MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Novosphingobium sp. PP1Y plasmid Lpl

Total Repeats: 418

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015579	GCT	2	6	3052	3057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015579	CGG	2	6	3073	3078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015579	GCC	2	6	4258	4263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015579	GCG	2	6	4280	4285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015579	CGC	2	6	4342	4347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015579	TCA	2	6	5423	5428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015579	GAA	2	6	5484	5489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015579	GAC	2	6	5535	5540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015579	GCG	2	6	5852	5857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015579	GAT	2	6	6469	6474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015579	ATC	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015579	TCG	2	6	6563	6568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015579	TGT	2	6	7786	7791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015579	CCT	2	6	7866	7871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015579	TCA	2	6	8698	8703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015579	CTG	2	6	8730	8735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015579	GCC	2	6	9636	9641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015579	AGC	2	6	9661	9666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015579	GGC	2	6	9726	9731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015579	CGG	2	6	9814	9819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015579	CGT	2	6	10103	10108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015579	TCG	2	6	10155	10160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015579	TCC	2	6	10352	10357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015579	GCA	2	6	10375	10380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015579	GGT	3	9	10634	10642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015579	ATC	2	6	11154	11159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015579	GTC	2	6	11183	11188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015579	GGA	2	6	11307	11312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015579	TGA	2	6	11407	11412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015579	TTC	2	6	11432	11437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015579	GCG	2	6	11535	11540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015579	GAT	2	6	12056	12061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015579	CTC	2	6	12516	12521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015579	CGC	2	6	15020	15025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015579	GCC	2	6	15202	15207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015579	CAG	2	6	15221	15226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015579	GCG	2	6	15235	15240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015579	GCC	2	6	15303	15308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015579	GCA	2	6	15415	15420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015579	TCA	2	6	15429	15434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015579	CGA	2	6	15532	15537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015579	CGT	2	6	15948	15953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015579	GGC	2	6	16685	16690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015579	TTG	2	6	16850	16855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015579	ATG	2	6	24639	24644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015579	CTC	2	6	24645	24650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015579	TGT	2	6	25607	25612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015579	CAT	2	6	25691	25696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015579	CGG	2	6	25757	25762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015579	TGC	2	6	27473	27478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015579	ATT	2	6	32262	32267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015579	GTC	2	6	34788	34793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015579	AGC	2	6	34806	34811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015579	CTT	2	6	35170	35175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015579	GCG	2	6	39831	39836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015579	CCA	2	6	39964	39969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015579	GAT	2	6	44804	44809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015579	CAA	2	6	44836	44841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015579	AGC	2	6	44847	44852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015579	AGG	2	6	44993	44998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015579	TCG	2	6	45007	45012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015579	GCG	2	6	45107	45112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015579	CGG	2	6	45143	45148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015579	CGG	2	6	45317	45322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015579	AGA	2	6	45362	45367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015579	TCC	2	6	45423	45428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015579	TCG	2	6	45487	45492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015579	CGG	2	6	45539	45544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015579	GCG	2	6	45577	45582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015579	GAC	2	6	46406	46411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015579	TGC	2	6	46450	46455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015579	GCA	2	6	46459	46464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015579	GGC	3	9	47305	47313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015579	TGC	2	6	50365	50370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015579	CAA	2	6	50410	50415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015579	CCG	2	6	50559	50564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015579	TTC	2	6	50570	50575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015579	GTC	2	6	50664	50669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015579	CGA	2	6	50946	50951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015579	CGG	2	6	52092	52097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015579	GCC	3	9	52103	52111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015579	TAA	2	6	53055	53060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015579	GAA	2	6	53103	53108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015579	ATG	2	6	53638	53643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015579	GGC	2	6	53710	53715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015579	CGG	2	6	53844	53849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015579	TCG	2	6	53853	53858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015579	ATT	2	6	54560	54565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015579	GTA	2	6	54628	54633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015579	GAC	2	6	60257	60262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015579	CTG	2	6	60271	60276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015579	CTG	3	9	64218	64226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015579	ACG	2	6	64348	64353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015579	ATG	2	6	64444	64449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015579	CAC	2	6	67065	67070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015579	CAT	2	6	67122	67127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015579	ATC	2	6	67213	67218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015579	GCT	2	6	72487	72492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015579	CAT	2	6	72676	72681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015579	GCC	2	6	73020	73025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_015579	TGC	2	6	73056	73061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015579	CAC	2	6	77026	77031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015579	GCT	2	6	77032	77037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015579	AGG	2	6	77307	77312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015579	GAC	3	9	77321	77329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015579	GGC	2	6	77349	77354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015579	GTC	2	6	77355	77360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015579	CCG	2	6	77393	77398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015579	CCG	2	6	79669	79674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015579	CGG	2	6	79688	79693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015579	CGC	2	6	79765	79770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_015579	CGC	2	6	79804	79809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_015579	GAG	2	6	79831	79836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015579	ACA	2	6	79876	79881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015579	GCT	2	6	79914	79919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015579	CGC	2	6	79935	79940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_015579	GTC	2	6	79954	79959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015579	ACG	2	6	80052	80057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015579	ATA	2	6	80066	80071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015579	GTC	2	6	80077	80082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015579	TCA	2	6	80083	80088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015579	TCC	2	6	80275	80280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_015579	ACT	2	6	80290	80295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015579	ATC	2	6	81510	81515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015579	CGA	2	6	81635	81640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015579	TGA	2	6	81871	81876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015579	CAC	2	6	82093	82098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015579	CGC	2	6	82099	82104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015579	GCC	2	6	82113	82118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015579	ACC	2	6	82121	82126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015579	CTG	2	6	82182	82187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015579	TCT	2	6	82231	82236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015579	TCG	2	6	82243	82248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015579	TAT	2	6	82320	82325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015579	AGC	3	9	82576	82584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015579	CGG	2	6	82602	82607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015579	TTC	2	6	82635	82640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015579	CGA	2	6	82684	82689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015579	TCA	2	6	82720	82725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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405	NC_015579	CGA	2	6	180304	180309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
406	NC_015579	TTG	2	6	180377	180382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
407	NC_015579	GAC	2	6	183844	183849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_015579	CGG	2	6	184185	184190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
409	NC_015579	GAC	2	6	184199	184204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
410	NC_015579	ATC	2	6	184214	184219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_015579	AAG	2	6	184319	184324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
412	NC_015579	TCG	2	6	184413	184418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
413	NC_015579	GTC	2	6	184582	184587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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415	NC_015579	AGG	2	6	184679	184684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
416	NC_015579	CGC	2	6	186387	186392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
417	NC_015579	TGC	2	6	186400	186405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
418	NC_015579	CGC	2	6	186528	186533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.