MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Lpl

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015579	GC	3	6	3000	3005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015579	GC	3	6	4297	4302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015579	CG	3	6	5874	5879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015579	GC	3	6	9794	9799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015579	CG	3	6	10337	10342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015579	GC	3	6	15132	15137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015579	GC	4	8	15333	15340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015579	CG	3	6	15357	15362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015579	CG	3	6	15500	15505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015579	CT	3	6	15510	15515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015579	GC	3	6	25642	25647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015579	TC	3	6	27432	27437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015579	GC	3	6	27477	27482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015579	GC	4	8	34755	34762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015579	GC	4	8	34767	34774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015579	GC	3	6	45047	45052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015579	GC	3	6	45197	45202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015579	TG	3	6	53045	53050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015579	GA	3	6	53137	53142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015579	GC	3	6	53714	53719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015579	GC	3	6	53793	53798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015579	CG	3	6	67169	67174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015579	CG	3	6	69903	69908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015579	TG	3	6	77215	77220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015579	GC	3	6	77228	77233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015579	GC	3	6	82914	82919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015579	GA	3	6	86276	86281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015579	GC	3	6	86291	86296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015579	CG	3	6	87722	87727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015579	GC	3	6	90268	90273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015579	CG	3	6	92939	92944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015579	CG	3	6	92955	92960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015579	GC	3	6	92967	92972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015579	CG	3	6	94278	94283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015579	CG	3	6	96693	96698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015579	GC	3	6	96810	96815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015579	TC	3	6	99057	99062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015579	CG	3	6	105023	105028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015579	GC	3	6	105591	105596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015579	GC	3	6	105847	105852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015579	CG	3	6	106049	106054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015579	CG	4	8	106488	106495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015579	GC	3	6	106576	106581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015579	GC	3	6	106845	106850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015579	GC	3	6	110197	110202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015579	GC	3	6	110363	110368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015579	CG	4	8	110501	110508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015579	GC	3	6	110568	110573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015579	GC	3	6	110757	110762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015579	CG	3	6	112262	112267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015579	GC	3	6	114842	114847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015579	AT	3	6	118000	118005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015579	GA	3	6	118047	118052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015579	AC	3	6	118993	118998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015579	AG	3	6	119158	119163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015579	GC	3	6	120850	120855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015579	TG	3	6	122023	122028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015579	GC	3	6	126199	126204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015579	CT	3	6	127736	127741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015579	AT	3	6	128671	128676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015579	TA	3	6	129092	129097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015579	AT	3	6	134549	134554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015579	GC	3	6	137755	137760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015579	CG	3	6	144298	144303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015579	CG	3	6	144572	144577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015579	CG	3	6	144744	144749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015579	GC	3	6	144828	144833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015579	GC	4	8	148805	148812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015579	CG	3	6	148828	148833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015579	GC	3	6	157047	157052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015579	GC	3	6	157457	157462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015579	CG	3	6	161074	161079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015579	GC	3	6	161184	161189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015579	CG	3	6	161314	161319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015579	GC	3	6	161401	161406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015579	GC	3	6	162118	162123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015579	GC	3	6	162438	162443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015579	GT	3	6	163294	163299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015579	CG	3	6	172767	172772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015579	GA	3	6	172875	172880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015579	GC	3	6	178895	178900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015579	TC	3	6	179061	179066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015579	CT	3	6	179225	179230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015579	CG	3	6	179284	179289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_015579	AT	4	8	180101	180108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015579	GA	3	6	184668	184673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015579	GA	3	6	184718	184723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015579	GC	3	6	185300	185305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015579	GC	3	6	186544	186549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.