MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Neisseria lactamica 020-06 chromosome

Total Repeats: 7627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_014752	A	6	6	2177862	2177867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_014752	TGT	2	6	2177868	2177873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_014752	T	7	7	2177901	2177907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_014752	GCTTT	2	10	2177962	2177971	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7505	NC_014752	ATTT	2	8	2178012	2178019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_014752	CGG	2	6	2178114	2178119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_014752	CGG	2	6	2178139	2178144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7508	NC_014752	AAC	2	6	2178178	2178183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7509	NC_014752	GCA	2	6	2180119	2180124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7510	NC_014752	CCG	2	6	2184342	2184347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7511	NC_014752	GC	3	6	2184364	2184369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7512	NC_014752	CCG	2	6	2184401	2184406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7513	NC_014752	CGA	2	6	2184462	2184467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_014752	CAT	2	6	2184643	2184648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_014752	TGT	2	6	2184724	2184729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_014752	GGC	2	6	2184982	2184987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_014752	AT	3	6	2185130	2185135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_014752	TTAAAT	2	12	2185168	2185179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_014752	CGA	2	6	2185190	2185195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7520	NC_014752	A	6	6	2185265	2185270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_014752	TTGAA	2	10	2185349	2185358	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_014752	CCGC	2	8	2185375	2185382	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7523	NC_014752	CGT	2	6	2185397	2185402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_014752	A	6	6	2185446	2185451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_014752	CCG	3	9	2185454	2185462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7526	NC_014752	GAAA	2	8	2185487	2185494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_014752	TGC	2	6	2187190	2187195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_014752	AT	3	6	2187205	2187210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_014752	CGA	2	6	2187238	2187243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7530	NC_014752	TAAA	2	8	2187374	2187381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_014752	CGG	2	6	2187528	2187533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7532	NC_014752	TGC	2	6	2187642	2187647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_014752	AGC	2	6	2187651	2187656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7534	NC_014752	CGG	2	6	2187660	2187665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_014752	TCC	2	6	2187745	2187750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7536	NC_014752	CCCGT	2	10	2187785	2187794	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7537	NC_014752	GCG	2	6	2187797	2187802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7538	NC_014752	T	7	7	2189028	2189034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_014752	TA	3	6	2189986	2189991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_014752	AAC	2	6	2190024	2190029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7541	NC_014752	TCA	3	9	2190067	2190075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7542	NC_014752	T	7	7	2190090	2190096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_014752	TTG	2	6	2190115	2190120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_014752	ATGA	2	8	2190128	2190135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_014752	CCA	2	6	2190142	2190147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7546	NC_014752	AT	3	6	2190293	2190298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_014752	TA	3	6	2190318	2190323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_014752	TTA	2	6	2190359	2190364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_014752	TAA	2	6	2190377	2190382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_014752	AT	3	6	2190423	2190428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_014752	TTTC	2	8	2190434	2190441	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7552	NC_014752	TCT	2	6	2190473	2190478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_014752	AGAA	2	8	2190525	2190532	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_014752	GA	3	6	2190559	2190564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_014752	T	7	7	2190654	2190660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_014752	ATT	2	6	2190679	2190684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_014752	ATTT	2	8	2190694	2190701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_014752	ATC	2	6	2190710	2190715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_014752	AGT	2	6	2190717	2190722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_014752	TGT	3	9	2190730	2190738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_014752	CCG	2	6	2190791	2190796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7562	NC_014752	CTTT	2	8	2190822	2190829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7563	NC_014752	CTTT	2	8	2190841	2190848	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7564	NC_014752	ATT	2	6	2190870	2190875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_014752	T	6	6	2191824	2191829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_014752	CAAA	2	8	2191835	2191842	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7567	NC_014752	T	7	7	2191845	2191851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_014752	ATT	2	6	2191862	2191867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_014752	A	6	6	2194094	2194099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_014752	CTT	2	6	2194118	2194123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7571	NC_014752	ACC	2	6	2194145	2194150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7572	NC_014752	AC	4	8	2194173	2194180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7573	NC_014752	CTG	2	6	2194181	2194186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7574	NC_014752	AAC	2	6	2194249	2194254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_014752	AAAT	2	8	2194265	2194272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_014752	ATA	2	6	2194350	2194355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_014752	AAT	2	6	2194389	2194394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7578	NC_014752	AAGGC	2	10	2194452	2194461	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7579	NC_014752	TCCC	2	8	2194564	2194571	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7580	NC_014752	TTCT	2	8	2194582	2194589	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7581	NC_014752	ATT	2	6	2195172	2195177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7582	NC_014752	T	6	6	2195176	2195181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_014752	CAT	2	6	2196360	2196365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7584	NC_014752	AT	3	6	2197665	2197670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7585	NC_014752	CAAA	2	8	2197733	2197740	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7586	NC_014752	AT	3	6	2198105	2198110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7587	NC_014752	AAG	2	6	2198113	2198118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7588	NC_014752	GTC	2	6	2198135	2198140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7589	NC_014752	GAC	2	6	2198167	2198172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7590	NC_014752	GAC	2	6	2198804	2198809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7591	NC_014752	TAA	3	9	2198815	2198823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7592	NC_014752	GTC	2	6	2198825	2198830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7593	NC_014752	AAACC	2	10	2200585	2200594	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7594	NC_014752	ATTT	2	8	2200635	2200642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_014752	ATA	2	6	2200656	2200661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_014752	AGGA	2	8	2201741	2201748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_014752	TCA	2	6	2202410	2202415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7598	NC_014752	TAT	2	6	2202440	2202445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_014752	GATAA	2	10	2202482	2202491	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_014752	A	6	6	2202501	2202506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_014752	TGT	2	6	2203249	2203254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_014752	GTATT	2	10	2204397	2204406	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_014752	TTTG	2	8	2204451	2204458	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_014752	ATG	2	6	2204516	2204521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_014752	TGA	2	6	2204526	2204531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7606	NC_014752	GCC	2	6	2204534	2204539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7607	NC_014752	T	6	6	2204594	2204599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_014752	TTGAAG	2	12	2204611	2204622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7609	NC_014752	ACAA	2	8	2204704	2204711	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7610	NC_014752	A	7	7	2207451	2207457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_014752	CCGC	2	8	2207458	2207465	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7612	NC_014752	ACTT	2	8	2209517	2209524	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7613	NC_014752	TTA	2	6	2210594	2210599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_014752	CCCG	2	8	2211212	2211219	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7615	NC_014752	GCC	2	6	2211220	2211225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7616	NC_014752	TTAC	2	8	2211282	2211289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7617	NC_014752	CCT	2	6	2211368	2211373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7618	NC_014752	CA	3	6	2213282	2213287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7619	NC_014752	T	6	6	2213324	2213329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7620	NC_014752	TGG	2	6	2215868	2215873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7621	NC_014752	GCC	2	6	2215973	2215978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7622	NC_014752	A	7	7	2216031	2216037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_014752	TGG	2	6	2216069	2216074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_014752	GCT	2	6	2216117	2216122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7625	NC_014752	GCGG	2	8	2216193	2216200	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7626	NC_014752	TTA	2	6	2220510	2220515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_014752	T	6	6	2220579	2220584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.