MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 10611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015222	AAG	2	6	1839019	1839024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_015222	AAT	2	6	1839028	1839033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_015222	GAA	2	6	1839302	1839307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_015222	CG	3	6	1839322	1839327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_015222	AAT	2	6	1839344	1839349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_015222	ACA	2	6	1839353	1839358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_015222	ATA	2	6	1839359	1839364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_015222	AAT	2	6	1839367	1839372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_015222	ATT	2	6	1839402	1839407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_015222	T	7	7	1839406	1839412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_015222	TCA	2	6	1839505	1839510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_015222	ATAA	2	8	1839532	1839539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_015222	ATA	2	6	1840976	1840981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_015222	TA	3	6	1840980	1840985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_015222	A	6	6	1841001	1841006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_015222	TG	3	6	1841299	1841304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_015222	TAA	2	6	1841312	1841317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_015222	AGT	2	6	1841338	1841343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_015222	CCAA	3	12	1842774	1842785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6020	NC_015222	T	6	6	1842848	1842853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_015222	ATA	2	6	1842912	1842917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_015222	T	6	6	1842982	1842987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_015222	A	6	6	1842998	1843003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_015222	GAA	2	6	1843024	1843029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_015222	AAC	2	6	1843031	1843036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_015222	TTA	2	6	1843047	1843052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_015222	A	6	6	1843065	1843070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_015222	TGTAG	2	10	1844213	1844222	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_015222	AGT	2	6	1844291	1844296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_015222	TA	3	6	1844436	1844441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_015222	CAG	2	6	1844449	1844454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_015222	AAG	2	6	1844488	1844493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_015222	T	6	6	1844511	1844516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_015222	CAT	2	6	1844591	1844596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_015222	TTAGCT	2	12	1844624	1844635	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6036	NC_015222	CA	3	6	1844648	1844653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_015222	CGT	2	6	1845103	1845108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_015222	GTT	2	6	1845169	1845174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_015222	TTC	2	6	1845228	1845233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_015222	AAT	2	6	1845249	1845254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_015222	ATCCCT	2	12	1845293	1845304	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_015222	CAGG	2	8	1845381	1845388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6043	NC_015222	GCC	2	6	1845505	1845510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_015222	GTT	2	6	1845521	1845526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_015222	CAGCG	2	10	1845572	1845581	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6046	NC_015222	GCT	2	6	1845593	1845598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_015222	CAG	2	6	1845659	1845664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_015222	CTG	2	6	1845669	1845674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_015222	GCC	2	6	1845764	1845769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_015222	CGTTC	2	10	1845853	1845862	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6051	NC_015222	TCAC	2	8	1845870	1845877	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_015222	ATG	2	6	1845957	1845962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_015222	TCAT	2	8	1845981	1845988	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6054	NC_015222	ATCC	2	8	1846000	1846007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_015222	CAG	2	6	1846184	1846189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_015222	CTG	2	6	1846213	1846218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_015222	GTTT	2	8	1846366	1846373	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_015222	GC	3	6	1846491	1846496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6059	NC_015222	A	6	6	1846516	1846521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_015222	CTTC	2	8	1846911	1846918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_015222	TAT	2	6	1846925	1846930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_015222	GCT	2	6	1847272	1847277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_015222	AGTTA	2	10	1847286	1847295	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_015222	TA	4	8	1847299	1847306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_015222	CTAAT	2	10	1847354	1847363	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6066	NC_015222	CGCC	2	8	1847390	1847397	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6067	NC_015222	GAA	2	6	1847427	1847432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_015222	A	7	7	1848095	1848101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_015222	TTG	3	9	1848116	1848124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015222	AAG	2	6	1848183	1848188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_015222	AT	3	6	1848219	1848224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_015222	A	6	6	1848231	1848236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_015222	ATC	2	6	1848248	1848253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_015222	AATTT	2	10	1848260	1848269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_015222	TTAA	2	8	1848279	1848286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_015222	GATA	2	8	1848304	1848311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_015222	TGCTT	2	10	1848351	1848360	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6078	NC_015222	TTG	2	6	1848364	1848369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_015222	TCG	2	6	1848383	1848388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_015222	T	7	7	1848431	1848437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_015222	