MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosococcus watsonii C-113 chromosome

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014315	CACTAT	2	12	1663	1674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014315	TTGGCC	2	12	5382	5393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014315	GCCTGC	2	12	7436	7447	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014315	AACTAA	2	12	9101	9112	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014315	TGAAGA	2	12	63189	63200	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014315	TGGAAA	2	12	72865	72876	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014315	CGCCGG	2	12	77537	77548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014315	TTTAGT	2	12	103592	103603	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014315	CTATTG	2	12	105127	105138	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014315	GGCTGC	2	12	108646	108657	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014315	TTAAAT	2	12	151914	151925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014315	GCGATA	2	12	154594	154605	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014315	ATGGTA	2	12	154659	154670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014315	GGGCCT	2	12	288306	288317	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014315	AAGGGC	2	12	290551	290562	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014315	GTTAAC	2	12	311924	311935	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014315	TAGCTT	2	12	367394	367405	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014315	ACTGCT	2	12	375874	375885	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014315	TTTATT	2	12	451994	452005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014315	TTATGG	2	12	545020	545031	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014315	GCGAAG	2	12	545246	545257	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014315	TTGCGC	2	12	599121	599132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014315	GTGGAT	2	12	616227	616238	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014315	CTTCAG	2	12	616673	616684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014315	AGAGGA	2	12	623323	623334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014315	GGCATT	2	12	638750	638761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014315	ATTTAA	2	12	655748	655759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014315	AGTAAG	2	12	667859	667870	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014315	TTATTT	2	12	712179	712190	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014315	ATAAAA	2	12	765231	765242	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014315	GATAGA	2	12	801254	801265	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014315	ATTAGT	2	12	804552	804563	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014315	CAACCT	2	12	819447	819458	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014315	AATATA	2	12	842426	842437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014315	TAAAAG	2	12	887485	887496	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014315	CGCAAT	2	12	898999	899010	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014315	ATTGTT	2	12	904360	904371	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014315	GAGGTA	2	12	920464	920475	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014315	AATTAG	2	12	1032201	1032212	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014315	CACAAT	2	12	1055799	1055810	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014315	TTGAGA	2	12	1060821	1060832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014315	GTCATC	2	12	1067604	1067615	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014315	TATAAA	2	12	1094584	1094595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014315	GGTGAT	2	12	1121431	1121442	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014315	TTCATT	2	12	1126143	1126154	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014315	GTCATC	2	12	1143726	1143737	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014315	GGTTGG	2	12	1143900	1143911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014315	CAGAAT	2	12	1158108	1158119	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014315	GAAATA	2	12	1226552	1226563	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014315	GTTTTT	2	12	1283418	1283429	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014315	CGGAAG	2	12	1302299	1302310	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014315	GAGGCG	2	12	1351225	1351236	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014315	GATAAA	2	12	1352001	1352012	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014315	TTCTAT	2	12	1394732	1394743	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014315	GTGGCG	3	18	1401278	1401295	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014315	GAGTCG	2	12	1402450	1402461	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014315	AGGGTA	2	12	1418037	1418048	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014315	ACTCAA	2	12	1442046	1442057	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014315	AACCGG	2	12	1445342	1445353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014315	ATTTTA	2	12	1456836	1456847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014315	TTGAGT	2	12	1459486	1459497	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014315	TCCTGA	2	12	1476397	1476408	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014315	ACTTCC	2	12	1490390	1490401	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014315	TAAAAC	2	12	1530768	1530779	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014315	ATCCAG	2	12	1537403	1537414	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014315	TGGTAT	2	12	1542134	1542145	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014315	GGAAGA	2	12	1542434	1542445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014315	AGTAAA	2	12	1625191	1625202	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014315	TCCCCT	2	12	1638069	1638080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014315	TCACAT	2	12	1688550	1688561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014315	TTGATA	2	12	1711146	1711157	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014315	GTGATC	2	12	1718034	1718045	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014315	CAAACA	2	12	1736807	1736818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014315	GCGGTT	2	12	1745471	1745482	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014315	TCTGAC	2	12	1791954	1791965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014315	TAATTA	2	12	1846920	1846931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014315	CATTAT	2	12	1848514	1848525	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014315	