MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 10611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015222	TCTTG	2	10	987712	987721	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3002	NC_015222	CAT	2	6	987751	987756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_015222	GC	3	6	987816	987821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_015222	ACA	2	6	987822	987827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_015222	T	7	7	988512	988518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_015222	TAC	2	6	988535	988540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_015222	CTA	2	6	988593	988598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_015222	CAA	2	6	988602	988607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_015222	TAAT	2	8	988630	988637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_015222	AAT	2	6	988678	988683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_015222	AT	3	6	988693	988698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015222	TTTAT	2	10	988707	988716	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_015222	AAT	2	6	988719	988724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_015222	TAT	2	6	988771	988776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_015222	CCT	2	6	989995	990000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3016	NC_015222	TA	3	6	990057	990062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_015222	AATT	2	8	993687	993694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015222	ATT	2	6	994139	994144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015222	ATC	2	6	994157	994162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_015222	GTAT	2	8	994183	994190	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_015222	AT	3	6	994189	994194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_015222	A	7	7	994214	994220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015222	TA	3	6	994243	994248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_015222	GATATA	2	12	994260	994271	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015222	TA	4	8	994278	994285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_015222	GCGG	2	8	995588	995595	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_015222	TA	3	6	995616	995621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_015222	ATT	2	6	997108	997113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_015222	ATA	2	6	997160	997165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_015222	TAT	2	6	997170	997175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_015222	TATG	2	8	997184	997191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_015222	AGAT	2	8	997215	997222	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_015222	A	7	7	997224	997230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_015222	TCC	2	6	998559	998564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_015222	GATC	2	8	998566	998573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3036	NC_015222	TGA	2	6	998586	998591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_015222	ATT	2	6	998649	998654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_015222	GTGA	2	8	998663	998670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_015222	A	6	6	999871	999876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_015222	ATG	2	6	999943	999948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015222	CCT	2	6	999950	999955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3042	NC_015222	AAGCA	2	10	1000007	1000016	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3043	NC_015222	T	7	7	1000021	1000027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_015222	ATA	2	6	1000054	1000059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015222	A	6	6	1000122	1000127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_015222	TAT	2	6	1001405	1001410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_015222	CAG	2	6	1002024	1002029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_015222	TTA	2	6	1003133	1003138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_015222	GCG	2	6	1003149	1003154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_015222	TAA	2	6	1003162	1003167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_015222	CA	3	6	1003196	1003201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_015222	AGC	2	6	1005743	1005748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_015222	AAAT	2	8	1006516	1006523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_015222	TCA	2	6	1006735	1006740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_015222	TCGTC	2	10	1006805	1006814	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3056	NC_015222	AAT	2	6	1006831	1006836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_015222	ATG	2	6	1007744	1007749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015222	GC	3	6	1009057	1009062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_015222	CTG	2	6	1009159	1009164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_015222	AAT	2	6	1010280	1010285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_015222	ATT	2	6	1011279	1011284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_015222	ATTA	2	8	1011307	1011314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_015222	CGG	2	6	1011727	1011732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_015222	ATAG	2	8	1017861	1017868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_015222	A	6	6	1017925	1017930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_015222	T	6	6	1017952	1017957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_015222	ATTT	2	8	1017962	1017969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_015222	T	6	6	1018069	1018074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_015222	GCT	2	6	1018077	1018082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_015222	AGC	2	6	1018113	1018118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_015222	A	6	6	1018164	1018169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_015222	AT	3	6	1018232	1018237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_015222	TGA	2	6	1019248	1019253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_015222	GAT	2	6	1019260	1019265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_015222	TGG	2	6	1019852	1019857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_015222	ACA	2	6	1019887	1019892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_015222	AAT	2	6	1019898	1019903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_015222	T	8	8	1019911	1019918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_015222	ATT	2	6	1020625	1020630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_015222	TTCAT	2	10	1020635	1020644	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3081	NC_015222	CT	3	6	1025795	1025800	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3082	NC_015222	TAA	2	6	1025807	1025812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_015222	AGT	2	6	1025820	1025825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_015222	ATGGC	2	10	1026966	1026975	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3085	NC_015222	ATT	2	6	1026988	1026993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015222	ACT	2	6	1027779	1027784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_015222	TGT	2	6	1027813	1027818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_015222	AAT	2	6	1027819	1027824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_015222	TAA	2	6	1027827	1027832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_015222	TGA	2	6	1027856	1027861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_015222	ATCG	2	8	1027915	1027922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3092	NC_015222	TGT	2	6	1027954	1027959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_015222	T	7	7	1028017	1028023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_015222	CTT	2	6	1028060	1028065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_015222	AGTA	2	8	1029917	1029924	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_015222	ATA	3	9	1031491	1031499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_015222	TAA	2	6	1031506	1031511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_015222	ATT	3	9	1031526	1031534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_015222	TCT	2	6	1031621	1031626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_015222	T	6	6	1032912	1032917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_015222	T	6	6	1032944	1032949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_015222	CTT	2	6	1032967	1032972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_015222	TGG	2	6	1035364	1035369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_015222	ATT	2	6	1035371	1035376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_015222	ATTA	2	8	1036122	1036129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_015222	TTA	2	6	1036137	1036142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_015222	AAT	2	6	1036241	1036246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_015222	GATA	2	8	1036254	1036261	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_015222	TTC	2	6	1036298	1036303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_015222	T	6	6	1036339	1036344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_015222	AAT	2	6	1036354	1036359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_015222	AAT	2	6	1036393	1036398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015222	AAT	2	6	1036409	1036414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_015222	TCATT	2	10	1036428	1036437	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3115	NC_015222	TTG	2	6	1036461	1036466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_015222	T	6	6	1036469	1036474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015222	TG	4	8	1036561	1036568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_015222	T	6	6	1038046	1038051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_015222	ACA	2	6	1038983	1038988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_015222	GTT	2	6	1038992	1038997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_015222	TCG	2	6	1039001	1039006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_015222	T	6	6	1039055	1039060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_015222	TTG	2	6	1039948	1039953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_015222	TA	3	6	1039972	1039977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_015222	TGC	2	6	1039987	1039992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_015222	T	6	6	1040000	1040005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015222	TTTA	2	8	1040580	1040587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_015222	TAA	2	6	1042062	1042067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_015222	TA	3	6	1042078	1042083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015222	ATT	2	6	1042093	1042098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_015222	T	6	6	1042097	1042102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_015222	A	6	6	1043276	1043281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_015222	GATT	3	12	1043323	1043334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_015222	TAAT	2	8	1043381	1043388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_015222	GTT	2	6	1043394	1043399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_015222	TTAT	2	8	1044223	1044230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3253	NC_015222	AAGC	2	8	1104359	1104366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3254	NC_015222	TGC	2	6	1104395	1104400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3263	NC_015222	AAG	2	6	1112912	1112917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3272	NC_015222	TAAT	2	8	1113474	1113481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3402	NC_015222	TAA	2	6	1153962	1153967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3424	NC_015222	T	6	6	1159780	1159785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3425	NC_015222	T	7	7	1159829	1159835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3438	NC_015222	CTT	2	6	1167614	1167619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3500	NC_015222	ATTT	2	8	1184440	1184447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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