MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 9484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015580	GGCA	2	8	1289277	1289284	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_015580	GCAGC	2	10	1290035	1290044	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3003	NC_015580	CA	3	6	1292204	1292209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_015580	GAT	2	6	1292812	1292817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_015580	TCG	2	6	1292952	1292957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_015580	TGA	2	6	1292988	1292993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_015580	GGC	2	6	1293004	1293009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_015580	TCC	2	6	1295419	1295424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_015580	GAT	2	6	1295523	1295528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_015580	GCG	2	6	1295575	1295580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_015580	TC	3	6	1295584	1295589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_015580	TGAT	3	12	1295635	1295646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_015580	CGC	2	6	1295647	1295652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_015580	TGA	2	6	1295666	1295671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_015580	AT	3	6	1297555	1297560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_015580	GGGCG	2	10	1297561	1297570	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3017	NC_015580	CTG	2	6	1297572	1297577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_015580	CTTTT	2	10	1298118	1298127	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3019	NC_015580	AT	3	6	1298179	1298184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_015580	C	6	6	1300307	1300312	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3021	NC_015580	GCG	2	6	1300323	1300328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_015580	G	6	6	1300328	1300333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015580	TTTTG	2	10	1300337	1300346	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_015580	ATG	2	6	1301896	1301901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015580	CGG	2	6	1301907	1301912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_015580	CGG	2	6	1301915	1301920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_015580	CGT	2	6	1301999	1302004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_015580	CAC	2	6	1302032	1302037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_015580	CGGG	2	8	1302069	1302076	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3030	NC_015580	CGC	2	6	1303900	1303905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_015580	CGG	2	6	1305850	1305855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_015580	ACC	2	6	1308379	1308384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_015580	GCG	2	6	1308421	1308426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_015580	GGA	3	9	1308427	1308435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_015580	GGCT	2	8	1308448	1308455	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3036	NC_015580	T	6	6	1308513	1308518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_015580	A	6	6	1308520	1308525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_015580	CGG	2	6	1308570	1308575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_015580	AC	3	6	1308577	1308582	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_015580	AG	3	6	1308635	1308640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015580	CGG	2	6	1308670	1308675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_015580	TTG	2	6	1308686	1308691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015580	AAGC	2	8	1308763	1308770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_015580	TGC	2	6	1308869	1308874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_015580	GAAC	2	8	1308915	1308922	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_015580	GGC	2	6	1308926	1308931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_015580	TGG	2	6	1309109	1309114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_015580	CGA	2	6	1309133	1309138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_015580	GAT	2	6	1309158	1309163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_015580	GCA	2	6	1309207	1309212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_015580	GTGA	2	8	1309260	1309267	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_015580	GAT	2	6	1309303	1309308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_015580	CAG	2	6	1309350	1309355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_015580	GGAG	2	8	1309368	1309375	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_015580	GTT	2	6	1309381	1309386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_015580	GC	3	6	1309406	1309411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_015580	GAA	2	6	1309542	1309547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015580	GACT	2	8	1309564	1309571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_015580	GAT	2	6	1309649	1309654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_015580	AG	3	6	1309843	1309848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_015580	TGC	2	6	1309884	1309889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_015580	GTC	2	6	1309896	1309901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_015580	TCGTG	2	10	1309905	1309914	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3064	NC_015580	CAT	2	6	1309964	1309969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_015580	TTGG	2	8	1309970	1309977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_015580	GGA	2	6	1310008	1310013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_015580	AC	3	6	1310059	1310064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3068	NC_015580	AC	3	6	1310227	1310232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3069	NC_015580	CCT	2	6	1310370	1310375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_015580	GAAA	2	8	1310388	1310395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_015580	TC	3	6	1310423	1310428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3072	NC_015580	CGT	2	6	1310446	1310451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_015580	TG	3	6	1310490	1310495	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_015580	GCC	2	6	1310517	1310522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_015580	GGCATG	2	12	1310538	1310549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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3077	NC_015580	CCA	2	6	1310724	1310729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_015580	GCC	2	6	1310777	1310782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3079	NC_015580	GC	3	6	1310808	1310813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_015580	T	6	6	1310967	1310972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_015580	CGT	2	6	1310989	1310994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_015580	ACG	2	6	1311043	1311048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_015580	TGG	2	6	1311155	1311160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_015580	TC	3	6	1311275	1311280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3085	NC_015580	TGAG	2	8	1311302	1311309	