MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 10611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015222	TGT	2	6	611074	611079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015222	GGA	2	6	611115	611120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015222	AAT	2	6	612513	612518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_015222	ATT	2	6	612574	612579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015222	TC	3	6	613866	613871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_015222	TCAA	2	8	613898	613905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_015222	TCC	2	6	613986	613991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_015222	ATGA	2	8	613999	614006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015222	TG	3	6	614018	614023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015222	GAA	2	6	616558	616563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015222	ATA	2	6	616566	616571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_015222	ATA	2	6	616660	616665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015222	ATA	2	6	616672	616677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015222	TA	3	6	616704	616709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015222	TTA	2	6	619953	619958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_015222	ACC	2	6	620487	620492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_015222	ATCC	2	8	620521	620528	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_015222	TGCAAC	2	12	621480	621491	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_015222	AACA	2	8	621496	621503	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_015222	ACC	2	6	621517	621522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_015222	T	7	7	621562	621568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015222	CTTT	2	8	621621	621628	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_015222	T	6	6	621631	621636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_015222	ATCT	2	8	621665	621672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_015222	TTG	2	6	621770	621775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_015222	A	6	6	622052	622057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015222	ATC	2	6	622104	622109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_015222	ATG	2	6	622139	622144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_015222	CATTT	2	10	622147	622156	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1530	NC_015222	ACGTA	2	10	623080	623089	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1531	NC_015222	TCT	2	6	623131	623136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_015222	ATATGA	2	12	623325	623336	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_015222	AAT	2	6	623380	623385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015222	GGT	2	6	623392	623397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_015222	GT	3	6	628160	628165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_015222	ATG	2	6	628198	628203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_015222	T	8	8	628218	628225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015222	TTG	2	6	628228	628233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015222	AAT	2	6	628237	628242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_015222	TGT	2	6	628274	628279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_015222	T	6	6	628282	628287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_015222	GC	3	6	628338	628343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_015222	ATC	2	6	628352	628357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_015222	TCA	2	6	628407	628412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_015222	TGAT	2	8	629722	629729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_015222	TAC	2	6	632864	632869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_015222	ATTCT	2	10	633939	633948	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1548	NC_015222	CTT	2	6	633964	633969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_015222	TGT	2	6	635679	635684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015222	TTG	2	6	635710	635715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_015222	TTA	2	6	635755	635760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_015222	TA	3	6	635759	635764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_015222	TAT	2	6	636104	636109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_015222	TG	3	6	636721	636726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_015222	ATA	2	6	637122	637127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_015222	GCA	2	6	637176	637181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_015222	T	6	6	637193	637198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015222	ATTA	2	8	639283	639290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015222	ACA	2	6	639320	639325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_015222	GAA	2	6	639336	639341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_015222	ATA	2	6	639389	639394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_015222	TTG	2	6	639404	639409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_015222	TAA	2	6	639424	639429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_015222	TAA	2	6	639469	639474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_015222	AT	3	6	640788	640793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_015222	TAGA	2	8	641549	641556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_015222	TTA	2	6	645378	645383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_015222	GAA	2	6	645393	645398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_015222	TGAA	2	8	647544	647551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_015222	TTAA	2	8	647558	647565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_015222	CGT	2	6	647577	647582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_015222	T	7	7	647618	647624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015222	CGTT	2	8	647641	647648	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_015222	AT	3	6	647667	647672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_015222	T	7	7	647729	647735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_015222	ATA	2	6	648579	648584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_015222	TAA	2	6	648609	648614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_015222	AT	3	6	648637	648642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_015222	T	7	7	648685	648691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_015222	TAA	2	6	648698	648703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_015222	AGTT	2	8	648708	648715	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015222	GCA	2	6	648756	648761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_015222	GAT	2	6	650074	650079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_015222	