MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 9484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015580	TGC	2	6	414951	414956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_015580	ACG	2	6	414985	414990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_015580	CGAAC	2	10	414996	415005	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1004	NC_015580	GC	3	6	415006	415011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_015580	GCCGC	2	10	415025	415034	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1006	NC_015580	GCC	2	6	415075	415080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_015580	GC	3	6	415085	415090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_015580	CGC	2	6	415127	415132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_015580	GCCGAT	3	18	415162	415179	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_015580	CGAT	2	8	415202	415209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_015580	CGG	2	6	415227	415232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_015580	GGCA	2	8	415272	415279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_015580	CAT	2	6	415293	415298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_015580	CGC	2	6	415312	415317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_015580	CTCG	2	8	415334	415341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1016	NC_015580	GCC	2	6	415375	415380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_015580	CGGCCT	3	18	415388	415405	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_015580	CTG	2	6	415406	415411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_015580	GGT	2	6	415456	415461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015580	CGG	2	6	415463	415468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_015580	CTG	2	6	415481	415486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_015580	GAG	2	6	415564	415569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015580	CGC	2	6	415570	415575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_015580	GCG	2	6	415597	415602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_015580	CCG	2	6	415603	415608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_015580	CG	4	8	415651	415658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_015580	TCCAGC	2	12	415661	415672	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_015580	GCC	2	6	415786	415791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_015580	GGC	2	6	415801	415806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_015580	GAC	2	6	415811	415816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_015580	T	6	6	415843	415848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015580	GC	3	6	415861	415866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_015580	GCC	3	9	415880	415888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_015580	ATT	3	9	415949	415957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015580	ATT	2	6	415978	415983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015580	GAAC	2	8	416009	416016	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_015580	TCCCG	2	10	416045	416054	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1038	NC_015580	CGT	2	6	416059	416064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_015580	GCC	2	6	416138	416143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_015580	TCCG	2	8	416147	416154	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_015580	TCG	3	9	416166	416174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_015580	AGG	2	6	416208	416213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015580	CGGCG	2	10	417056	417065	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1044	NC_015580	ATC	2	6	417161	417166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_015580	GTG	2	6	417257	417262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015580	GCCG	2	8	417346	417353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_015580	ATTCG	2	10	417929	417938	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1048	NC_015580	CGG	2	6	417972	417977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_015580	TCT	2	6	418378	418383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_015580	GGC	2	6	418414	418419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_015580	GCC	2	6	418429	418434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_015580	GC	3	6	418445	418450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_015580	CG	3	6	418477	418482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_015580	C	6	6	420041	420046	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1055	NC_015580	GCC	2	6	420103	420108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_015580	GGC	2	6	420714	420719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_015580	CGC	2	6	420734	420739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_015580	GGC	2	6	421099	421104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_015580	TGC	2	6	421108	421113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015580	CTTCG	2	10	421123	421132	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1061	NC_015580	CTCG	2	8	421234	421241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_015580	GCC	2	6	421309	421314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_015580	GCG	2	6	421319	421324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_015580	AGC	2	6	421325	421330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015580	GGGCAA	2	12	421338	421349	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1066	NC_015580	GTT	2	6	421468	421473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015580	CGC	2	6	421475	421480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_015580	CGC	2	6	421492	421497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_015580	CCG	2	6	422899	422904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_015580	T	6	6	422943	422948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015580	CCG	2	6	422992	422997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_015580	CCAT	2	8	423361	423368	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_015580	CGAA	2	8	425062	425069	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_015580	GAG	2	6	425080	425085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015580	TCC	2	6	425089	425094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_015580	GGC	2	6	425118	425123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_015580	CGGG	2	8	425158	425165	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_015580	GGC	2	6	425206	425211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_015580	ACT	2	6	425233	425238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_015580	GCA	2	6	425240	425245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_015580	TGGC	2	8	425266	425273	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_015580	CGC	2	6	425278	425283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_015580	CCG	2	6	425387	425392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_015580	GGC	2	6	425409	425414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_015580	CG	3	6	426427	426432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_015580	AAAGG	2	10	426466	426475	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015580	CCG	2	6	426477	426482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_015580	AGG	2	6	426935	426940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015580	CGGGC	2	10	426981	426990	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1090	NC_015580	TCG	2	6	427015	427020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_015580	CCTG	2	8	427022	427029	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_015580	CCGC	2	8	429907	429914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1093	NC_015580	TGC	2	6	429946	429951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_015580	GAT	2	6	429973	