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015580	AT	3	6	1311334	1311339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_015580	GGA	2	6	1311385	1311390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_015580	TAG	2	6	1311414	1311419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_015580	GCGA	2	8	1311422	1311429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_015580	CTT	2	6	1311448	1311453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_015580	AAG	2	6	1311523	1311528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_015580	G	6	6	1311569	1311574	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_015580	ACC	2	6	1311575	1311580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_015580	GGA	2	6	1311891	1311896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_015580	TGGA	2	8	1312034	1312041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_015580	CAGA	2	8	1312104	1312111	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_015580	CGG	2	6	1312112	1312117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_015580	CGT	2	6	1312129	1312134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_015580	TCA	2	6	1312176	1312181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_015580	AGG	2	6	1312218	1312223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_015580	AGC	2	6	1312234	1312239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_015580	AAAG	2	8	1312248	1312255	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_015580	GCG	2	6	1312289	1312294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_015580	ACCG	2	8	1312394	1312401	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3105	NC_015580	TG	3	6	1312580	1312585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_015580	GT	3	6	1312595	1312600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_015580	GGT	2	6	1312685	1312690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_015580	GA	3	6	1312715	1312720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_015580	GAA	2	6	1312762	1312767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_015580	G	6	6	1312797	1312802	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_015580	GAC	2	6	1312864	1312869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_015580	AGG	2	6	1312909	1312914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015580	CGG	2	6	1312946	1312951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_015580	ATT	2	6	1313148	1313153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_015580	ACC	2	6	1313217	1313222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_015580	T	6	6	1313229	1313234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015580	CCT	2	6	1313304	1313309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_015580	GC	3	6	1313324	1313329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_015580	GCCT	2	8	1313382	1313389	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_015580	GGT	2	6	1313441	1313446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_015580	TGA	2	6	1313502	1313507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015580	TCA	2	6	1313556	1313561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_015580	GAG	2	6	1313684	1313689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_015580	GCA	2	6	1313755	1313760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_015580	CCTC	2	8	1313811	1313818	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3126	NC_015580	TAA	2	6	1313905	1313910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015580	TGA	2	6	1313924	1313929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_015580	CCA	2	6	1313933	1313938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_015580	GCA	2	6	1313962	1313967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_015580	TGA	2	6	1313975	1313980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_015580	ATC	2	6	1313988	1313993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_015580	ACCC	2	8	1314071	1314078	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3133	NC_015580	A	6	6	1314180	1314185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_015580	AAC	2	6	1314203	1314208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_015580	CCGAA	2	10	1314274	1314283	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3136	NC_015580	CGG	2	6	1314340	1314345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3141	NC_015580	GCT	2	6	1314965	1314970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3146	NC_015580	AGC	2	6	1315132	1315137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3151	NC_015580	TCG	2	6	1315284	1315289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3153	NC_015580	GTG	2	6	1315363	1315368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_015580	CCG	2	6	1315377	1315382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3155	NC_015580	CGG	2	6	1315390	1315395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3162	NC_015580	GGC	2	6	1315826	1315831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3164	NC_015580	CCGGG	2	10	1315862	1315871	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3165	NC_015580	TCG	2	6	1315908	1315913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3168	NC_015580	GCG	2	6	1316602	1316607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3171	NC_015580	GCTC	2	8	1316688	1316695	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3172	NC_015580	CGA	2	6	1316732	1316737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3174	NC_015580	ACC	2	6	1316837	1316842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3242	NC_015580	CG	4	8	1344490	1344497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3243	NC_015580	CTC	2	6	1344506	1344511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3244	NC_015580	TGG	2	6	1344598	1344603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_015580	GCA	3	9	1344610	1344618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3246	NC_015580	AGTTT	2	10	1350181	1350190	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_015580	GAT	2	6	1350196	1350201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_015580	TGGT	2	8	1350202	1350209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_015580	T	6	6	1350977	1350982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3250	NC_015580	CGGT	2	8	1351006	1351013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3251	NC_015580	ATTA	2	8	1351016	1351023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_015580	CGGT	2	8	1351033	1351040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3253	NC_015580	AACC	2	8	1351072	1351079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3254	NC_015580	GA	3	6	1351091	1351096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_015580	CA	4	8	1353470	1353477	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3256	NC_015580	GAA	2	6	1355861	1355866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_015580	TCTCT	2	10	1360873	1360882	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3258	NC_015580	AATC	2	8	1362083	1362090	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3259	NC_015580	CCG	2	6	1365203	1365208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3261	NC_015580	AGA	2	6	1365270	1365275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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