MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 10611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015222	CTA	2	6	407018	407023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_015222	ACA	2	6	407026	407031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_015222	AAT	2	6	407091	407096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015222	CAA	2	6	407145	407150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015222	TCA	2	6	407197	407202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_015222	TC	3	6	407226	407231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_015222	GCTCA	2	10	407237	407246	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1008	NC_015222	ATT	2	6	407301	407306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015222	TTC	2	6	407315	407320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_015222	ATT	2	6	407365	407370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015222	ATA	2	6	407388	407393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015222	TA	3	6	407419	407424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015222	AGT	2	6	407431	407436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015222	TGAG	2	8	407448	407455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015222	ATTA	2	8	407592	407599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015222	ATA	2	6	407642	407647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015222	AACAA	2	10	407696	407705	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1018	NC_015222	GA	3	6	411144	411149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015222	AT	3	6	412061	412066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015222	AATT	2	8	412120	412127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015222	ACA	2	6	413511	413516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_015222	AATA	2	8	413530	413537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015222	AAG	3	9	414457	414465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015222	ATA	2	6	416553	416558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015222	AAT	2	6	416580	416585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015222	T	6	6	417124	417129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015222	TAT	2	6	417164	417169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015222	TTC	2	6	418172	418177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_015222	ATTT	2	8	418932	418939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015222	ATCA	2	8	419301	419308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_015222	AGG	2	6	419309	419314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015222	AGA	2	6	424020	424025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015222	AAAG	2	8	424116	424123	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015222	AT	4	8	432485	432492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015222	A	6	6	433187	433192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015222	T	6	6	433270	433275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015222	TGT	2	6	433332	433337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_015222	TGC	2	6	433684	433689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_015222	AGC	2	6	433705	433710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_015222	ATTA	2	8	436050	436057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015222	TCG	2	6	436095	436100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_015222	TTA	2	6	436124	436129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015222	CAAA	2	8	436152	436159	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_015222	GA	3	6	436268	436273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_015222	CGG	2	6	436359	436364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015222	GAATT	2	10	436417	436426	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015222	T	6	6	436453	436458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015222	ATTG	2	8	436477	436484	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015222	ACA	2	6	436528	436533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_015222	TG	3	6	436960	436965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015222	GATA	2	8	438318	438325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015222	ATA	2	6	438347	438352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015222	T	6	6	439866	439871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015222	TGT	2	6	441191	441196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015222	TAA	2	6	441197	441202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015222	A	6	6	441221	441226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015222	T	6	6	441243	441248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015222	AAC	2	6	442017	442022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_015222	AAC	2	6	442026	442031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_015222	ATTTT	2	10	442062	442071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015222	TTG	2	6	442711	442716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015222	TTA	2	6	442721	442726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015222	ATC	2	6	442759	442764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_015222	TTCTCA	2	12	443586	443597	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015222	CAA	2	6	444969	444974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_015222	GAA	2	6	444983	444988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015222	TCT	2	6	445014	445019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_015222	AATC	2	8	445041	445048	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_015222	AG	3	6	445111	445116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015222	TGA	2	6	446072	446077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015222	AC	3	6	446136	446141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_015222	T	6	6	446142	446147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015222	TTGC	2	8	446173	446180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_015222	GGC	2	6	446275	446280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_015222	AAT	2	6	446315	446320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015222	TAC	2	6	447552	447557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_015222	GCC	2	6	447605	447610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_015222	TCT	2	6	447648	447653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_015222	CTTCG	2	10	447713	447722	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1080	NC_015222	GGTC	2	8	447850	447857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_015222	CAT	2	6	447886	447891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_015222	ATA	2	6	448461	448466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015222	GGCT	2	8	450950	450957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_015222	TAA	3	9	450962	450970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015222	TGA	2	6	450972	450977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015222	TTA	2	6	450989	450994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015222	GTT	2	6	451014	451019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015222	T	7	7	451018	451024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015222	TCT	2	6	451038	451043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_015222	AGTT	2	8	451057	451064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015222	T	6	6	451147	451152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015222	TTA	2	6	451174	451179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015222	TTTTAT	2	12	451187	451198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015222	A	6	6	451274	451279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015222	AT	3	6	451310	451315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015222	TATC	2	8	451316	451323	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_015222	GCTT	2	8	454666	454673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_015222	ATA	2	6	454683	454688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015222	ATAA	2	8	454735	454742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015222	TA	3	6	454802	454807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015222	TTTTC	2	10	454818	454827	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1102	NC_015222	GGAT	2	8	454835	454842	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015222	CT	3	6	454860	454865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_015222	CAGA	2	8	454872	454879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_015222	TAGC	2	8	454910	454917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_015222	ATT	2	6	458329	458334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015222	A	7	7	458373	458379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015222	ATT	2	6	458450	458455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015222	TTA	2	6	458486	458491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015222	TGG	2	6	458538	458543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015222	ATTT	2	8	460083	460090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015222	CG	3	6	461619	461624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_015222	AGA	2	6	464382	464387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015222	GCG	2	6	464442	464447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_015222	AGG	2	6	467374	467379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015222	GC	3	6	467391	467396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_015222	TCA	2	6	467483	467488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015222	GCCA	2	8	467577	467584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_015222	AAC	2	6	467605	467610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_015222	TGT	2	6	468623	468628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015222	TCC	2	6	468702	468707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_015222	GAT	2	6	468713	468718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015222	CGA	2	6	468812	468817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_015222	GCT	2	6	468998	469003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_015222	GTA	2	6	469014	469019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015222	TTG	2	6	470051	470056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015222	CTT	2	6	470117	470122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_015222	TGA	2	6	470131	470136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015222	TCC	2	6	470447	470452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_015222	TGCAA	2	10	470571	470580	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1131	NC_015222	TAG	2	6	470594	470599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015222	ATT	2	6	471529	471534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_015222	CTTT	2	8	472266	472273	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_015222	CTT	2	6	472287	472292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_015222	AAT	2	6	472293	472298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015222	ATC	2	6	472397	472402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_015222	TCC	3	9	472753	472761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1138	NC_015222	TAA	2	6	472833	472838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_015222	GAA	2	6	472915	472920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1141	NC_015222	TTG	2	6	472942	472947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1171	NC_015222	TTA	2	6	484965	484970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1174	NC_015222	TTG	2	6	485964	485969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1177	NC_015222	CCT	2	6	486089	486094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1252	NC_015222	TA	3	6	519134	519139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1254	NC_015222	ATA	2	6	519185	519190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1260	NC_015222	GTTG	2	8	519347	519354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1261	NC_015222	TCGAT	2	10	519393	519402	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1263	NC_015222	TGG	3	9	519427	519435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1265	NC_015222	CTGT	2	8	522808	522815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1266	NC_015222	CAT	2	6	522845	522850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1267	NC_015222	GAAAA	2	10	522864	522873	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_015222	ATC	2	6	522877	522882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1269	NC_015222	ATAC	2	8	522921	522928	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1270	NC_015222	GGC	2	6	522941	522946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1271	NC_015222	TGC	2	6	522964	522969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1272	NC_015222	TTTCCA	2	12	523037	523048	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1414	NC_015222	AT	3	6	578181	578186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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