MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y chromosome

Total Repeats: 9484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015580	TCG	2	6	224407	224412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015580	GC	3	6	225579	225584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_015580	C	6	6	225876	225881	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
504	NC_015580	A	7	7	225882	225888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015580	GCG	2	6	226017	226022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_015580	C	6	6	226041	226046	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
507	NC_015580	T	6	6	227824	227829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015580	GGCG	2	8	230571	230578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
509	NC_015580	ATG	2	6	230596	230601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015580	CCCT	2	8	230664	230671	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
511	NC_015580	G	6	6	230704	230709	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015580	GCG	2	6	230730	230735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015580	GCGG	2	8	232683	232690	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
514	NC_015580	CGG	2	6	233276	233281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_015580	ATG	2	6	233556	233561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015580	GC	3	6	233574	233579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_015580	GGA	2	6	233594	233599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015580	GCA	2	6	233622	233627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015580	GC	3	6	233633	233638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_015580	AGC	2	6	233718	233723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015580	CGC	2	6	233750	233755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_015580	GGT	2	6	235488	235493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015580	CAG	2	6	236746	236751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015580	CGC	2	6	236754	236759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_015580	AGACC	2	10	236760	236769	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
526	NC_015580	CGA	2	6	236772	236777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_015580	CAA	2	6	236791	236796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_015580	TGGC	2	8	236871	236878	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
529	NC_015580	ACA	2	6	236944	236949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015580	GCG	2	6	238346	238351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015580	GAC	2	6	238423	238428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_015580	GAC	2	6	238432	238437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015580	CG	4	8	238478	238485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_015580	A	6	6	238486	238491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015580	CAC	2	6	238492	238497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_015580	GCG	2	6	238498	238503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_015580	C	6	6	238507	238512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
538	NC_015580	GGA	2	6	238541	238546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015580	C	6	6	238550	238555	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
540	NC_015580	GA	3	6	240321	240326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015580	CAT	2	6	240334	240339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_015580	CGCGG	2	10	240421	240430	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
543	NC_015580	GCC	2	6	241476	241481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_015580	GAA	2	6	241889	241894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015580	TG	3	6	242055	242060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015580	CAT	2	6	242072	242077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015580	TGC	2	6	242123	242128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_015580	CGA	2	6	244030	244035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_015580	GCT	2	6	244056	244061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015580	C	6	6	244091	244096	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
551	NC_015580	GCAG	3	12	244117	244128	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
552	NC_015580	CG	3	6	244160	244165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_015580	GAGT	2	8	244409	244416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015580	TGCG	2	8	244462	244469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
555	NC_015580	ACG	2	6	244471	244476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_015580	AGTTC	2	10	244480	244489	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
557	NC_015580	CG	3	6	244544	244549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_015580	CGGT	2	8	244584	244591	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
559	NC_015580	CGG	2	6	244612	244617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015580	GGA	2	6	244725	244730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015580	TTCC	2	8	245199	245206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_015580	CG	3	6	245216	245221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
563	NC_015580	TTG	2	6	245242	245247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015580	TCTG	2	8	245340	245347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_015580	GCC	2	6	245393	245398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_015580	CT	3	6	248839	248844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_015580	TC	3	6	248876	248881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_015580	GC	3	6	250495	250500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_015580	CGGGTT	2	12	250506	250517	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
570	NC_015580	GGGC	2	8	250552	250559	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
571	NC_015580	GC	3	6	250566	250571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
572	NC_015580	AGC	2	6	250603	250608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015580	GAT	2	6	250638	250643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015580	CGAGG	2	10	250644	250653	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
575	NC_015580	CGA	2	6	250703	250708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_015580	GA	3	6	250707	250712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015580	CCG	2	6	250714	250719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_015580	CAG	2	6	250725	250730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_015580	TCG	2	6	250733	250738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_015580	AGA	2	6	250769	250774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015580	GAT	2	6	250791	250796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015580	TGA	2	6	250805	250810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015580	GAT	2	6	250818	250823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015580	CCT	2	6	250844	250849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_015580	AAGAC	2	10	250890	250899	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
