	NC_015580	GCG	2	6	1660806	1660811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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