MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 10611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015222	CAG	2	6	213749	213754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015222	ATTT	2	8	213762	213769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015222	A	6	6	213780	213785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015222	TTC	2	6	213793	213798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015222	AC	3	6	213819	213824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_015222	GT	3	6	213954	213959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015222	GA	3	6	213968	213973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015222	AT	3	6	213974	213979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015222	TCG	2	6	213994	213999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_015222	ATGA	2	8	214024	214031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015222	AAT	3	9	214123	214131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015222	ATC	2	6	214140	214145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015222	CTA	2	6	214229	214234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_015222	ATT	2	6	214237	214242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_015222	A	6	6	214271	214276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015222	TATCT	2	10	214277	214286	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
517	NC_015222	CTT	2	6	214361	214366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_015222	CTG	2	6	214396	214401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_015222	ATA	2	6	214468	214473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015222	TCA	2	6	214492	214497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015222	A	6	6	214506	214511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015222	GAT	2	6	214669	214674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015222	TA	3	6	217339	217344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015222	AAGA	2	8	217385	217392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015222	A	6	6	217510	217515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015222	ATC	2	6	217526	217531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_015222	CAGA	2	8	217532	217539	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
528	NC_015222	AG	3	6	217765	217770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015222	AAT	2	6	217783	217788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015222	AGCGT	2	10	218067	218076	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
531	NC_015222	TTG	2	6	218131	218136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015222	ATA	2	6	218142	218147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015222	TAA	2	6	218176	218181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015222	AAT	2	6	218256	218261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015222	AAG	2	6	218271	218276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015222	ACT	2	6	218293	218298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_015222	CAGC	2	8	218316	218323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
538	NC_015222	TAA	2	6	218342	218347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015222	TGC	2	6	218351	218356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_015222	TTAAA	2	10	218367	218376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015222	A	6	6	218374	218379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015222	TGT	2	6	218408	218413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015222	GTT	2	6	218442	218447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015222	A	6	6	218464	218469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015222	T	7	7	218476	218482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015222	T	6	6	218485	218490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015222	G	7	7	218492	218498	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015222	GTT	2	6	219619	219624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015222	T	6	6	219662	219667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015222	TTG	2	6	220637	220642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015222	T	6	6	220692	220697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015222	AAG	2	6	224794	224799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015222	AGA	2	6	224805	224810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015222	CGAA	2	8	224825	224832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
555	NC_015222	TAA	2	6	225271	225276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015222	GAA	2	6	225347	225352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015222	AGAA	2	8	225368	225375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015222	ATT	2	6	225411	225416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015222	ATTT	2	8	225756	225763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015222	ATA	2	6	225773	225778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015222	TTC	2	6	225835	225840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_015222	TTG	2	6	229328	229333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015222	TTA	2	6	229336	229341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015222	AATCA	2	10	229354	229363	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
565	NC_015222	CAC	2	6	229540	229545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_015222	TAC	2	6	231135	231140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_015222	ACCA	2	8	231149	231156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_015222	TAA	2	6	231162	231167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015222	ATT	2	6	231171	231176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015222	GTT	2	6	233744	233749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015222	TGT	2	6	233805	233810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015222	A	6	6	233915	233920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015222	TAGA	2	8	233936	233943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015222	TCAT	2	8	234031	234038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
575	NC_015222	A	6	6	234044	234049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015222	AGC	2	6	234068	234073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015222	AAG	2	6	234119	234124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015222	ATT	2	6	234132	234137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015222	TGA	2	6	234219	234224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015222	TGA	2	6	234281	234286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015222	CGAGG	2	10	234376	234385	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
582	NC_015222	TCG	2	6	234528	234533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_015222	TCA	2	6	234542	234547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_015222	TCA	2	6	234552	234557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_015222	CAAG	2	8	234591	234598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_015222	TTG	2	6	236662	236667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015222	TTG	2	6	236771	236776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015222	TCG	2	6	236851	236856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015222	ATG	2	6	236994	236999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015222	GGCT	2	8	237004	237011	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
591	NC_015222	GCA	2	6	237049	237054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_015222	TCT	2	6	237059	237064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015222	TAT	2	6	237105	237110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015222	GT	3	6	238358	238363	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015222	AATT	2	8	239095	239102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015222	GA	3	6	239170	239175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015222	T	6	6	239207	239212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015222	ACA	2	6	239251	239256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_015222	GT	3	6	239466	239471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015222	A	7	7	241191	241197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_015222	T	6	6	241230	241235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015222	TAT	2	6	241341	241346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015222	CAA	2	6	241394	241399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015222	AT	3	6	241411	241416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015222	TTA	2	6	241421	241426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015222	CATT	2	8	241476	241483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
