MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 10611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015222	CGC	2	6	1447275	1447280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_015222	CAGTTC	2	12	1447316	1447327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_015222	AAC	2	6	1447353	1447358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_015222	TCAC	2	8	1447360	1447367	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_015222	CAG	2	6	1447412	1447417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_015222	TTGA	2	8	1447446	1447453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_015222	CTT	2	6	1447520	1447525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_015222	TCA	2	6	1447543	1447548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_015222	CAT	2	6	1447562	1447567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_015222	CAAA	2	8	1447712	1447719	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_015222	CAT	2	6	1447722	1447727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_015222	TGACT	2	10	1447752	1447761	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4513	NC_015222	TTG	2	6	1447834	1447839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_015222	A	6	6	1447859	1447864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_015222	T	6	6	1448904	1448909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_015222	ATCA	2	8	1448911	1448918	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4517	NC_015222	TGTAC	2	10	1451884	1451893	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4518	NC_015222	TTG	2	6	1451912	1451917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_015222	ATT	2	6	1452896	1452901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_015222	AAT	2	6	1452966	1452971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_015222	CAA	2	6	1452988	1452993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_015222	GA	4	8	1453029	1453036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_015222	TC	3	6	1453110	1453115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_015222	TTG	2	6	1453148	1453153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_015222	TTC	2	6	1453159	1453164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_015222	TAA	2	6	1454408	1454413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_015222	AC	3	6	1454451	1454456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4528	NC_015222	CTT	2	6	1454509	1454514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_015222	TAAA	2	8	1454539	1454546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_015222	TC	3	6	1454579	1454584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_015222	TGA	2	6	1454591	1454596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_015222	CAA	2	6	1455726	1455731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_015222	A	7	7	1455762	1455768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_015222	TGA	2	6	1455805	1455810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_015222	TTAAAA	2	12	1455871	1455882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_015222	AAGA	2	8	1456838	1456845	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_015222	TGT	2	6	1458811	1458816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_015222	CAG	2	6	1458849	1458854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_015222	GAT	2	6	1458866	1458871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_015222	TTTA	2	8	1459747	1459754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_015222	TTA	2	6	1463617	1463622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_015222	TTC	2	6	1463710	1463715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_015222	TCA	2	6	1463723	1463728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_015222	ATT	2	6	1466120	1466125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_015222	TGA	2	6	1466138	1466143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_015222	ATTTTT	2	12	1468217	1468228	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_015222	T	7	7	1468224	1468230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_015222	TATGA	2	10	1468325	1468334	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_015222	ATT	2	6	1468343	1468348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_015222	T	7	7	1468355	1468361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_015222	AT	4	8	1468371	1468378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_015222	TAT	2	6	1468389	1468394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_015222	TTCAG	2	10	1468440	1468449	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4554	NC_015222	A	6	6	1468464	1468469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_015222	AGGG	2	8	1468972	1468979	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_015222	A	6	6	1469022	1469027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_015222	TGT	2	6	1469086	1469091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_015222	A	6	6	1469365	1469370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_015222	AACT	2	8	1469391	1469398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4560	NC_015222	GGT	2	6	1470219	1470224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_015222	CAT	2	6	1470721	1470726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_015222	ATT	2	6	1470730	1470735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_015222	ATAA	2	8	1474304	1474311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_015222	AT	3	6	1475248	1475253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_015222	T	6	6	1475268	1475273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_015222	TCA	2	6	1475310	1475315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_015222	TTG	2	6	1476617	1476622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_015222	ATTT	2	8	1476633	1476640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_015222	AAT	2	6	1476646	1476651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_015222	TTA	2	6	1476701	1476706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_015222	GCT	2	6	1479248	1479253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NC_015222	CAAG	2	8	1479267	1479274	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4573	NC_015222	GTTA	2	8	1479327	1479334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_015222	ATA	2	6	1479354	1479359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_015222	TTTA	2	8	1479384	1479391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_015222	GTT	2	6	1479780	1479785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_015222	TTC	2	6	1479852	1479857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_015222	GT	3	6	1479917	1479922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_015222	TAA	2	6	1479942	1479947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_015222	AGTA	2	8	1479993	1480000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_015222	T	6	6	1480564	1480569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_015222	TTGA	2	8	1480611	1480618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_015222	T	6	6	1481196	1481201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_015222	TG	3	6	1481234	1481239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_015222	CTTTCT	2	12	1481252	1481263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_015222	ACA	2	6	1481269	1481274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_015222	GCC	2	6	1481294	1481299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4588	NC_015222	TTA	2	6	1481324	1481329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_015222	TGA	2	6	1481365	1481370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_015222	ATT	2	6	1481460	1481465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_015222	TTA	2	6	1481498	1481503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_015222	ACC	2	6	1481533	1481538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4593	NC_015222	AGTC	2	8	1481592	1481599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4594	NC_015222	TAT	2	6	1481602	1481607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_015222	CAA	2	6	1481617	1481622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_015222	CAAC	2	8	1481647	1481654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_015222	GAT	2	6	1481699	1481704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_015222	TGA	2	6	1481710	1481715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_015222	ATT	2	6	1481744	1481749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_015222	AATCG	2	10	1481750	1481759	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4601	NC_015222	ATA	2	6	1481787	1481792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_015222	GATT	2	8	1481795	1481802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_015222	GTG	2	6	1482273	1482278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_015222	AATT	2	8	1482320	1482327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_015222	AG	3	6	1482411	1482416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_015222	CAA	2	6	1483413	1483418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_015222	CCT	2	6	1483528	1483533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4608	NC_015222	TAA	2	6	1483538	1483543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_015222	A	6	6	1483542	1483547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_015222	AAT	2	6	1483561	1483566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_015222	AAG	2	6	1483607	1483612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_015222	TC	3	6	1483672	1483677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4613	NC_015222	TTA	2	6	1483708	1483713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_015222	TA	3	6	1484056	1484061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_015222	A	6	6	1484617	1484622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_015222	CTG	2	6	1484630	1484635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_015222	A	6	6	1485842	1485847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_015222	ATA	2	6	1485896	1485901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_015222	GAAT	2	8	1490540	1490547	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_015222	A	6	6	1491202	1491207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_015222	TTA	2	6	1491866	1491871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_015222	ATT	2	6	1491896	1491901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_015222	AAT	2	6	1491927	1491932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_015222	A	6	6	1492389	1492394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_015222	ATT	2	6	1492512	1492517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_015222	TA	3	6	1492526	1492531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_015222	GT	3	6	1492560	1492565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_015222	ATT	2	6	1492582	1492587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_015222	TGC	2	6	1495185	1495190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_015222	ACTG	2	8	1495213	1495220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4631	NC_015222	T	6	6	1495224	1495229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_015222	GTT	2	6	1495269	1495274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_015222	GA	3	6	1495287	1495292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4890	NC_015222	GGTGA	2	10	1577783	1577792	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4892	NC_015222	GAAA	2	8	1578930	1578937	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4893	NC_015222	T	6	6	1578972	1578977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4894	NC_015222	ATAGC	2	10	1579032	1579041	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4895	NC_015222	AAG	2	6	1579057	1579062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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