ATGACA	2	12	1852770	1852781	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014315	ATGACG	2	12	1854475	1854486	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014315	TAGAAA	2	12	1884997	1885008	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014315	CGAACG	2	12	1924114	1924125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014315	ATTATA	2	12	1967410	1967421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014315	ACCGCT	2	12	1979025	1979036	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014315	TAGTAT	2	12	2032927	2032938	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014315	AGCCCT	2	12	2035144	2035155	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014315	AAGCCA	2	12	2047145	2047156	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014315	TAATTT	2	12	2047352	2047363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014315	AAGGAA	2	12	2051356	2051367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014315	TGCATT	2	12	2057812	2057823	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014315	AAGCGA	2	12	2068887	2068898	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014315	GATCTA	2	12	2081167	2081178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014315	CTAGCC	2	12	2083367	2083378	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014315	TTCCAT	2	12	2083761	2083772	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014315	TTATAT	2	12	2084301	2084312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014315	TAGATA	2	12	2149400	2149411	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014315	CAGAAA	2	12	2152788	2152799	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014315	AAACCA	2	12	2161047	2161058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014315	CTCTTT	2	12	2222807	2222818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014315	TAAAAT	2	12	2227055	2227066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014315	TTCTAG	2	12	2254107	2254118	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014315	TAACCA	2	12	2260964	2260975	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014315	ACACTT	2	12	2462908	2462919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014315	AAAATA	2	12	2483987	2483998	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014315	GCCGTT	2	12	2567557	2567568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014315	TTAATT	2	12	2598809	2598820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014315	CCATCC	2	12	2602128	2602139	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014315	GGCCGA	2	12	2603024	2603035	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014315	CCGGTA	2	12	2603808	2603819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014315	AAAAGA	2	12	2620638	2620649	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014315	CTTGGC	2	12	2621064	2621075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014315	GATAGC	2	12	2621805	2621816	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014315	CTGGAG	2	12	2625487	2625498	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014315	TTTCCG	2	12	2655087	2655098	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014315	TAGATT	2	12	2655606	2655617	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014315	CTGCCA	2	12	2660074	2660085	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014315	AGACGA	2	12	2666927	2666938	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014315	TTATGA	2	12	2685789	2685800	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014315	GCAAAG	2	12	2695806	2695817	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014315	GCTCAA	2	12	2738703	2738714	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014315	CGCAAG	2	12	2738959	2738970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014315	TCCTTA	2	12	2746399	2746410	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014315	AAATAG	2	12	2801685	2801696	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014315	TTAGAT	2	12	2837026	2837037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014315	ACCATC	2	12	2855795	2855806	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014315	TATTGC	2	12	2865937	2865948	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014315	AACTAG	2	12	2931692	2931703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014315	TGATAT	2	12	2967527	2967538	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014315	GCCCAT	2	12	2980616	2980627	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014315	TTTTAT	2	12	3011433	3011444	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014315	TCGTTT	2	12	3013704	3013715	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014315	GATAAT	2	12	3013778	3013789	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014315	GACTTA	2	12	3014609	3014620	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014315	TACCGC	2	12	3022532	3022543	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014315	ATTTCC	2	12	3031729	3031740	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014315	TATGAA	2	12	3036675	3036686	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014315	TATAGA	2	12	3043067	3043078	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014315	CTTTTT	2	12	3043500	3043511	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_014315	AGTCGT	2	12	3064288	3064299	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_014315	CAAGGT	2	12	3065486	3065497	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_014315	TAAAAA	2	12	3088623	3088634	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014315	TAAATC	2	12	3111182	3111193	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_014315	CTTCTC	4	24	3114622	3114645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014315	GTTCTC	2	12	3115561	3115572	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014315	AATCCC	2	12	3129452	3129463	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014315	GCGAAG	2	12	3150880	3150891	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_014315	GTTTGC	2	12	3168620	3168631	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_014315	TTTTGA	2	12	3190827	3190838	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014315	TGCTAA	2	12	3233615	3233626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_014315	CTTAAT	2	12	3234632	3234643	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_014315	TACCCA	2	12	3236568	3236579	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014315	CCAACC	2	12	3247454	3247465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_014315	GCGCAG	2	12	3271634	3271645	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014315	TCAATA	2	12	3288817	3288828	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_014315	GCGGTA	2	12	3303427	3303438	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.