586	NC_015580	GGCA	2	8	250936	250943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
587	NC_015580	TCG	2	6	250980	250985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_015580	TCG	2	6	251001	251006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015580	GCG	2	6	251096	251101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_015580	C	6	6	251144	251149	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
591	NC_015580	GCG	2	6	251193	251198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_015580	CCA	2	6	251245	251250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_015580	GCT	2	6	251405	251410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_015580	G	6	6	253489	253494	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015580	AG	3	6	253579	253584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015580	CCGC	2	8	254312	254319	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
597	NC_015580	AGC	2	6	254376	254381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_015580	GAG	2	6	255192	255197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015580	AAT	2	6	255226	255231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015580	GCG	2	6	255239	255244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_015580	GCG	2	6	255260	255265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_015580	CG	4	8	255272	255279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
603	NC_015580	GTCGC	2	10	255305	255314	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
604	NC_015580	GCC	2	6	255517	255522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_015580	CCGG	2	8	255526	255533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
606	NC_015580	GAGT	2	8	255569	255576	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015580	CGC	2	6	256649	256654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_015580	GGC	2	6	256663	256668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_015580	CG	4	8	256709	256716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_015580	TGC	2	6	256758	256763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_015580	CG	3	6	256802	256807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
612	NC_015580	GGA	2	6	256933	256938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015580	GCC	2	6	256975	256980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_015580	GCG	2	6	257005	257010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_015580	CAT	2	6	257069	257074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_015580	CAT	2	6	257082	257087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_015580	ACG	2	6	257097	257102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_015580	TTC	2	6	257110	257115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_015580	TCC	2	6	257502	257507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_015580	GGCC	2	8	257513	257520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_015580	TGC	2	6	257525	257530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_015580	CACG	2	8	257573	257580	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
623	NC_015580	GAAAGT	2	12	257585	257596	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015580	GGC	2	6	257607	257612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_015580	AGG	2	6	258911	258916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015580	A	6	6	258919	258924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015580	GGC	2	6	258953	258958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015580	TGC	3	9	260678	260686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_015580	GCC	2	6	260706	260711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_015580	GCG	2	6	260738	260743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_015580	CCG	2	6	260780	260785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_015580	CCG	2	6	260804	260809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_015580	GCC	2	6	260815	260820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_015580	TCG	2	6	261194	261199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_015580	AGA	2	6	261276	261281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015580	GCT	2	6	262507	262512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_015580	GCC	3	9	263846	263854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_015580	GC	3	6	263857	263862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
639	NC_015580	A	6	6	265507	265512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_015580	GC	3	6	265556	265561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
641	NC_015580	TC	3	6	265688	265693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
642	NC_015580	CGT	2	6	265802	265807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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644	NC_015580	GCT	2	6	265918	265923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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647	NC_015580	CGG	2	6	266065	266070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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651	NC_015580	CTCG	2	8	266142	266149	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
652	NC_015580	TCC	2	6	266182	266187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
653	NC_015580	TCAA	2	8	266189	266196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
654	NC_015580	CGCGTG	2	12	266215	266226	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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662	NC_015580	CCG	2	6	267302	267307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
663	NC_015580	GCG	2	6	267369	267374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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669	NC_015580	TC	3	6	268646	268651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
670	NC_015580	A	7	7	268682	268688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
671	NC_015580	GCC	2	6	268715	268720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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678	NC_015580	TC	3	6	269665	269670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
679	NC_015580	TCGG	2	8	269727	269734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
680	NC_015580	CGC	2	6	269783	269788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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686	NC_015580	TGCG	2	8	272770	272777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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765	NC_015580	GCC	3	9	335053	335061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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767	NC_015580	CAA	2	6	336119	336124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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