MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 1758

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015222	CAAT	2	8	11874	11881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015222	GTCA	2	8	12536	12543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015222	TGGT	2	8	17944	17951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015222	ATCA	2	8	18922	18929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015222	TGAT	2	8	18940	18947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015222	ATCA	2	8	22935	22942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015222	TGAA	2	8	23961	23968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015222	ATTT	2	8	26287	26294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015222	TGAT	2	8	31095	31102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015222	ATAA	2	8	32218	32225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015222	TAAA	2	8	34685	34692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015222	ATTA	2	8	42550	42557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015222	GTTC	2	8	43597	43604	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015222	AATA	2	8	53105	53112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015222	CTTG	2	8	53427	53434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015222	AATG	2	8	55545	55552	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015222	TCAG	2	8	65297	65304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015222	ATAA	2	8	65384	65391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015222	ATTG	2	8	65709	65716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015222	TTTA	2	8	65748	65755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015222	ATTT	2	8	73921	73928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015222	TCAA	2	8	76434	76441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015222	AATG	2	8	77335	77342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015222	CTAT	2	8	78111	78118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015222	TTAT	2	8	78120	78127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015222	CTTG	2	8	78206	78213	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015222	GAAT	2	8	96136	96143	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015222	TCAT	2	8	96151	96158	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015222	TCCT	2	8	97967	97974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015222	TGAT	2	8	98101	98108	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015222	TGGT	2	8	98229	98236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015222	TAAA	2	8	99672	99679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015222	GCTC	2	8	100099	100106	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015222	ATTT	2	8	100261	100268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015222	AAAT	2	8	105116	105123	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015222	GGAA	2	8	105233	105240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015222	ATTT	2	8	105245	105252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015222	TCTT	2	8	105435	105442	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015222	TAAT	2	8	105494	105501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015222	TGGT	2	8	115021	115028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015222	ATTT	2	8	121105	121112	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015222	ATCC	2	8	121502	121509	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015222	AATA	2	8	122839	122846	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015222	TCAA	2	8	122885	122892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015222	AAGA	2	8	122995	123002	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015222	CTTG	2	8	125503	125510	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015222	CAAT	2	8	125520	125527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015222	GATG	2	8	125751	125758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015222	TTGC	2	8	125787	125794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015222	TGAT	2	8	127922	127929	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015222	AGAA	2	8	131306	131313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015222	AGTA	2	8	131320	131327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015222	TTCA	2	8	134371	134378	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015222	GAAT	2	8	136626	136633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015222	GCAT	2	8	136663	136670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015222	AAAG	2	8	149478	149485	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015222	TTGT	2	8	150303	150310	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015222	TTGA	2	8	155380	155387	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015222	CTGA	2	8	155411	155418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015222	ATTG	2	8	161697	161704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015222	AAGG	2	8	162643	162650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015222	GGTT	2	8	163919	163926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015222	AAGG	2	8	164704	164711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015222	AAAT	2	8	164862	164869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015222	AGTT	2	8	166127	166134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015222	TTCT	2	8	170938	170945	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015222	TAAT	2	8	174809	174816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015222	TGAA	2	8	175118	175125	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015222	CCAG	2	8	175132	175139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015222	AGGA	2	8	182168	182175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015222	GGCT	2	8	183699	183706	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015222	TCAT	2	8	183894	183901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015222	ACAA	2	8	186565	186572	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015222	TTAA	2	8	189184	189191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015222	ATTT	2	8	189533	189540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015222	GTCT	2	8	189827	189834	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015222	ACAA	2	8	190433	190440	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015222	TTTA	2	8	190655	190662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015222	ATTT	2	8	193119	193126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015222	CTTT	2	8	195415	195422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015222	TAAT	2	8	195535	195542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015222	TTCA	2	8	202621	202628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015222	ACCA	2	8	206987	206994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015222	TGGC	2	8	207851	207858	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015222	TTGG	2	8	207960	207967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015222	AATA	2	8	211866	211873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015222	CCAA	3	12	213611	213622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015222	ATTT	2	8	213762	213769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015222	ATGA	2	8	214024	214031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015222	AAGA	2	8	217385	217392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015222	CAGA	2	8	217532	217539	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015222	CAGC	2	8	218316	218323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015222	CGAA	2	8	224825	224832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015222	AGAA	2	8	225368	225375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015222	ATTT	2	8	225756	225763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015222	ACCA	2	8	231149	231156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015222	TAGA	2	8	233936	233943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015222	TCAT	2	8	234031	234038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015222	CAAG	2	8	234591	234598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015222	GGCT	2	8	237004	237011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015222	AATT	2	8	239095	239102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015222	CATT	2	8	241476	241483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015222	TGCT	2	8	249933	249940	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015222	TTGC	2	8	250083	250090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015222	ATTT	2	8	255203	255210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015222	TAAA	2	8	257436	257443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015222	GTTG	2	8	259721	259728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015222	TCCA	2	8	261773	261780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015222	CATT	2	8	262073	262080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015222	AAGC	2	8	262382	262389	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015222	GTGC	2	8	265585	265592	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015222	ATTT	2	8	265597	265604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015222	TAAA	2	8	268981	268988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015222	TTTC	2	8	273200	273207	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015222	TCAT	2	8	273884	273891	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015222	GGAT	2	8	282338	282345	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015222	CTCC	2	8	282358	282365	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_015222	TATT	2	8	292464	292471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015222	AGGT	2	8	296576	296583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015222	CAAG	2	8	296726	296733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015222	AAAC	2	8	296751	296758	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015222	TGAA	2	8	297428	297435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015222	CCGG	2	8	298350	298357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015222	TATT	2	8	302211	302218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015222	GAAT	2	8	303618	303625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015222	GGCT	2	8	308229	308236	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015222	AAAT	2	8	309170	309177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015222	ATTT	2	8	313314	313321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015222	ATTT	2	8	321303	321310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015222	TTTC	2	8	323492	323499	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015222	TTTA	2	8	324836	324843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015222	TGCT	2	8	329565	329572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015222	AGCG	2	8	332363	332370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015222	AGAA	2	8	339723	339730	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015222	TCGA	2	8	341553	341560	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015222	TATT	2	8	346928	346935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015222	CGGA	2	8	347036	347043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015222	TAGA	2	8	348871	348878	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015222	ACCG	2	8	355312	355319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015222	TTAA	2	8	355393	355400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015222	TTTG	2	8	363957	363964	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015222	TGCC	2	8	370985	370992	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015222	TGGT	2	8	378728	378735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015222	CAGT	2	8	380250	380257	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015222	AGAA	2	8	381010	381017	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015222	ACTT	2	8	381035	381042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015222	TAAT	2	8	389380	389387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015222	TGAC	2	8	391066	391073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015222	CTGT	2	8	391119	391126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015222	TTCA	2	8	398234	398241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015222	TATT	2	8	398254	398261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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