MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21201

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015223	TAT	2	6	26	31	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015223	TAA	2	6	59	64	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015223	AAT	2	6	5788	5793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015223	TTA	2	6	6350	6355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015223	AAG	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015223	ATC	2	6	8827	8832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015223	ACA	2	6	8833	8838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015223	AAT	2	6	8839	8844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015223	TAA	2	6	8875	8880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015223	TTC	2	6	9162	9167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015223	TAA	2	6	9188	9193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015223	GCT	2	6	9195	9200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015223	TTA	2	6	9296	9301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015223	ACT	2	6	9471	9476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015223	AAT	2	6	9673	9678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015223	AAC	2	6	11504	11509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015223	ATT	3	9	11521	11529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015223	TAT	2	6	11583	11588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015223	TAT	2	6	12461	12466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015223	TTC	2	6	12497	12502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015223	TAT	2	6	12642	12647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015223	TAA	2	6	12696	12701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015223	CTT	2	6	12705	12710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015223	TGA	2	6	12727	12732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015223	TTA	2	6	12805	12810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015223	TGA	2	6	13537	13542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015223	CCA	2	6	13637	13642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015223	ATT	2	6	13719	13724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015223	TCT	2	6	13781	13786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015223	TAC	2	6	13809	13814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015223	ATC	3	9	13944	13952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015223	CAC	2	6	14202	14207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_015223	TTA	2	6	14377	14382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015223	AAG	2	6	14501	14506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015223	CAG	2	6	14616	14621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015223	ACG	2	6	14697	14702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015223	TGG	2	6	14741	14746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015223	TCC	2	6	21002	21007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015223	ATT	2	6	21541	21546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015223	ACA	2	6	21577	21582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015223	ATC	2	6	21660	21665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015223	GAA	2	6	21746	21751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015223	TGT	2	6	21752	21757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015223	TTA	2	6	21944	21949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015223	ATA	2	6	22851	22856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015223	GTA	2	6	22864	22869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015223	CTT	2	6	23400	23405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015223	TCC	2	6	24045	24050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015223	ACC	2	6	27150	27155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015223	TAA	2	6	27163	27168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015223	AGA	2	6	27192	27197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015223	GAA	2	6	27219	27224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015223	ATT	2	6	27243	27248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015223	GTT	2	6	27352	27357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015223	CGT	2	6	27372	27377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015223	ATA	2	6	27436	27441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015223	AGC	2	6	27751	27756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015223	AGA	2	6	27811	27816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015223	TTG	2	6	27828	27833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015223	CCA	2	6	28048	28053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015223	GAA	2	6	28502	28507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015223	GGT	2	6	28683	28688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015223	GCA	2	6	28692	28697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015223	TTA	2	6	28717	28722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015223	ACA	2	6	28757	28762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015223	ATA	2	6	29216	29221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015223	TTA	2	6	29269	29274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015223	ATT	2	6	29326	29331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015223	CTG	2	6	29385	29390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015223	CCT	2	6	38583	38588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015223	GCA	2	6	39984	39989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015223	ATA	3	9	40019	40027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015223	GAA	2	6	40757	40762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015223	TAA	2	6	40835	40840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015223	ATT	2	6	42452	42457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015223	GGA	2	6	42464	42469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015223	TGC	2	6	42474	42479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015223	TAA	2	6	42621	42626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015223	ATT	2	6	42644	42649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015223	TAC	2	6	44205	44210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015223	ATT	2	6	44238	44243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015223	CTT	2	6	44301	44306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015223	AAG	2	6	44317	44322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015223	TAC	2	6	45631	45636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015223	TTA	2	6	45722	45727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015223	CGA	2	6	47799	47804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015223	ATT	2	6	47854	47859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015223	AGA	2	6	47883	47888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015223	ATC	2	6	47918	47923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015223	TTA	3	9	48000	48008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015223	ATT	2	6	48012	48017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015223	ATA	2	6	48050	48055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015223	ATA	2	6	48151	48156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015223	TAA	2	6	48234	48239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015223	ATC	2	6	48246	48251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015223	CAT	2	6	48605	48610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015223	TTA	2	6	48697	48702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015223	GAT	2	6	48732	48737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015223	TTA	2	6	48758	48763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015223	ACA	2	6	49222	49227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015223	GAT	2	6	49302	49307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015223	AAC	2	6	49392	49397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015223	ATT	2	6	49516	49521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015223	CAA	2	6	49579	49584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015223	TCT	2	6	49641	49646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015223	ATG	2	6	49799	49804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015223	TCA	2	6	49832	49837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015223	TGC	2	6	49944	49949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015223	TCT	2	6	50004	50009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015223	CTG	2	6	50119	50124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015223	CTA	2	6	50146	50151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015223	GTC	2	6	50161	50166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015223	CCT	2	6	50215	50220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015223	AAT	2	6	50484	50489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015223	GCT	2	6	50498	50503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015223	TGC	2	6	50554	50559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015223	TAC	2	6	50623	50628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015223	TAG	2	6	50739	50744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015223	GTT	2	6	50756	50761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015223	TTC	2	6	50888	50893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015223	ATT	2	6	50894	50899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015223	TGG	2	6	50926	50931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015223	AGA	2	6	51009	51014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015223	ACT	3	9	51100	51108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015223	ATG	2	6	51200	51205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015223	CTA	2	6	51304	51309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015223	TTA	2	6	51331	51336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015223	CTA	2	6	51379	51384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015223	GTT	2	6	51441	51446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015223	AAT	2	6	51539	51544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015223	CTA	2	6	51642	51647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015223	ATT	2	6	54480	54485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015223	ATA	2	6	54526	54531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015223	AAT	2	6	54670	54675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015223	ATT	2	6	55050	55055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015223	GCT	2	6	62241	62246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015223	GCA	2	6	63068	63073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015223	GCA	2	6	63088	63093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015223	CAC	2	6	63420	63425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_015223	TAC	2	6	65015	65020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015223	TAA	2	6	65042	65047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015223	ATT	2	6	65051	65056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015223	ATT	2	6	65779	65784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015223	AAT	2	6	65892	65897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015223	TAC	2	6	70657	70662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015223	TTC	2	6	70740	70745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015223	TGA	2	6	70777	70782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015223	TTA	2	6	70817	70822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015223	CTG	2	6	70848	70853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_015223	TAG	2	6	71159	71164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015223	AAG	2	6	71168	71173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015223	AGA	2	6	71874	71879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_015223	TAT	2	6	72078	72083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015223	ATT	2	6	72263	72268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015223	TAC	2	6	72414	72419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_015223	CAC	2	6	81676	81681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_015223	TGA	2	6	81705	81710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015223	GAA	2	6	82197	82202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_015223	TTA	2	6	83118	83123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015223	TCT	2	6	84882	84887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_015223	CAA	2	6	84893	84898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_015223	GAA	2	6	84993	84998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_015223	TCC	2	6	87404	87409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_015223	AAT	2	6	87905	87910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015223	TAA	2	6	87983	87988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_015223	CTT	2	6	90944	90949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.