429978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015580	TCG	2	6	429999	430004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_015580	AGC	2	6	430023	430028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_015580	TGC	2	6	431114	431119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_015580	GCGA	2	8	431156	431163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_015580	CG	3	6	431165	431170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_015580	CTGGC	2	10	431204	431213	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1101	NC_015580	TTCCT	2	10	433601	433610	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1102	NC_015580	CG	3	6	433632	433637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_015580	GGT	2	6	433704	433709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015580	CG	4	8	433726	433733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_015580	A	7	7	433785	433791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015580	ACCG	2	8	433804	433811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_015580	A	6	6	433909	433914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015580	GGA	2	6	433948	433953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015580	TGC	2	6	434043	434048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_015580	CTG	2	6	434062	434067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_015580	AGG	2	6	434199	434204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015580	A	6	6	436183	436188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015580	GAG	2	6	436238	436243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015580	GCGGGT	2	12	439975	439986	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1115	NC_015580	C	6	6	440005	440010	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1116	NC_015580	CCGGA	2	10	440014	440023	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1117	NC_015580	AGCC	2	8	443001	443008	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_015580	GC	3	6	443031	443036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_015580	CTG	2	6	443788	443793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_015580	CTG	2	6	443800	443805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_015580	TTA	2	6	443834	443839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015580	TTAGGC	2	12	444049	444060	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1123	NC_015580	CG	3	6	446014	446019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_015580	CGGT	2	8	446021	446028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_015580	CG	4	8	447299	447306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_015580	GCT	2	6	447338	447343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_015580	CGT	2	6	447379	447384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_015580	CG	3	6	447446	447451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_015580	CG	3	6	450072	450077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_015580	TCG	2	6	450128	450133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_015580	T	6	6	450159	450164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015580	GGCG	3	12	450217	450228	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_015580	TCGG	2	8	450361	450368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_015580	AGA	2	6	450406	450411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015580	GC	3	6	450422	450427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_015580	TTC	2	6	453461	453466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1138	NC_015580	TGC	2	6	453540	453545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1143	NC_015580	CGA	2	6	454731	454736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1174	NC_015580	CGG	3	9	472143	472151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1175	NC_015580	GC	3	6	472215	472220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1268	NC_015580	GGC	2	6	518265	518270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1270	NC_015580	GGCT	2	8	518284	518291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1271	NC_015580	GCGCG	2	10	518292	518301	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1273	NC_015580	GCTG	2	8	518325	518332	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1404	NC_015580	CGCTG	2	10	595746	595755	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1405	NC_015580	GAT	2	6	595801	595806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1407	NC_015580	GCC	3	9	595896	595904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1408	NC_015580	GTGCC	2	10	595917	595926	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1409	NC_015580	AGC	2	6	595940	595945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1410	NC_015580	AGC	2	6	595966	595971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1411	NC_015580	G	7	7	596015	596021	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_015580	CAG	2	6	596040	596045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1413	NC_015580	GATC	2	8	596066	596073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1414	NC_015580	CG	3	6	596074	596079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1415	NC_015580	CGG	2	6	596104	596109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1416	NC_015580	GCA	2	6	596150	596155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_015580	CGA	2	6	596162	596167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1418	NC_015580	CGA	2	6	596228	596233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1420	NC_015580	GAG	2	6	596262	596267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_015580	CAGG	2	8	596298	596305	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1422	NC_015580	GTC	2	6	596349	596354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1423	NC_015580	GCT	2	6	596360	596365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1424	NC_015580	CAG	2	6	596433	596438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1425	NC_015580	T	6	6	597699	597704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_015580	TC	4	8	597807	597814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1427	NC_015580	CGT	2	6	598109	598114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1428	NC_015580	CCGCT	2	10	598138	598147	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1429	NC_015580	CGG	2	6	598221	598226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1430	NC_015580	GCCTTG	2	12	598232	598243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1433	NC_015580	CGC	2	6	599851	599856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1434	NC_015580	CGG	2	6	599857	599862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1435	NC_015580	TC	3	6	601521	601526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1436	NC_015580	GGC	2	6	602049	602054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1438	NC_015580	CGG	2	6	602116	602121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1440	NC_015580	GC	3	6	606297	606302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1442	NC_015580	GAG	2	6	608189	608194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_015580	GC	3	6	608224	608229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1444	NC_015580	GGC	2	6	608236	608241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1446	NC_015580	CG	3	6	608257	608262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1447	NC_015580	CGTCCC	2	12	608308	608319	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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1451	NC_015580	CG	3	6	609756	609761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1452	NC_015580	GCGG	2	8	609806	609813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1453	NC_015580	CCG	2	6	610873	610878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1458	NC_015580	GCC	3	9	617369	617377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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