GCA	2	6	1848530	1848535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_015222	TGCTG	2	10	1848541	1848550	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6083	NC_015222	GCC	2	6	1848569	1848574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_015222	GCC	2	6	1848683	1848688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_015222	TAT	2	6	1848729	1848734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_015222	CCAA	2	8	1848819	1848826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6087	NC_015222	ACA	2	6	1848853	1848858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_015222	CAGC	2	8	1848867	1848874	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_015222	GTT	2	6	1848968	1848973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_015222	GTTG	2	8	1848984	1848991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_015222	AAT	2	6	1849184	1849189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_015222	TAG	2	6	1849213	1849218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_015222	AACC	2	8	1849253	1849260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_015222	TCT	2	6	1849268	1849273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_015222	TGA	2	6	1849283	1849288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_015222	TCC	2	6	1849599	1849604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6097	NC_015222	ATA	2	6	1849676	1849681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_015222	TTAT	2	8	1849682	1849689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_015222	AAAT	2	8	1849733	1849740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_015222	AAT	2	6	1849751	1849756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_015222	TATT	2	8	1849760	1849767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_015222	AAT	2	6	1849773	1849778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_015222	CAG	2	6	1851318	1851323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_015222	ACT	2	6	1851394	1851399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_015222	ATT	2	6	1851425	1851430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_015222	A	6	6	1851461	1851466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_015222	CAT	2	6	1851473	1851478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_015222	AATTTC	2	12	1851493	1851504	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6109	NC_015222	TTC	2	6	1851623	1851628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_015222	AT	3	6	1851644	1851649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_015222	CAA	2	6	1851672	1851677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_015222	AACTT	2	10	1851753	1851762	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6113	NC_015222	TGA	2	6	1851781	1851786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_015222	CTGC	2	8	1851804	1851811	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_015222	GCT	2	6	1851846	1851851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_015222	AAC	2	6	1851921	1851926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_015222	CAC	2	6	1852020	1852025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6118	NC_015222	AGC	2	6	1852027	1852032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_015222	CTA	2	6	1852060	1852065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_015222	TCT	2	6	1852111	1852116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_015222	GTT	2	6	1852202	1852207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_015222	ATT	2	6	1852208	1852213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_015222	ATT	2	6	1852251	1852256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_015222	T	6	6	1852261	1852266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_015222	TGG	2	6	1852284	1852289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_015222	T	6	6	1852305	1852310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_015222	ATC	2	6	1852331	1852336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_015222	TTC	2	6	1852361	1852366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_015222	T	6	6	1852804	1852809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_015222	ACGAT	2	10	1852851	1852860	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6131	NC_015222	A	7	7	1853761	1853767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_015222	GAA	2	6	1853808	1853813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6135	NC_015222	A	7	7	1853897	1853903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6250	NC_015222	T	7	7	1871218	1871224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6261	NC_015222	T	6	6	1875519	1875524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6264	NC_015222	AAG	2	6	1875657	1875662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6265	NC_015222	AAC	2	6	1875743	1875748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6266	NC_015222	CA	3	6	1875794	1875799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6267	NC_015222	ATT	2	6	1875800	1875805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6268	NC_015222	TCA	2	6	1876816	1876821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6271	NC_015222	A	6	6	1877362	1877367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6272	NC_015222	GATT	2	8	1879593	1879600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6273	NC_015222	A	6	6	1879634	1879639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6274	NC_015222	ATA	2	6	1880243	1880248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6275	NC_015222	TCAA	2	8	1880268	1880275	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6281	NC_015222	CAT	2	6	1881499	1881504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6282	NC_015222	T	7	7	1881530	1881536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6283	NC_015222	CAAT	2	8	1882111	1882118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6288	NC_015222	ATA	2	6	1882255	1882260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6295	NC_015222	A	6	6	1888631	1888636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6299	NC_015222	T	6	6	1890172	1890177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6343	NC_015222	TGAG	2	8	1911209	1911216	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6354	NC_015222	T	6	6	1912330	1912335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6390	NC_015222	TA	3	6	1925511	1925516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6391	NC_015222	ACAGA	2	10	1925517	1925526	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6392	NC_015222	A	6	6	1925526	1925531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6393	NC_015222	TCAC	2	8	1925556	1925563	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6394	NC_015222	CAG	2	6	1925575	1925580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6432	NC_015222	TGACT	2	10	1946997	1947006	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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