MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosococcus watsoni C-113 plasmid pNWAT02

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014317	CAT	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014317	CTC	2	6	109	114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014317	GCC	2	6	122	127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014317	CGG	2	6	166	171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014317	GGC	2	6	179	184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014317	TGG	2	6	226	231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014317	CTGCG	2	10	251	260	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014317	CTT	2	6	339	344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014317	CCG	2	6	436	441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014317	CCG	2	6	456	461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014317	GCC	2	6	731	736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014317	CCG	2	6	742	747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_014317	CAA	2	6	762	767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014317	CGG	2	6	870	875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014317	GCCCG	2	10	1005	1014	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_014317	GCC	3	9	1022	1030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014317	CCA	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014317	CGC	2	6	1113	1118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_014317	G	6	6	1128	1133	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014317	G	6	6	1142	1147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014317	CGG	2	6	1156	1161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014317	GCC	2	6	1166	1171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014317	GTC	2	6	1177	1182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014317	GGC	2	6	1191	1196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014317	GCC	2	6	1273	1278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014317	ACCTC	2	10	1341	1350	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_014317	A	6	6	1386	1391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014317	T	6	6	1936	1941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014317	TCCA	2	8	1958	1965	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014317	T	7	7	1978	1984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014317	GCC	2	6	2400	2405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014317	T	6	6	2416	2421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014317	CGC	2	6	2442	2447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_014317	ATT	2	6	2469	2474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014317	CAAA	2	8	3169	3176	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014317	CGC	2	6	3230	3235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014317	GAG	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014317	ACC	2	6	3334	3339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014317	CAAG	2	8	3404	3411	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014317	GAT	2	6	3481	3486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014317	ACT	2	6	3565	3570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014317	CT	3	6	3569	3574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014317	T	6	6	3598	3603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014317	GGCG	2	8	3642	3649	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014317	A	6	6	3729	3734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014317	TCA	2	6	3742	3747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014317	GAG	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014317	G	6	6	3792	3797	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014317	G	6	6	3820	3825	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014317	GC	3	6	3887	3892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014317	CG	3	6	3955	3960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014317	A	6	6	3991	3996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014317	AAAT	2	8	4019	4026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014317	T	8	8	4040	4047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014317	TGCC	2	8	4071	4078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014317	CCTA	2	8	4095	4102	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014317	CCTA	2	8	4117	4124	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014317	TGCC	2	8	4137	4144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014317	CCTA	2	8	4161	4168	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014317	CTG	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.