607	NC_015222	TGC	2	6	241485	241490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_015222	AAG	2	6	241975	241980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015222	TA	3	6	242012	242017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015222	A	6	6	242020	242025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015222	ACT	2	6	242039	242044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_015222	TTC	2	6	242065	242070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015222	ATT	2	6	242082	242087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015222	CAA	2	6	242406	242411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_015222	AAT	2	6	242446	242451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015222	TA	3	6	242485	242490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015222	CCG	2	6	243735	243740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_015222	ACT	2	6	244337	244342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_015222	GTTCTT	2	12	244385	244396	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
620	NC_015222	GAA	2	6	244803	244808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015222	TTAAT	2	10	245137	245146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015222	GAG	2	6	245158	245163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015222	ACA	2	6	245214	245219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_015222	TAT	2	6	245242	245247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015222	TGT	2	6	245305	245310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015222	TTG	2	6	245318	245323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015222	TGT	2	6	245900	245905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015222	AAT	2	6	248783	248788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015222	GAT	2	6	248847	248852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015222	GCT	2	6	249738	249743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_015222	T	6	6	249791	249796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015222	T	6	6	249798	249803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015222	ACC	2	6	249804	249809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_015222	TAA	2	6	249811	249816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015222	TTA	2	6	249828	249833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015222	ATA	2	6	249874	249879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015222	AAT	2	6	249896	249901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015222	TGCT	2	8	249933	249940	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
639	NC_015222	TTGC	2	8	250083	250090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
640	NC_015222	AGT	2	6	250096	250101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_015222	T	6	6	250117	250122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_015222	CTA	2	6	252379	252384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_015222	TGC	2	6	252402	252407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_015222	TAT	2	6	253730	253735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_015222	CCT	2	6	254672	254677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
646	NC_015222	ATT	2	6	255040	255045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
647	NC_015222	T	6	6	255083	255088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
648	NC_015222	ATTT	2	8	255203	255210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_015222	TAAA	2	8	257436	257443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_015222	TGA	2	6	257489	257494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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652	NC_015222	AT	3	6	257528	257533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_015222	ACAAT	2	10	259703	259712	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
654	NC_015222	GTTG	2	8	259721	259728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
655	NC_015222	TGA	2	6	261636	261641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
656	NC_015222	A	6	6	261652	261657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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658	NC_015222	AGA	2	6	261760	261765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
659	NC_015222	TCCA	2	8	261773	261780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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661	NC_015222	GT	3	6	261941	261946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
662	NC_015222	TTG	2	6	261952	261957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
663	NC_015222	TTG	2	6	262017	262022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
664	NC_015222	CATT	2	8	262073	262080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
665	NC_015222	CG	3	6	262122	262127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
666	NC_015222	TCT	2	6	262212	262217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
667	NC_015222	TG	3	6	262276	262281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
668	NC_015222	AAG	2	6	262294	262299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
669	NC_015222	GTG	2	6	262320	262325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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671	NC_015222	AGG	2	6	262411	262416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
672	NC_015222	T	6	6	262517	262522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
673	NC_015222	AT	3	6	262523	262528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
674	NC_015222	ATC	2	6	262636	262641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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676	NC_015222	GAA	2	6	263599	263604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
677	NC_015222	AAGTA	2	10	263610	263619	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
678	NC_015222	CTT	2	6	263657	263662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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681	NC_015222	GCAAA	2	10	263700	263709	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
682	NC_015222	A	7	7	263707	263713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
683	NC_015222	T	6	6	263814	263819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
684	NC_015222	CAA	2	6	263831	263836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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688	NC_015222	ATT	2	6	265566	265571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
689	NC_015222	GTGC	2	8	265585	265592	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
690	NC_015222	ATTT	2	8	265597	265604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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696	NC_015222	T	6	6	268994	268999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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714	NC_015222	TTATT	2	10	273923	273932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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762	NC_015222	TTCGT	2	10	296631	296640	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
763	NC_015222	GAT	2	6	296641	296646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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768	NC_015222	TAA	2	6	298171	298176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
769	NC_015222	CAC	2	6	298178	298183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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771	NC_015222	CAG	2	6	298342	298347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
772	NC_015222	CCGG	2	8	298350	298357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
773	NC_015222	TAA	2	6	298390	298395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
774	NC_015222	ATA	2	6	298436	298441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
775	NC_015222	GAT	2	6	301614	301619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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922	NC_015222	GAT	2	6	376681	376686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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946	NC_015222	TTC	2	6	381113	381118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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952	NC_015222	T	7	7	389286	389292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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