ATA	2	6	650082	650087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015222	GATA	2	8	650089	650096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_015222	CTG	2	6	651134	651139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_015222	TTC	2	6	651975	651980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_015222	ATA	2	6	653102	653107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_015222	TGA	2	6	653113	653118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_015222	TTC	2	6	653121	653126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_015222	AT	3	6	653138	653143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_015222	ATA	2	6	653173	653178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_015222	T	6	6	653229	653234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_015222	ATT	2	6	653262	653267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015222	TTGAT	2	10	656504	656513	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_015222	TTTA	2	8	656536	656543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_015222	ATT	2	6	658337	658342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_015222	T	6	6	658356	658361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_015222	GT	3	6	658362	658367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_015222	T	6	6	658367	658372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_015222	GT	4	8	658387	658394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_015222	ATTT	2	8	658395	658402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_015222	ATT	2	6	658417	658422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_015222	AAGG	2	8	658439	658446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015222	AGT	2	6	658465	658470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_015222	T	6	6	659657	659662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_015222	T	7	7	659684	659690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015222	A	7	7	659693	659699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_015222	TAT	2	6	659721	659726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_015222	CTG	2	6	659750	659755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_015222	AGCA	2	8	659759	659766	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1612	NC_015222	TAA	2	6	659768	659773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_015222	AGC	2	6	659781	659786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_015222	A	6	6	659794	659799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_015222	TAA	2	6	659824	659829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_015222	AAAAT	2	10	659852	659861	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_015222	ATA	2	6	659877	659882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_015222	GGC	2	6	659983	659988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_015222	GCA	2	6	660014	660019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_015222	ATA	2	6	660120	660125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_015222	GAA	2	6	660132	660137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_015222	AGT	2	6	660226	660231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_015222	GAC	2	6	660243	660248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_015222	GCA	2	6	660292	660297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_015222	GTGA	2	8	660345	660352	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_015222	GAA	2	6	660388	660393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_015222	A	6	6	660392	660397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_015222	AGA	2	6	660434	660439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_015222	CAG	2	6	660460	660465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_015222	GGT	2	6	660525	660530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_015222	G	6	6	660607	660612	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_015222	GAA	2	6	660652	660657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_015222	GTT	2	6	660770	660775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_015222	TTA	2	6	660781	660786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_015222	TACC	2	8	660922	660929	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1636	NC_015222	A	6	6	660943	660948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_015222	TGC	2	6	660991	660996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1909	NC_015222	ATC	2	6	718116	718121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1910	NC_015222	TTA	2	6	718136	718141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1911	NC_015222	AC	3	6	718224	718229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1912	NC_015222	TGCT	2	8	718232	718239	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1913	NC_015222	GCA	2	6	718245	718250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1914	NC_015222	CAG	2	6	718274	718279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1915	NC_015222	CAT	2	6	718292	718297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1916	NC_015222	TCC	2	6	718319	718324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1917	NC_015222	CTC	2	6	718373	718378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1918	NC_015222	ATCT	2	8	718394	718401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1919	NC_015222	TCA	2	6	718402	718407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1920	NC_015222	CT	3	6	718478	718483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1921	NC_015222	GTATG	2	10	718546	718555	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1922	NC_015222	TC	4	8	718576	718583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1923	NC_015222	A	8	8	718590	718597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1924	NC_015222	TCG	2	6	718606	718611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1930	NC_015222	TAA	2	6	718758	718763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1931	NC_015222	TGT	2	6	718881	718886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1932	NC_015222	TGT	2	6	718888	718893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_015222	ATG	2	6	719017	719022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1953	NC_015222	AAG	2	6	723355	723360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1954	NC_015222	TA	3	6	723394	723399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1957	NC_015222	AGA	2	6	723492	723497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1958	NC_015222	TCT	2	6	723506	723511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1959	NC_015222	TATATT	2	12	723528	723539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1973	NC_015222	T	6	6	723942	723947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1974	NC_015222	GTGATT	2	12	724125	724136	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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